BIO2 Seminar 2012

Novice za študente

Razpored izpitnih rokov in kolokvijev ter nekaterih kolokvijev iz vaj

Biokemijski seminar

Seminarje vodi doc. dr. Gregor Gunčar in so na urniku vsak petek od 9:00 do 12:00.

Ocena seminarjev predstavlja 30% končne ocene in vsebuje vse točke, ki jih študent/ka lahko zbere pri seminarju in ostalih dejavnostih, ki niso del pisnega izpita.

Seznam seminarjev

Ime Priimek	Tema*	Naslov seminarja	Recenzent 1	Recenzent 2	Recenzent 3	Datum oddaje	Datum recenzije	Datum predstavitve
Erik Kristian Janežič	12	Hippo signalna pot in matične celice	Filip Mihalič	Matic Kovačič	Jernej Pušnik	19.10.2012	23.10.2012	26.10.2012
Dejan Marjanovič	12	Vpliv in delovanje vimentina v celični signalizaciji in pomen poznavanja teh mehanizmov	Samo Zakotnik	Zala Gluhić	Rok Razpotnik	19.10.2012	23.10.2012	26.10.2012
Griša Prinčič	12	Vpliv T3SS sekretov na odziv gostiteljske celice	Mirjana Malnar	Bojana Lazović	Ajda Rojc	19.10.2012	23.10.2012	26.10.2012
Maja Kostanjevec	14	Mehanizmi zaznavanja glukoze v evkariontskih celicah	Sara Lorbek	Nastja Pirman	Tomaž Rozmarič	26.10.2012	05.11.2012	09.11.2012
Julija Mazej	14	Metabolizem glukoze v živčnih celicah	Ellen Malovrh	Špela Tomaž	Ana Kunšek	26.10.2012	05.11.2012	09.11.2012
Estera Merljak	14	Vloga PKM2 v rakavih celicah	Suzana Semič	Monika Biasizzo	Janez Meden	26.10.2012	05.11.2012	09.11.2012
Jernej Pušnik	15	Uravnavanje metabolnih poti z acetilacijo proteinov	Katarina Tolar	Jakob Gašper Lavrenčič	Ana Cirnski	05.11.2012	09.11.2012	16.11.2012
Rok Razpotnik	15	Metabolizem rakastih celic in njegova regulacija	Aleksander Benčič	Barbara Dušak	Erik Mršnik	05.11.2012	09.11.2012	16.11.2012
Ajda Rojc	15	Metabolizem skeletnih mišic	Ana Grom	Matej Vrhovnik	Katja Leben	05.11.2012	09.11.2012	16.11.2012
Tomaž Rozmarič	16	Crabtree in Warburg efekt: izvor energije rakavih celic	Erik Kristian Janežič	Filip Mihalič	Matic Kovačič	09.11.2012	16.11.2012	23.11.2012
Ana Kunšek	16	Večfunkcionalnost akonitaze	Dejan Marjanovič	Samo Zakotnik	Zala Gluhić	09.11.2012	16.11.2012	23.11.2012
Janez Meden	16	NADH-fumarat reduktaza - primerna tarča za zdravljenje s kemoterapijo	Griša Prinčič	Mirjana Malnar	Bojana Lazović	09.11.2012	16.11.2012	23.11.2012
Ana Cirnski	17	Peroksisomalna razgradnja maščobnih kislin	Maja Kostanjevec	Sara Lorbek	Nastja Pirman	16.11.2012	23.11.2012	30.11.2012
Erik Mršnik	17	Adrenolevkodistrofija	Julija Mazej	Ellen Malovrh	Špela Tomaž	16.11.2012	23.11.2012	30.11.2012
Katja Leben	17	Tio maščobne kisline	Estera Merljak	Suzana Semič	Monika Biasizzo	16.11.2012	23.11.2012	30.11.2012
Matic Kovačič	18	Sirtuin 3 ob dieti spodbuja cikel sečnine in oksidacijo maščobnih kislin	Jernej Pušnik	Katarina Tolar	Jakob Gašper Lavrenčič	23.11.2012	30.11.2012	07.12.2012
Zala Gluhić	18	Hiperamoniemija	Rok Razpotnik	Aleksander Benčič	Barbara Dušak	23.11.2012	30.11.2012	07.12.2012
Bojana Lazović	18	Novi farmakološki šaperoni za zdravljenje fenilketonurije	Ajda Rojc	Ana Grom	Matej Vrhovnik	23.11.2012	30.11.2012	07.12.2012
Nastja Pirman	19	Mitohondrij, center celične apoptoze	Tomaž Rozmarič	Erik Kristian Janežič	Filip Mihalič	30.11.2012	07.12.2012	14.12.2012
Špela Tomaž	19	Inhibicija fotosinteze	Ana Kunšek	Dejan Marjanovič	Samo Zakotnik	30.11.2012	07.12.2012	14.12.2012
Monika Biasizzo	19	Mitohondrijski razklopni proteini	Janez Meden	Griša Prinčič	Mirjana Malnar	30.11.2012	07.12.2012	14.12.2012
Jakob Gašper Lavrenčič	20	Sinteza rastlinske celične stene	Ana Cirnski	Maja Kostanjevec	Sara Lorbek	07.12.2012	14.12.2012	21.12.2012
Barbara Dušak	20	Sinteza bakterijske celične stene	Erik Mršnik	Julija Mazej	Ellen Malovrh	07.12.2012	14.12.2012	21.12.2012
Matej Vrhovnik	20	Biosinteza škroba; saharoza kot substrat za sintezo zelo razvejanih komponent škroba	Katja Leben	Estera Merljak	Suzana Semič	07.12.2012	14.12.2012	21.12.2012
Filip Mihalič	21	Moj izbrani naslov	Matic Kovačič	Jernej Pušnik	Katarina Tolar	17.12.2012	21.12.2012	04.01.2013
Samo Zakotnik	21	Sinteza polinenasičenih maščobnih kislin in njihova vloga	Zala Gluhić	Rok Razpotnik	Aleksander Benčič	17.12.2012	21.12.2012	04.01.2013
Mirjana Malnar	21	Vloga PPPAR in leptina v metabolizmu lipidov	Bojana Lazović	Ajda Rojc	Ana Grom	17.12.2012	21.12.2012	04.01.2013
Sara Lorbek	22	Glutaminska odvisnost rakavih celic	Nastja Pirman	Tomaž Rozmarič	Erik Kristian Janežič	21.12.2012	04.01.2013	11.01.2013
Ellen Malovrh	22	Hem, železo in staranje	Špela Tomaž	Ana Kunšek	Dejan Marjanovič	21.12.2012	04.01.2013	11.01.2013
Suzana Semič	22	Lesch-Nyhanov sindrom	Monika Biasizzo	Janez Meden	Griša Prinčič	21.12.2012	04.01.2013	11.01.2013
Katarina Tolar	23	Moj izbrani naslov	Jakob Gašper Lavrenčič	Ana Cirnski	Maja Kostanjevec	04.01.2013	11.01.2013	18.01.2013
Aleksander Benčič	23	Moj izbrani naslov	Barbara Dušak	Erik Mršnik	Julija Mazej	04.01.2013	11.01.2013	18.01.2013
Ana Grom	23	Vloga glukokortikoidov v metabolizmu	Matej Vrhovnik	Katja Leben	Estera Merljak	04.01.2013	11.01.2013	18.01.2013

• številka v okencu za temo pomeni poglavje v Lehningerju (peta izdaja), v katerega naj izbrana tema spada

Gradivo za predavanja

Gradivo za predavanja in seminarje najdete na http://bio.ijs.si/~zajec/bio2/ username: bio2 password: samozame

Naloga

Vaša naloga za seminar je:
Samostojno pripraviti seminar o seminarski temi, ki vam je bila dodeljena. Za osnovo morate vzeti članek iz revije TIBS, če tam ne najdete primerne teme, lahko izberete tudi pregledni članek iz kakšne druge revije, ki ima faktor vpliva nad 5. Poiskati morate še vsaj tri znanstvene članke, ki se nanašajo na opisano temo in jih uporabiti kot podlago za seminarsko nalogo!

Za pripravo seminarja velja naslednje:

• Povzetek seminarja opišete na wikiju v približno 200 besedah - najkasneje do dne ko morate oddati seminar recenzentom.
• Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
• Seminar pripravite v obliki seminarske naloge na ~5-9 straneh A4 (pisava 12, enojni razmak, 2,5 cm robovi; važno je, da je obseg od 2700 do 3000 besed), vsebovati mora najmanj tri slike. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko.
• Seminar oddajte do datuma oddaje, ki je naveden v tabeli vsakemu od recenzentov in docentu (docentu ga pošljite po e-pošti).
• Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke (v elektronski obliki) in podajo oceno pisnega dela. Popravljen seminar oddajte avtorju in Gunčarju.
• Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 25-30 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni.
• Predstavitvi sledi razprava. Recenzenti podajo oceno predstavitve in postavijo najmanj dve vprašanji.
• Na dan predstavitve morate docentu še pred predstavitvijo oddati končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu.
• Seminarska naloga in povzetek morajo biti v slovenskem jeziku!

Imena datotek

Prosim vas, da vse datoteke, ki mi jih pošiljate poimenujete po naslednjem receptu:

• 312_BIO_Priimek_Ime.doc(x) za seminar, npr. 312_BIO_Guncar_Gregor.docx
• 312_BIO_Priimek_Ime_rec_Priimek2.doc(x) za recenzijo, kjer je Priimek2 priimek recenzenta, npr. 312_BIO_Guncar_Gregor_rec_Scott.docx (če se pišete Scott in odajate recenzijo za seminar, ki ga je napisal Gunčar)
• 312_BIO_Priimek_Ime.ppt(x) za prezentacijo, npr 312_BIO_Guncar_Gregor.pptx

Ocenjevanje seminarjev

Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo recenzentsko poročilo na spletu. Recenzentsko poročilo morate oddati najkasneje do 21:00, en dan pred predstavitvijo seminarja.

Mnenje o predstavitvi

Vsak posameznik mora oceniti seminar, tako da odda svoje mnenje najkasneje v sedmih dneh po predstavitvi. Kdor na seminarju ni bil prisoten, mnenja ne sme oddati.

Urejanje spletnih strani na wikiju

Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.

Citiranje virov

Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se v seminarju držite ene same. Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati. Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.

Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.).

Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue C. et al. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, letn. 317, str. 632-638.

Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.

Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)

V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne).

Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.