TBK2020-seminar
Temelji biokemije- seminar
Seminarje vodi prof. dr. Brigita Lenarčič. Seminarji so obvezni.
Ocena seminarjev (6-10) predstavlja enako število odstotkov, ki se prišteje h končni pisni oceni izpita. Stran na strežniku s seminarskimi nalogami je zaščitena. Uporabniško ime je: tbk, password pa: samozame## "##" sta dve številki, ki ju izveste na predavanjih. Tudi za urejanje Wiki strani potrebujete geslo, ki se od zgornjega razlikuje. Postopek pridobitve Wiki uporabniškega imena in gesla je opisan tukaj.
Seznam seminarjev
| Ime in priimek | Naslov seminarja | Povezava | Rok za oddajo | Rok za recenzijo | Datum predstavitve | Recenzent 1 | Recenzent 2 | Recenzent 3 |
| Anna Scott | Moj naslov v slovenščini, link pa kaže na povzetek | povezava | 28.10. | 05.11. | 07.11. | r1 | r2 | r3 |
| Lenka Stanković | Optimizirano antiangiogeno reprogramiranje tumorskega mikrookolja potencira imunoterapijo CD40 | https://www.pnas.org/content/117/1/541 | 24.02. | 27.02. | 03.03. | Špela Došler | Zala Perko | Marija Dujaković |
| Ena Kartal | Kako celično staranje vodi do nevrodegeneracije | https://www.sciencedaily.com/releases/2020/01/200129174540.htm | 24.02. | 27.02. | 03.03. | Jasmina Bešić | Ana Žagar | Neža Leskovar |
| Ema Kovačič | Izpostavljenost ploda materinski mikrobioti | https://insight.jci.org/articles/view/127806 | 24.02. | 27.02. | 03.03. | Nikola Janakievski | Karin Rak | Luka Hafner |
| Nika Tomsič | Pomembnost in delovanje sladkornega prenašalca PfHT1 v parazitu malarije | https://www.sciencedaily.com/releases/2020/01/200129131533.htm https://sci-hub.tw/10.1038/s41586-020-1963-z | 24.02. | 27.02. | 03.03. | Maja Deutsch | Jakob Tomšič | Marigona Beqiraj |
| Sara Golob | Vpliv virusa Herpesa simpleksa tipa 1 na razvoj Alzheimerjeve bolezni | https://www.sciencedaily.com/releases/2018/10/181019100702.htm | 24.02. | 27.02. | 03.03. | Manca Pirc | Maja Kobal | Rebeka Jerina |
| Zala Puklavec | Globoko učenje vodi do odkritja novih antibiotikov | https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(20)30102-1?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0092867420301021%3Fshowall%3Dtrue | 04.03. | 07.03. | 10.03. | Nika Bedrač | Špela Došler | Zala Perko |
| Martin Stanonik | De novo pojavitev adapterskih membranskih proteinov iz timinsko bogatih genskih sekvenc | https://www.sciencedaily.com/releases/2020/02/200218104740.htm | 04.03. | 07.03. | 10.03. | Ivana Trifunovska | Jasmina Bešić | Ana Žagar |
| Klara Kočman | Novi koronavirus SARS-CoV-2 in SARS-CoV | https://www.sciencedaily.com/releases/2020/01/200131114755.htm | 04.03. | 07.03. | 10.03. | Bor Krajnik | Nikola Janakievski | Karin Rak |
| Maša Mencigar | Vpliv apoptotskih celic na imunski sistem | https://www.sciencedaily.com/releases/2020/01/200108123137.htm | 04.03. | 07.03. | 10.03. | Erik Putar | Maja Deutsch | Jakob Tomšič |
| Nevena Ješić | Nepravilne komunikacije med celicami vodijo v levkemijo | https://www.sciencedaily.com/releases/2020/02/200206144824.htm | 04.03. | 07.03. | 10.03. | Ela Bizjak | Manca Pirc | Maja Kobal |
| Nika Perko | Enkapsulacija eteričnega olja pomarančevca v celice gliv kvasovk | https://parasitesandvectors.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13071-019-3870-4 | 10.03. | 13.03. | 17.03. | Lenka Stanković | Nika Bedrač | Špela Došler |
| Timotej Sotošek | Protivirusni remdesivir potentno inhibira RNA-odvisno RNA polimerazo od Srednje vzhodni respiratorni sindrome koronavirusa | https://www.jbc.org/content/early/2020/02/24/jbc.AC120.013056.full.pdf https://www.jbc.org/content/early/2020/02/24/jbc.AC120.013056 | 10.03. | 13.03. | 17.03. | Ena Kartal | Ivana Trifunovska | Jasmina Bešić |
| Hana Glavnik | Kako paraziti malarije zaznajo imunske celice in se pred njimi zaščitijo | https://www.sciencedaily.com/releases/2020/02/200218124346.htm | 10.03. | 13.03. | 17.03. | Ema Kovačič | Bor Krajnik | Nikola Janakievski |
| Anja Moškrič | Povezava med infekcijo s temperiranimi bakteriofagi in izgubo sistema CRISPR - Cas tipa I | https://www.nature.com/articles/s41586-020-1936-2 | 10.03. | 13.03. | 17.03. | Nika Tomsič | Erik Putar | Maja Deutsch |
| Gaja Osojnik | 10.03. | 13.03. | 17.03. | Sara Golob | Ela Bizjak | Manca Pirc | ||
| Aleksandra Pajović | 17.03. | 20.03. | 24.03. | Zala Puklavec | Lenka Stanković | Nika Bedrač | ||
| Maja Deutsch | Globalni kemični učinki mikrobioma vsebujejo nove konjugacije žolčne kisline | https://www.nature.com/articles/s41586-020-2047-9 | 17.03. | 20.03. | 24.03. | Martin Stanonik | Ena Kartal | Ivana Trifunovska |
| Eva Ratajc | Z-DNA vezni protein 1 kot ključni dejavnik kontrolirane replikacije virusa Zahodnega Nila in virusa zika | https://www.readcube.com/articles/10.3389/fmicb.2019.02089 | 17.03. | 20.03. | 24.03. | Anja Moškrič | Ema Kovačič | Bor Krajnik |
| Lana Kores | 17.03. | 20.03. | 24.03. | Maša Mencigar | Nika Tomsič | Erik Putar | ||
| Sara Borišek | 17.03. | 20.03. | 24.03. | Nevena Ješić | Sara Golob | Ela Bizjak | ||
| Jan Kogovšek | Inhibitor plazmepsina zmoti več stanj življenjskega cikla parazita malarije | https://www.sciencedaily.com/releases/2020/03/200304141514.htm https://reader.elsevier.com/reader/sd/pii/S193131282030113X?token=D5C1CD010E9020244FE3ED5F5B36BD9C50958D0419B1E3CD7F8BDDAF847C55706EBACBF92B00F7B1D038D29371ADEA8F | 24.03. | 27.03. | 31.03. | Nika Perko | Zala Puklavec | Lenka Stanković |
| Nina Žgajnar | In vitro samostojno podvojevanje in policistronsko izražanje večjih sintetičnih genomov | https://www.sciencedaily.com/releases/2020/02/200218130501.htm | 24.03. | 27.03. | 31.03. | Timotej Sotošek | Martin Stanonik | Ena Kartal |
| Erika Rihter | 24.03. | 27.03. | 31.03. | Hana Glavnik | Anja Moškrič | Ema Kovačič | ||
| Luka Šegota | 24.03. | 27.03. | 31.03. | Klara Kočman | Maša Mencigar | Nika Tomsič | ||
| Eva Vene | Nevtralizacija denge pri komarjih, ki izražajo sintetično protitelo | https://www.sciencedaily.com/releases/2020/01/200116141710.htm | 24.03. | 27.03. | 31.03. | Gaja Osojnik | Nevena Ješić | Sara Golob |
| Ajda Beltram | 31.03. | 03.04. | 07.04. | Aleksandra Pajović | Nika Perko | Zala Puklavec | ||
| Jan Trebušak | 31.03. | 03.04. | 07.04. | Aljaž Simonič | Timotej Sotošek | Martin Stanonik | ||
| Jan Bregar | 31.03. | 03.04. | 07.04. | Eva Ratajc | Hana Glavnik | Anja Moškrič | ||
| Gregor Strniša | 31.03. | 03.04. | 07.04. | Lana Kores | Klara Kočman | Maša Mencigar | ||
| Petra Pahor | 31.03. | 03.04. | 07.04. | Sara Borišek | Gaja Osojnik | Nevena Ješić | ||
| Nadja Dolničar | 08.04. | 11.04. | 14.04. | Jan Kogovšek | Aleksandra Pajović | Nika Perko | ||
| Tina Javeršek | 08.04. | 11.04. | 14.04. | Nina Žgajnar | Aljaž Simonič | Timotej Sotošek | ||
| Vid Dobrovoljc | 08.04. | 11.04. | 14.04. | Erika Rihter | Eva Ratajc | Hana Glavnik | ||
| Tinkara Božič | 08.04. | 11.04. | 14.04. | Luka Šegota | Lana Kores | Klara Kočman | ||
| Kostadin Mitkov | 08.04. | 11.04. | 14.04. | Eva Vene | Sara Borišek | Gaja Osojnik | ||
| Sara Jerič | 15.04. | 18.04. | 21.04. | Ajda Beltram | Jan Kogovšek | Aleksandra Pajović | ||
| Polona Leban | 15.04. | 18.04. | 21.04. | Jan Trebušak | Nina Žgajnar | Aljaž Simonič | ||
| Stefanija Ivanova | 15.04. | 18.04. | 21.04. | Jan Bregar | Erika Rihter | Eva Ratajc | ||
| Luka Stanković | 15.04. | 18.04. | 21.04. | Gregor Strniša | Luka Šegota | Lana Kores | ||
| Ana Pervanja | 15.04. | 18.04. | 21.04. | Petra Pahor | Eva Vene | Sara Borišek | ||
| Marija Dujaković | 29.04. | 02.05. | 05.05. | Nadja Dolničar | Ajda Beltram | Jan Kogovšek | ||
| Neža Leskovar | 29.04. | 02.05. | 05.05. | Tina Javeršek | Jan Trebušak | Nina Žgajnar | ||
| Luka Hafner | 29.04. | 02.05. | 05.05. | Vid Dobrovoljc | Jan Bregar | Erika Rihter | ||
| Marigona Beqiraj | 29.04. | 02.05. | 05.05. | Tinkara Božič | Gregor Strniša | Luka Šegota | ||
| Rebeka Jerina | 29.04. | 02.05. | 05.05. | Kostadin Mitkov | Petra Pahor | Eva Vene | ||
| Zala Perko | Regulacija s staranjem povezanih patoloških stanj z acetilacijo proteina NLRP3 | https://www.sciencedaily.com/releases/2020/02/200206144837.htm | 06.05. | 09.05. | 12.05. | Sara Jerič | Nadja Dolničar | Ajda Beltram |
| Ana Žagar | 06.05. | 09.05. | 12.05. | Polona Leban | Tina Javeršek | Jan Trebušak | ||
| Karin Rak | 06.05. | 09.05. | 12.05. | Stefanija Ivanova | Vid Dobrovoljc | Jan Bregar | ||
| Jakob Tomšič | 06.05. | 09.05. | 12.05. | Luka Stanković | Tinkara Božič | Gregor Strniša | ||
| Maja Kobal | 06.05. | 09.05. | 12.05. | Ana Pervanja | Kostadin Mitkov | Petra Pahor | ||
| Špela Došler | 13.05. | 16.05. | 19.05. | Marija Dujaković | Sara Jerič | Nadja Dolničar | ||
| Jasmina Bešić | 13.05. | 16.05. | 19.05. | Neža Leskovar | Polona Leban | Tina Javeršek | ||
| Nikola Janakievski | 13.05. | 16.05. | 19.05. | Luka Hafner | Stefanija Ivanova | Vid Dobrovoljc | ||
| Aljaž Simonič | 13.05. | 16.05. | 19.05. | Marigona Beqiraj | Luka Stanković | Tinkara Božič | ||
| Manca Pirc | 13.05. | 16.05. | 19.05. | Rebeka Jerina | Ana Pervanja | Kostadin Mitkov | ||
| Nika Bedrač | Nižji vnos žveplo vsebujočih amino kislin niža tveganje za razvoj kardiometaboličnih bolezni | https://www.sciencedaily.com/releases/2020/02/200203141501.htm | 20.05. | 23.05. | 26.05. | Zala Perko | Marija Dujaković | Sara Jerič |
| Ivana Trifunovska | 20.05. | 23.05. | 26.05. | Ana Žagar | Neža Leskovar | Polona Leban | ||
| Bor Krajnik | 20.05. | 23.05. | 26.05. | Karin Rak | Luka Hafner | Stefanija Ivanova | ||
| Erik Putar | 20.05. | 23.05. | 26.05. | Jakob Tomšič | Marigona Beqiraj | Luka Stanković | ||
| Ela Bizjak | 20.05. | 23.05. | 26.05. | Maja Kobal | Rebeka Jerina | Ana Pervanja |
Naloga
- samostojno pripraviti seminar, katerega tema je novica iz področja biokemije na portalu ScienceDaily, ki je bila objavljena kasneje kot 1. avgusta 2018. Osnova za seminar naj bo znanstveni članek, ki je podlaga za to novico. Poleg tega članka za seminar uporabite še najmanj pet drugih virov, od teh vsaj še dva druga znanstvena članka, ki se navezujeta na to vsebino.
- članke na temo lahko iščete z Google učenjakom.
- naslov izbrane teme in povezavo do novice vpišite v tabelo seminarjev takoj ko ste si izbrali temo, najkasneje pa en teden pred rokom za oddajo
- Povzetek seminarja opišete na wikiju v približno 200 besedah - najkasneje do dne, ko morate oddati seminar recenzentom.
- Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
- Seminar pripravite v obliki seminarske naloge (pisava Cambria, font 11, enojni razmak, 2,5 cm robovi; tekst naj obsega okoli 1000 besed), vsebuje naj 1-2 sliki. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko. Vse uporabljene vire citirajte v tekstu, kot npr. (Nobel, 2010), na koncu pa navedite točen seznam literature, kot je opisano spodaj!
- Celotni seminar naj obsega 2 strani A4 formata (po možnosti dvostransko tiskanje).
- Seminar oddajte do datuma oddaje, ki je naveden v tabeli v elektronski obliki z uporabo tega obrazca.
- vsi seminarji so v elektronski obliki dostopni tukaj.
- Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke in podajo oceno pisnega dela, v predpisanem formatu elektronskega obrazca na internetu.
- Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 10 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni. Prvi recenzent vodi predstavitve in razpravo ter skrbi za to, da vse poteka v zastavljenih časovnih okvirih.
- Predstavitvi sledi razprava do 5 minut. Sledijo vprašanja prisotnih, recenzenti postavijo vsak vsaj dve vprašanji in na koncu podajo oceno predstavitve.
- En dan pred predstavitvijo na strežnik oddajte tudi končno verzijo. Na dan predstavitve morate oddati tudi končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu.
- Seminarska naloga in povzetek na wikiju morajo biti v slovenskem jeziku!
Imena datotek
Prosim vas, da vse datoteke, ki jih pošiljate poimenujete po spodnjih pravilih. Ne uporabljajte ČŽŠčžš! Poslati morate naslednje datoteke:
- TBK_2020_Priimek_Ime.doc(x) za seminar, npr. TBK_2020_Guncar_Gregor.docx
- TBK_2020_Priimek_ime_final.doc(x) za končno verzijo seminarja
- TBK_2020_Priimek_Ime_rec_Priimek2.doc(x) za recenzijo, kjer je Priimek2 priimek recenzenta, npr. TBK_2020_Guncar_Gregor_rec_Scott.docx (če se pišete Scott in odajate recenzijo za seminar, ki ga je napisal Gunčar)
- TBK_2020_Priimek_Ime.ppt(x) za prezentacijo, npr TBK_2020_Guncar_Gregor.pptx
- TBK_2020_Priimek_Ime_clanek.pdf za datoteko PDF, ki vsebuje izvirni članek, npr. TBK_2020_Guncar_Gregor_clanek.pdf
Ocenjevanje seminarjev
Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo [recenzentsko poročilo] na spletu.
Mnenje o predstavitvi
Vsak posameznik mora oceniti seminar tako, da odda svoje mnenje najkasneje v enem tednu po predstavitvi. Kdor na seminarju ni bil prisoten, mnenja ne sme oddati.
Urejanje spletnih strani na wikiju
Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.
Faktor vpliva
Faktor vpliva (angl. impact factor) neke revije pove, kolikokrat so bili v poprečju citirani članki v tej reviji v dveh letih skupaj pred objavo tega faktorja. Faktorje vpliva za posamezno revijo lahko najdete v COBISS-u. V polje "Naslov revije" vnesite ime revije za katero želite izvedeti faktor vpliva in pritisnite na gumb POIŠČI. V skrajnem desnem stolpcu se bodo izpisali faktorji vpliva za revije, ki ustrezajo vašim iskalnim kriterijem. Zadetkov za posamezno revijo je več zato, ker so navedeni faktorji vpliva za posamezno leto. Za tekoče leto faktorji vpliva še niso objavljeni, zato se orientirajte po faktorjih vpliva zadnjih par let. Če faktorja vpliva za vašo izbrano revijo ne najdete v bazi COBISS, potem izberite članek iz kakšne druge revije.
==Citiranje virov==Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se v seminarju držite ene same. Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.
Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.).
Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue C. et al. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, letn. 317, str. 632-638.Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)
V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne).
Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.
