BIO2 Seminar 2021
Biokemijski seminar
doc. dr. Gregor Gunčar, K2.022
Seznam seminarjev
priimek, ime | poglavje | naslov seminarja | recenzent 1 | recenzent 2 | datum oddaje | datum recenzije | datum predstavitve |
Valte, David | 12 | Jedrni hormonski receptorji in izražanje genov | Mitkov, Kostadin | Brdnik, Nuša | 29/10/21 | 01/11/21 | 03/11/21 |
Kolar, Alliana | 12 | Pomen upravljanja z agonisti, antagonisti in signalnimi modulatorji receptorjev abscizinske kisline (ABA) v agronomiji | Vukšinić, Ivana | Premrl, Petja | 29/10/21 | 01/11/21 | 03/11/21 |
Glavnik, Hana | 12 | S-glutationilacija proteinov kot globalni inhibitor celičnega metabolizma za zmanjšanje občutljivosti signalov vodikovega peroksida | Kovač, Ela | Kavčič, Ema | 29/10/21 | 01/11/21 | 03/11/21 |
Štefan, Urša | 12 | Signalizacija STING - obseg delovanja in povezava z rakavimi obolenji | Vujović, Nataša | Zajec, Tina | 29/10/21 | 01/11/21 | 03/11/21 |
Butara, Tinkara | 12 | Transmembranska signalizacija v bakterijskih kemoreceptorjih | Sotlar, Špela | Žnidar, Žan | 29/10/21 | 01/11/21 | 03/11/21 |
Špehar, Pia | 12 | Integrini in njihova vloga pri vezikularnem transportu | Trošt, Pia | Rus, Metka | 05/11/21 | 08/11/21 | 10/11/21 |
Urh, Tina | 12 | Nevrotransmiterji, agonisti in antagonisti kot tarča zdravljenja | Maučec, Ana | Loborec, Mark | 05/11/21 | 08/11/21 | 10/11/21 |
Rotar, Andraž | 12 | Vloga signalne poti JAK/STAT in njeni inhibitorji pri človeških boleznih | Priveršek, Maj | Kastelic, Ana | 05/11/21 | 08/11/21 | 10/11/21 |
Starc, Gaja | 12 | Medsebojni vpliv vodikovega sulfida in drugih signalnih molekul pri uravnavanju signaliziranja celic zapiralk in odzivu na abiotski oziroma biotski stres | Spruk, Teja | Možina, Gašper | 05/11/21 | 08/11/21 | 10/11/21 |
Resnik, Katja | 12 | Signalna omrežja, ki povzročajo raka | Deutsch, Maja | Sotlar, Pia | 05/11/21 | 08/11/21 | 10/11/21 |
Bohte, Janja | 14-15 | Vloga in regulacija aerobne glikolize pri hepatocelularnem karcinomu | Valte, David | Mitkov, Kostadin | 12/11/21 | 15/11/21 | 17/11/21 |
Miklošič, Maja | 14-15 | ni opravila | Kolar, Alliana | Vukšinić, Ivana | 12/11/21 | 15/11/21 | 17/11/21 |
Kovačić, Marko | 14-15 | Vloga citokinov poddružine IL-1 pri regulaciji glikolize in njihov vpliv na bolezni, povezane z glikolizo | Glavnik, Hana | Kovač, Ela | 12/11/21 | 15/11/21 | 17/11/21 |
Kolbl, Karidia | 14-15 | Metabolizem možganskega glikogena; povezava z motnjami spanja in glavobolom | Štefan, Urša | Vujović, Nataša | 12/11/21 | 15/11/21 | 17/11/21 |
Kos Thaler, Nuša | 14-15 | Motnje metabolizma glikogena in njihove posledice | Butara, Tinkara | Sotlar, Špela | 12/11/21 | 15/11/21 | 17/11/21 |
Ažbe, Klara | 16 | Vpliv metabolitov Krebsovega cikla na fiziologijo in bolezni | Špehar, Pia | Trošt, Pia | 19/11/21 | 22/11/21 | 24/11/21 |
Jerič, Sara | 16 | Vpliv intermediatov Krebsovega cikla na metiliranje histonov in DNA ter posledično na proces staranja | Urh, Tina | Maučec, Ana | 19/11/21 | 22/11/21 | 24/11/21 |
Mencin, Pia | 16 | Akonitaza in njena vloga v celici | Rotar, Andraž | Priveršek, Maj | 19/11/21 | 22/11/21 | 24/11/21 |
Weingerl, Zarja | 16 | Sukcinat in njegova vloga v metabolizmu | Starc, Gaja | Spruk, Teja | 19/11/21 | 22/11/21 | 24/11/21 |
Kartal, Ena | 16 | Metabolizem lipoične kisline in mitohondrijska redoks regulacija | Resnik, Katja | Deutsch, Maja | 19/11/21 | 22/11/21 | 24/11/21 |
Struna, Gašper | 17 | Bohte, Janja | Valte, David | 26/11/21 | 29/11/21 | 01/12/21 | |
Špenko, Andrej | 17 | Miklošič, Maja | Kolar, Alliana | 26/11/21 | 29/11/21 | 01/12/21 | |
Zevnik, Urša | 17 | Genetske napake mitohondrijske oksidacije maščobnih kislin in karnitinskega transporta | Kovačić, Marko | Glavnik, Hana | 26/11/21 | 29/11/21 | 01/12/21 |
Peternel, Neža | 17 | Uravnavanje oksidacije maščobnih kislin s prehrano in telesno vadbo | Kolbl, Karidia | Štefan, Urša | 26/11/21 | 29/11/21 | 01/12/21 |
Vidmar, Nik | 17 | Delovanje in pomen ketonskih telesc | Kos Thaler, Nuša | Butara, Tinkara | 26/11/21 | 29/11/21 | 01/12/21 |
Trebušak, Jan | 18 | Vloga karbamoil fosfat sintetaze | Ažbe, Klara | Špehar, Pia | 03/12/21 | 06/12/21 | 08/12/21 |
Kores, Lana | 18 | Urinska bolezen javorjevega sirupa (MSUD) | Jerič, Sara | Urh, Tina | 03/12/21 | 06/12/21 | 08/12/21 |
Razdevšek, Miha | 18 | Motnje katabolizma glicina | Mencin, Pia | Rotar, Andraž | 03/12/21 | 06/12/21 | 08/12/21 |
Javeršek, Tina | 18 | Nedavni napredek pri zdravljenju hiperamoniemije | Weingerl, Zarja | Starc, Gaja | 03/12/21 | 06/12/21 | 08/12/21 |
Kočman, Klara | 18 | Kartal, Ena | Resnik, Katja | 03/12/21 | 06/12/21 | 08/12/21 | |
Jošt, Lev | 19 | Struna, Gašper | Bohte, Janja | 10/12/21 | 13/12/21 | 15/12/21 | |
Razboršek, Klara | 19 | Regulacija apoptoze v zdravju in bolezni: uravnoteženo delovanje BCL-2 proteinov | Špenko, Andrej | Miklošič, Maja | 10/12/21 | 13/12/21 | 15/12/21 |
Rapuš, Špela | 19 | Zevnik, Urša | Kovačić, Marko | 10/12/21 | 13/12/21 | 15/12/21 | |
Mencigar, Maša | 19 | Reaktivne kisikove zvrsti in njihova vloga pri rakavih obolenjih | Peternel, Neža | Kolbl, Karidia | 10/12/21 | 13/12/21 | 15/12/21 |
Ivošević, Vanja*gg | 19 | Vidmar, Nik | Kos Thaler, Nuša | 10/12/21 | 13/12/21 | 15/12/21 | |
Kogovšek, Jan | 20 | Karbonska anhidraza in molekularna evolucija C4 fotosinteze | Trebušak, Jan | Ažbe, Klara | |||
Brdnik, Nuša | 20 | Mehanizmi šaperonov encima Rubisco | Kores, Lana | Jerič, Sara | |||
Premrl, Petja | 20 | Razdevšek, Miha | Mencin, Pia | ||||
Kavčič, Ema | 20 | Zaloga ogljika in regulacija sinteze celične stene | Javeršek, Tina | Weingerl, Zarja | |||
Zajec, Tina | 20 | Morski organizmi - načini avtotrofne fiksacije ogljika razen Calvinovega cikla | Kočman, Klara | Kartal, Ena | |||
Žnidar, Žan | 21 | Jošt, Lev | Struna, Gašper | ||||
Rus, Metka | 21 | Razboršek, Klara | Špenko, Andrej | ||||
Loborec, Mark | 21 | Rapuš, Špela | Zevnik, Urša | ||||
Kastelic, Ana | 21 | Mencigar, Maša | Peternel, Neža | ||||
Možina, Gašper | 21 | Ivošević, Vanja | Vidmar, Nik | ||||
Sotlar, Pia | 22 | Kogovšek, Jan | Trebušak, Jan | ||||
Mitkov, Kostadin | 22 | Brdnik, Nuša | Kores, Lana | ||||
Vukšinić, Ivana | 22 | Vloga bilirubina kot signalne molekule | Premrl, Petja | Razdevšek, Miha | |||
Kovač, Ela | 22 | Aminokislinska regulacija skeletnih mišic | Kavčič, Ema | Javeršek, Tina | |||
Vujović, Nataša | 22 | Zajec, Tina | Kočman, Klara | ||||
Sotlar, Špela | 23 | Žnidar, Žan | Jošt, Lev | ||||
Trošt, Pia | 23 | Rus, Metka | Razboršek, Klara | ||||
Maučec, Ana | 23 | Vloga tiroidnih hormonov v kraniofacialnem razvoju | Loborec, Mark | Rapuš, Špela | |||
Priveršek, Maj | 23 | Kastelic, Ana | Mencigar, Maša | ||||
Spruk, Teja | 23 | Možina, Gašper | Ivošević, Vanja | ||||
Deutsch, Maja | 23 | Sotlar, Pia | Kogovšek, Jan |
- številka v okencu za temo pomeni poglavje v Lehningerju, v katerega naj izbrana tema spada
Razporeditev je začasna in se lahko še spremeni, načeloma pa se termini do vključno 18. poglavja ne bodo spreminjali. Prosim, da mi sporočite morebitne napake ali če vas nisem razporedil.
Gradivo za predavanja
Gradivo za predavanja in seminarje najdete na http://bio.ijs.si/~zajec/bio2/ username: bio2 password: samozame
Naloga
Vaša naloga za seminar je:
Samostojno pripraviti seminar o seminarski temi, ki vam je bila dodeljena. Za osnovo morate vzeti pregledni članek iz revije, ki ima faktor vpliva nad 5 (npr. TIBS. Poiskati morate še vsaj tri znanstvene članke, ki se nanašajo na opisano temo, in jih uporabiti kot podlago za seminarsko nalogo! Članki so dostopni tukaj.
Za pripravo seminarja velja naslednje:
- Povzetek seminarja opišete na wikiju v 200 besedah (+- dvajset besed) - najkasneje do dne, ko morate oddati seminar recenzentom.
- Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
- Seminar pripravite v obliki seminarske naloge na ~5–12 straneh A4 (pisava 12, enojni razmak, 2,5 cm robovi). Obseg seminarja naj bo 2700 do 3000 besed , a ne več kot 3500 besed. Seminarska naloga mora vsebovati najmanj tri slike, bolje več. Eno sliko morate narisati sami in to pod sliko posebej označiti. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko.
- Seminar oddajte do datuma oddaje, ki je naveden v tabeli, v elektronski obliki z uporabo tega obrazca.
- Vsi seminarji so v elektronski obliki dostopni tukaj.
- Recenzenti do dneva, določenega v tabeli, določijo popravke (v elektronski obliki) in podajo oceno pisnega dela. Popravljen seminar oddajte z uporabo tega obrazca.
- Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 20–25 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni.
- Predstavitvi sledi razprava. Recenzenti podajo oceno predstavitve in postavijo najmanj dve vprašanji. Vsi ostali morajo postaviti še dve dodatni vprašanji v okviru celega seminarskega obdobja. Vprašanja, ki ste jih postavili, vpišite na tukaj.
- Na dan predstavitve morate docentu še pred predstavitvijo oddati končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu, elektronsko verzijo seminarja in predstavitev pa oddati na strežnik na dan predstavitve do polnoči.
- Seminarska naloga in povzetek morajo biti v slovenskem jeziku, razen za študente, katerih materni jezik ni slovenščina. Ti lahko oddajo seminar v angleškem jeziku.
Imena datotek
Prosim vas, da vse datoteke, ki mi jih pošiljate, poimenujete po naslednjem receptu:
- 312_BIO_Priimek_Ime.docx za seminar, npr. 312_BIO_Guncar_Gregor.docx
- 312_BIO_Priimek_ime_final.docx za končno verzijo seminarja
- 312_BIO_Priimek_Ime_rec_Priimek2.docx za recenzijo, kjer je Priimek2 priimek recenzenta, npr. 312_BIO_Guncar_Gregor_rec_Scott.docx (če se pišete Scott in odajate recenzijo za seminar, ki ga je napisal Gunčar)
- 312_BIO_Priimek_Ime.pptx za prezentacijo, npr 312_BIO_Guncar_Gregor.pptx
- 312_BIO_Priimek_ime_poprava.doc(x) za popravljeno končno verzijo seminarja, če so popravki manjši
Ocenjevanje seminarjev
Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo recenzentsko poročilo na spletu. Recenzentsko poročilo morate oddati najkasneje do 21:00, en dan pred predstavitvijo seminarja.
Mnenje o predstavitvi
Vsak posameznik odda svoje mnenje o predstavitvi takoj po predstavitvi z online glasovanjem.
Urejanje spletnih strani na wikiju
Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje ... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.
Citiranje virov
Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se držite ene same. V seminarskih nalogah in diplomskih nalogah FKKT uprabljajte shemo citiranja, ki je pobarvana zeleno.
Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati.
Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.
Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.).
Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue, C., Glass, J. I., Alperovich, N., Pieper, R., Parmar, P. P., Hutchison III, C. A., Smith, H. O. in Venter, J. C.
Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, 317, str. 632-638.
Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.
Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)
V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne). Navesti morate tudi vse avtorje dela, razen v primeru, ko jih je 10 ali več. Takrat navedite le prvih devet, za ostale pa uporabite okrajšavo in sod. (in sodelavci). Pred zadnjim avtorjem naj bo vedno besedica "in".
Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.