TBK2018-seminar

Temelji biokemije- seminar

Seminarje vodi prof. dr. Brigita Lenarčič. Seminarji so obvezni.

Ocena seminarjev (6-10) predstavlja enako število odstotkov, ki se prišteje h končni pisni oceni izpita. Stran na strežniku s seminarskimi nalogami je zaščitena. Uporabniško ime je: tbk, password pa: samozame## "##" sta dve številki, ki ju izveste na predavanjih. Tudi za urejanje Wiki strani potrebujete geslo, ki se od zgornjega razlikuje. Postopek pridobitve Wiki uporabniškega imena in gesla je opisan tukaj.

Seznam seminarjev

Ime in priimek	Naslov seminarja	Povezava	Rok za oddajo	Rok za recenzijo	Datum predstavitve	Recenzent 1	Recenzent 2	Recenzent 3
Anna Scott	Moj naslov v slovenščini	http://www.bioscirep.org/content/36/1/e00291.long	12.12.	12.12.	12.12.	r1	r2	r3
Nina Mezgec Mrzlikar	Regulacija gena DISC-1 kot potencialnega zdravila za shizofrenijo	https://www.sciencedaily.com/releases/2017/01/170105144339.htm	28.02.	03.03.	06.03.	Vesna Dimitrovski	Urban Hribar	Emilija Bogatinova
Tina Turel	Povezanost retrovirusov z razvojem možganov	https://www.sciencedaily.com/releases/2017/01/170112110840.htm	28.02.	03.03.	06.03.	Katja Doberšek	Uroš Prešern	Nika Zaveršek
Sonja Gabrijelčič	Ribosomske mutacije spodbujajo razvoj odpornosti proti antibiotikom v okolju z več zdravilnimi učinkovinami	https://www.sciencedaily.com/releases/2017/02/170221110808.htm https://elifesciences.org/content/6/e20420	28.02.	03.03.	06.03.	Mariša Cvitanič	Špela Supej	Tanja Zupan
Patrik Levačić	Prehrambni aditivi v sladkarijah ter žvečilnih gumijih lahko spremenijo funkcionalnost in strukturo prebavnih celic	https://www.sciencedaily.com/releases/2017/02/170217012450.htm	28.02.	03.03.	06.03.	Ajda Krč	Lea Knez	Andrej Race
Nika Goršek	Nove študije razkrivajo delovanje molekulske črpalke, ki izloča zdravila proti raku	https://www.sciencedaily.com/releases/2017/02/170224160629.htm	07.03.	10.03.	13.03.	Adela Šajn	Maja Jankovič	Urška Košir
Dragana Savković	Stopnja preživetja evkariotskih celic po elektroforezni nano-injekciji	https://www.sciencedaily.com/releases/2017/03/170301105437.htm	07.03.	10.03.	13.03.	Milica Janković	Luka Fratina	Martin Špendl
Hana Hiršman			07.03.	10.03.	13.03.	Ajda Godec	Anja Tavčar	Nika Mikulič Vernik
Daria Latysheva	Mehanski raztezek sproži hitro delitev epitelijskih celic	https://www.sciencedaily.com/releases/2017/02/170215131543.htm	07.03.	10.03.	13.03.	Andreja Habič	Maja Vrabec	Ines Medved
Urška Zagorc	Proteini, zgodnje opozorilo sladkorne bolezni tipa 1	https://www.sciencedaily.com/releases/2016/11/161107112428.htm	14.03.	17.03.	20.03.	Nina Mezgec Mrzlikar	Vesna Dimitrovski	Urban Hribar
Anja Černe	Učinek farmakološkega askorbata na rakave celice	https://www.sciencedaily.com/releases/2017/01/170109134014.htm	14.03.	17.03.	20.03.	Tina Turel	Katja Doberšek	Uroš Prešern
Barbara Slapnik	Holesterol v celični membrani	https://www.sciencedaily.com/releases/2017/01/170117163039.htm	14.03.	17.03.	20.03.	Sonja Gabrijelčič	Mariša Cvitanič	Špela Supej
Jerneja Nimac	S CRISPR/Cas9 nad x-vezavno obliko kronične granulomatozne bolezni	https://www.sciencedaily.com/releases/2017/01/170112110734.htm	14.03.	17.03.	20.03.	Patrik Levačić	Ajda Krč	Lea Knez
Gašper Anton Komatar		https://www.sciencedaily.com/releases/2017/03/170309132308.htm	21.03.	24.03.	27.03.	Nika Goršek	Adela Šajn	Maja Jankovič
Nadja Škafar	Dostava protitumorskih zdravil s pomočjo makrofagov in biorazgradljivih nanodelcev	https://www.sciencedaily.com/releases/2017/01/170104154408.htm	21.03.	24.03.	27.03.	Dragana Savković	Milica Janković	Luka Fratina
Anže Jenko	Koriščenje kemiluminiscence dioksietanovih sond za prikazovanje celice	https://www.sciencedaily.com/releases/2017/03/170308081051.htm	21.03.	24.03.	27.03.	Hana Hiršman	Ajda Godec	Anja Tavčar
Špela Deučman	Raziskovanje vzrokov kronične zavrnitve presajenih pljuč	https://www.sciencedaily.com/releases/2017/03/170301105426.htm	21.03.	24.03.	27.03.	Daria Latysheva	Andreja Habič	Maja Vrabec
Luka Gregorič	Merjenje količine urina v plavalnih bazenih s pomočjo merjenja koncentracije umetnih sladil	https://www.sciencedaily.com/releases/2017/03/170301084913.htm	28.03.	31.03.	03.04.	Urška Zagorc	Nina Mezgec Mrzlikar	Vesna Dimitrovski
Jana Kotnik	Sintetični membranski receptorji	https://www.sciencedaily.com/releases/2017/03/170306114231.htm	28.03.	31.03.	03.04.	Anja Černe	Tina Turel	Katja Doberšek
Andrej Špenko	Nova tehnika za boljšo regeneracijo kostnega tkiva	https://www.sciencedaily.com/releases/2016/12/161220093946.htm	28.03.	31.03.	03.04.	Barbara Slapnik	Sonja Gabrijelčič	Mariša Cvitanič
Ana Maklin	Termična stabilnost proteinov	https://www.sciencedaily.com/releases/2017/02/170228131046.htm	28.03.	31.03.	03.04.	Jerneja Nimac	Patrik Levačić	Ajda Krč
Emilija Bogatinova	NO3-anioni lahko delujejo kot Lewisovo kislino v tvrdnem stanju	https://www.sciencedaily.com/releases/2017/02/170222131802.htm	04.04.	07.04.	10.04.	Gašper Anton Komatar	Nika Goršek	Adela Šajn
Nika Zaveršek	Bakterije lahko s pomočjo posebnih sintetičnih molekul spremenimo v električne generatorje	https://www.sciencedaily.com/releases/2017/02/170209133509.htm	04.04.	07.04.	10.04.	Nadja Škafar	Dragana Savković	Milica Janković
Tanja Zupan	Razlike v funkcionalni povezavi možganov v mirujočem stanju med športniki in ne športniki	https://www.sciencedaily.com/releases/2016/12/161214151637.htm	04.04.	07.04.	10.04.	Anže Jenko	Hana Hiršman	Ajda Godec
Andrej Race	Deficit Glukoze-6-fosfat-dehidrogenaze	https://www.sciencedaily.com/releases/2016/07/160726094319.htm	04.04.	07.04.	10.04.	Špela Deučman	Daria Latysheva	Andreja Habič
Urška Košir			18.04.	21.04.	24.04.	Luka Gregorič	Urška Zagorc	Nina Mezgec Mrzlikar
Martin Špendl	Nanografen-renijev kompleks za selektivno redukcijo ogljikovega dioksida	https://www.sciencedaily.com/releases/2017/03/170308135342.htm	18.04.	21.04.	24.04.	Jana Kotnik	Anja Černe	Tina Turel
Nika Mikulič Vernik	Onkolitični virusi, ki selektivno napadajo rakaste celice	https://www.sciencedaily.com/releases/2017/03/170316112147.htm	18.04.	21.04.	24.04.	Andrej Špenko	Barbara Slapnik	Sonja Gabrijelčič
Ines Medved	Kako lahko z zmanjšanim vnosom hrane upočasnimo proces staranja	https://www.sciencedaily.com/releases/2017/02/170213151306.htm	18.04.	21.04.	24.04.	Ana Maklin	Jerneja Nimac	Patrik Levačić
Urban Hribar	Manipulacija encimov FAS in biogoriva	https://www.sciencedaily.com/releases/2017/03/170309120519.htm	02.05.	05.05.	08.05.	Emilija Bogatinova	Gašper Anton Komatar	Nika Goršek
Uroš Prešern	Nukleaza, ki povzroči partanatos oziroma od PARP-1 odvisno celično smrt	https://www.sciencedaily.com/releases/2016/10/161006143602.htm	02.05.	05.05.	08.05.	Nika Zaveršek	Nadja Škafar	Dragana Savković
Špela Supej	Nov način kontroliranja celične biologije s pomočjo svetlobe	https://www.sciencedaily.com/releases/2017/03/170315125623.htm	02.05.	05.05.	08.05.	Tanja Zupan	Anže Jenko	Hana Hiršman
Lea Knez	Hemoglobin Kirklareli	https://www.sciencedaily.com/releases/2017/02/170217012518.htm	02.05.	05.05.	08.05.	Andrej Race	Špela Deučman	Daria Latysheva
Maja Jankovič			09.05.	12.05.	15.05.	Urška Košir	Luka Gregorič	Urška Zagorc
Luka Fratina	Visokoresolucijsko 3D slikanje živih celic s fononi podoptičnih valovnih dolžin	https://www.sciencedaily.com/releases/2016/12/161221111327.htm	09.05.	12.05.	15.05.	Martin Špendl	Jana Kotnik	Anja Černe
Anja Tavčar	Selenomabi - obstojna in učinkovita protitelesa, konjugirana s citostatiki	https://www.sciencedaily.com/releases/2017/03/170316151821.htm	09.05.	12.05.	15.05.	Nika Mikulič Vernik	Andrej Špenko	Barbara Slapnik
Maja Vrabec	Komunikacija med virusi usmerja odločitev za litični ali lizogeni cikel	https://www.sciencedaily.com/releases/2017/01/170119163345.htm	09.05.	12.05.	15.05.	Ines Medved	Ana Maklin	Jerneja Nimac
Vesna Dimitrovski	Sintetična pajkova svila	https://www.sciencedaily.com/releases/2017/01/170104103533.htm	16.05.	19.05.	22.05.	Urban Hribar	Emilija Bogatinova	Gašper Anton Komatar
Katja Doberšek	Sindrom kimanja kot avtoimuna reakcija na parazita Onchocerca volvulus	https://www.sciencedaily.com/releases/2017/02/170215145949.htm	16.05.	19.05.	22.05.	Uroš Prešern	Nika Zaveršek	Nadja Škafar
Mariša Cvitanič			16.05.	19.05.	22.05.	Špela Supej	Tanja Zupan	Anže Jenko
Ajda Krč	Ubikvitin-protein ligaza CHIP z regulacijo razpada inzulinskega receptorja in proteostaze razkriva možne razloge za staranje organizma	https://www.sciencedaily.com/releases/2017/04/170421103731.htm	16.05.	19.05.	22.05.	Lea Knez	Andrej Race	Špela Deučman
Adela Šajn			23.05.	26.05.	29.05.	Maja Jankovič	Urška Košir	Luka Gregorič
Milica Janković	Potencialna terapija za ozdravitev Huntingtonove bolezni	https://www.sciencedaily.com/releases/2016/08/160816151900.htm	23.05.	26.05.	29.05.	Luka Fratina	Martin Špendl	Jana Kotnik
Ajda Godec	Molekularna podlaga za širok spekter izbire substratov peptid preniltransferaze	https://www.sciencedaily.com/releases/2016/11/161121174639.htm	23.05.	26.05.	29.05.	Anja Tavčar	Nika Mikulič Vernik	Andrej Špenko
Andreja Habič	Odsotnost Efr3a v možganskih celicah spodbudi nevrogenezo v odraslem hipokampusu preko BDNF signalne poti	https://www.sciencedaily.com/releases/2017/05/170511113516.htm	23.05.	26.05.	29.05.	Maja Vrabec	Ines Medved	Ana Maklin

Naloga

• samostojno pripraviti seminar, katerega tema je novica iz področja biokemije na portalu ScienceDaily, ki je bila objavljena kasneje kot 1. avgusta 2016. Osnova za seminar naj bo znanstveni članek, ki je podlaga za to novico. Poleg tega članka za seminar uporabite še najmanj pet drugih virov, od teh vsaj še dva druga znanstvena članka, ki se navezujeta na to vsebino.
• članke na temo lahko iščete v PubMed povezavi tukaj
• naslov izbrane teme in povezavo do novice vpišite v tabelo seminarjev takoj ko ste si izbrali temo, najkasneje pa en teden pred rokom za oddajo
• Povzetek seminarja opišete na wikiju v približno 200 besedah - najkasneje do dne ko morate oddati seminar recenzentom.
• Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
• Seminar pripravite v obliki seminarske naloge (pisava Cambria, font 11, enojni razmak, 2,5 cm robovi; tekst naj obsega okoli 1000 besed), vsebuje naj 1-2 sliki. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko. Vse uporabljene vire citirajte v tekstu, kot npr. (Nobel, 2010), na koncu pa navedite točen seznam literature, kot je opisano spodaj!
• Celotni seminar naj obsega 2 strani A4 formata (po možnosti dvostransko tiskanje).
• Seminar oddajte do datuma oddaje, ki je naveden v tabeli v elektronski obliki z uporabo tega obrazca.
• vsi seminarji so v elektronski obliki dostopni tukaj.
• Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke in podajo oceno pisnega dela, v predpisanem formatu elektronskega obrazca na internetu.
• Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 12 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni. Prvi recenzent vodi predstavitve in razpravo ter skrbi za to, da vse poteka v zastavljenih časovnih okvirih.
• Predstavitvi sledi razprava do 8 minut. Sledijo vprašanja prisotnih, recenzenti postavijo vsak vsaj dve vprašanji in na koncu podajo oceno predstavitve.
• En dan pred predstavitvijo na strežnik oddajte tudi končno verzijo. Na dan predstavitve morate oddati tudi končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu.
• Seminarska naloga in povzetek na wikiju morajo biti v slovenskem jeziku!

Imena datotek

Prosim vas, da vse datoteke, ki jih pošiljate poimenujete po spodnjih pravilih. Ne uporabljajte ČŽŠčžš! Poslati morate naslednje datoteke:

• TBK_2017_Priimek_Ime.doc(x) za seminar, npr. TBK_2017_Guncar_Gregor.docx
• TBK_2017_Priimek_ime_final.doc(x) za končno verzijo seminarja
• TBK_2017_Priimek_Ime_rec_Priimek2.doc(x) za recenzijo, kjer je Priimek2 priimek recenzenta, npr. TBK_2017_Guncar_Gregor_rec_Scott.docx (če se pišete Scott in odajate recenzijo za seminar, ki ga je napisal Gunčar)
• TBK_2017_Priimek_Ime.ppt(x) za prezentacijo, npr TBK_2017_Guncar_Gregor.pptx
• TBK_2017_Priimek_Ime_clanek.pdf za datoteko PDF, ki vsebuje izvirni članek, npr. TBK_2017_Guncar_Gregor_clanek.pdf

Ocenjevanje seminarjev

Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo [recenzentsko poročilo] na spletu.

Mnenje o predstavitvi

Vsak posameznik mora oceniti seminar tako, da odda svoje mnenje najkasneje v enem tednu po predstavitvi. Kdor na seminarju ni bil prisoten, mnenja ne sme oddati.

Urejanje spletnih strani na wikiju

Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.

Faktor vpliva

Faktor vpliva (angl. impact factor) neke revije pove, kolikokrat so bili v poprečju citirani članki v tej reviji v dveh letih skupaj pred objavo tega faktorja. Faktorje vpliva za posamezno revijo lahko najdete v COBISS-u. V polje "Naslov revije" vnesite ime revije za katero želite izvedeti faktor vpliva in pritisnite na gumb POIŠČI. V skrajnem desnem stolpcu se bodo izpisali faktorji vpliva za revije, ki ustrezajo vašim iskalnim kriterijem. Zadetkov za posamezno revijo je več zato, ker so navedeni faktorji vpliva za posamezno leto. Za tekoče leto faktorji vpliva še niso objavljeni, zato se orientirajte po faktorjih vpliva zadnjih par let. Če faktorja vpliva za vašo izbrano revijo ne najdete v bazi COBISS, potem izberite članek iz kakšne druge revije.

==Citiranje virov==Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se v seminarju držite ene same.Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati.Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.
Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.). Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue C. et al. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, letn. 317, str. 632-638.Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)
V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne).Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.