BIO2 Seminar 2020

Biokemijski seminar

doc. dr. Gregor Gunčar, K2.022

Seznam seminarjev

ime in priimek	poglavje	naslov seminarja	recenzent 1	recenzent 2	datum oddaje	datum recenzije	datum predstavitve
Ajda Beltram	12	Zgradba in dinamika signalnih kompleksov GPCR	Luka Hafner	Tinkara Božič	16/10/20	19/10/20	21/10/20
Jan Bregar	12	Protein retinoblastoma	Nika Bedrač	Martin Stanonik	16/10/20	19/10/20	21/10/20
Anja Moškrič	12	Presinaptični kalcijevi kanalčki kot specializiran nadzor za sproščanje nevrotransmiterjev	Srna Anastasovska	Luka Stanković	16/10/20	19/10/20	21/10/20
Gregor Strniša	12	Načini aktivacije GPCR	Manca Pirc	Ana Pervanja	23/10/20	26/10/20	28/10/20
Vid Dobrovoljc	12	Medsebojni vpliv signalnih poti na primeru RTK in GPCR signalnih poti	Maruša Sernc	Nika Banovšek	23/10/20	26/10/20	28/10/20
Nikola Janakievski	12	Selective androgen receptor modulators	Ajda Beltram	Aljaž Simonič	23/10/20	26/10/20	28/10/20
Rebeka Jerina	12	Kofein kot antagonist adenozinskih receptorjev	Jan Bregar	Luka Hafner	30/10/20	02/11/20	04/11/20
Eva Vene	12	Povezava bolečine z vezavo kapsaicina na TRPV1	Anja Moškrič	Nika Bedrač	30/10/20	02/11/20	04/11/20
Zala Perko	12	Mehanizmi vezave ligandov in regeneracija fotoreceptorjev očesne mrežnice	Gregor Strniša	Srna Anastasovska	30/10/20	02/11/20	04/11/20
Erik Putar	14-15	AMPK: senzor glukoze in celičnega energijskega stanja	Nikola Janakievski	Manca Pirc	06/11/20	09/11/20	11/11/20
Iva Matić	14-15		Rebeka Jerina	Maruša Sernc	06/11/20	09/11/20	13/01/21
Timotej Sotošek	14-15	Regulacija mišičnega glikogena: granula in njeni proteini	Eva Vene	Ajda Beltram	06/11/20	09/11/20	11/11/20
Nika Tomsič	16	Acetil-CoA: glavni metabolit in sekundarni obveščevalec	Zala Perko	Jan Bregar	13/11/20	16/11/20	18/11/20
Andrej Špenko	16		Erik Putar	Anja Moškrič	13/11/20	16/11/20	18/11/20
Aleksandra Rauter	16	Vloga intermediatov Krebsovega cikla v makrofagih	Iva Matić	Gregor Strniša	13/11/20	16/11/20	18/11/20
Laura Unuk	17	Motnje oksidacije dolgoverižnih maščobnih kislin in karnitinskega transporta	Timotej Sotošek	Nikola Janakievski	20/11/20	23/11/20	25/11/20
Stefanija Ivanova	17	Vpliv telovadbe na metabolizem ketonskih telesc	Nika Tomsič	Rebeka Jerina	20/11/20	23/11/20	25/11/20
Jakob Tomšič	17	Funkcije ketonskih telesc v centralnem živčevju	Andrej Špenko	Eva Vene	20/11/20	23/11/20	25/11/20
Neža Leskovar	18	Urea transporterji in regulacija skoncentriranosti urina	Aleksandra Rauter	Zala Perko	27/11/20	30/11/20	02/12/20
Luka Šegota	18		Laura Unuk	Erik Putar	27/11/20	30/11/20	02/12/20
Nika Perko	18	Encim karbamoil fosfat sintetaza 1	Stefanija Ivanova	Iva Matić	27/11/20	30/11/20	02/12/20
Ela Bizjak	19	Mutacije mitohondrijske DNA, heterogenost in mitohondrijske bolezni	Jakob Tomšič	Timotej Sotošek	04/12/20	07/12/20	09/12/20
Bor Krajnik	19		Neža Leskovar	Nika Tomsič	04/12/20	07/12/20	09/12/20
Maja Kobal	19	Od UCP1 odvisna in neodvisna termogeneza	Luka Šegota	Vid Dobrovoljc	04/12/20	07/12/20	09/12/20
Mateja Milošević	20		Nika Perko	Andrej Špenko	11/12/20	14/12/20	16/12/20
Tinkara Božič	20	Pomen saharoze in njenega metabolizma za rastline	Ela Bizjak	Aleksandra Rauter	11/12/20	14/12/20	16/12/20
Martin Stanonik	20		Bor Krajnik	Laura Unuk	11/12/20	14/12/20	16/12/20
Luka Stanković	21		Maja Kobal	Stefanija Ivanova	18/12/20	21/12/20	23/12/20
Ana Pervanja	21	Vpliv cirkadianega ritma na metabolizem lipidov	Mateja Milošević	Jakob Tomšič	18/12/20	21/12/20	23/12/20
Nika Banovšek	21		Tinkara Božič	Neža Leskovar	18/12/20	21/12/20	23/12/20
Aljaž Simonič	22		Martin Stanonik	Luka Šegota	23/12/20	28/12/20	30/12/20
Luka Hafner	22	Abiotični stres in neproteinogene aminokisline v rastlinah	Luka Stanković	Ana Žagar	23/12/20	28/12/20	30/12/20
Ana Žagar	22		Vid Dobrovoljc	Nika Perko	23/12/20	28/12/20	30/12/20
Nika Bedrač	23		Ana Pervanja	Ela Bizjak	30/12/20	04/01/21	06/01/21
Srna Anastasovska	23		Nika Banovšek	Bor Krajnik	30/12/20	04/01/21	06/01/21
Manca Pirc	23		Aljaž Simonič	Maja Kobal	30/12/20	04/01/21	06/01/21
Maruša Sernc	23		Ana Žagar	Mateja Milošević	08/01/21	11/01/21	13/01/21
Lea Nicouleau	any chapter				06/01/21	11/01/21	13/01/21
Marjorie Leaud	any chapter				06/01/21	11/01/21	13/01/21

• številka v okencu za temo pomeni poglavje v Lehningerju, v katerega naj izbrana tema spada

Razporeditev je začasna in se lahko še spremeni, načeloma pa se termini do vključno 18. poglavja ne bodo spreminjali. Prosim,da mi sporočite morebitne napake ali če vas nisem razporedil.

Gradivo za predavanja

Gradivo za predavanja in seminarje najdete na http://bio.ijs.si/~zajec/bio2/ username: bio2 password: samozame

Naloga

Vaša naloga za seminar je:
Samostojno pripraviti seminar o seminarski temi, ki vam je bila dodeljena. Za osnovo morate vzeti pregledni članek iz revije, ki ima faktor vpliva nad 5 (npr. TIBS. Poiskati morate še vsaj tri znanstvene članke, ki se nanašajo na opisano temo in jih uporabiti kot podlago za seminarsko nalogo! Članki so dostopni tukaj.

Za pripravo seminarja velja naslednje:

• Povzetek seminarja opišete na wikiju v 200 besedah (+- dvajset besed) - najkasneje do dne ko morate oddati seminar recenzentom.
• Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
• Seminar pripravite v obliki seminarske naloge na ~5-12 straneh A4 (pisava 12, enojni razmak, 2,5 cm robovi). Obseg seminarja naj bo 2700 do 3000 besed , a ne več kot 3500 besed. Seminarska naloga mora vsebovati najmanj tri slike, bolje več. Eno sliko morate narisati sami in to pod sliko posebej označiti. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko.
• Seminar oddajte do datuma oddaje, ki je naveden v tabeli v elektronski obliki z uporabo tega obrazca.
• Vsi seminarji so v elektronski obliki dostopni tukaj.
• Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke (v elektronski obliki) in podajo oceno pisnega dela. Popravljen seminar oddajte z uporabo tega obrazca.
• Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 20-25 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni.
• Predstavitvi sledi razprava. Recenzenti podajo oceno predstavitve in postavijo najmanj dve vprašanji.Vsi ostali morajo postaviti še dve dodatni vprašanji v okviru celega seminarskega obdobja. Vprašanja, ki ste jih postavili vpišite na tukaj.
• Na dan predstavitve morate docentu še pred predstavitvijo oddati končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu, elektronsko verzijo seminarja in predstavitev pa oddati na strežnik na dan predstavitve do polnoči.
• Seminarska naloga in povzetek morajo biti v slovenskem jeziku, razen za študente, katerih materni jezik ni slovenščina. Ti lahko oddajo seminar v angleškem jeziku.

Imena datotek

Prosim vas, da vse datoteke, ki mi jih pošiljate poimenujete po naslednjem receptu:

• 312_BIO_Priimek_Ime.doc(x) za seminar, npr. 312_BIO_Guncar_Gregor.docx
• 312_BIO_Priimek_ime_final.doc(x) za končno verzijo seminarja
• 312_BIO_Priimek_Ime_rec_Priimek2.doc(x) za recenzijo, kjer je Priimek2 priimek recenzenta, npr. 312_BIO_Guncar_Gregor_rec_Scott.docx (če se pišete Scott in odajate recenzijo za seminar, ki ga je napisal Gunčar)
• 312_BIO_Priimek_Ime.ppt(x) za prezentacijo, npr 312_BIO_Guncar_Gregor.pptx
• 312_BIO_Priimek_ime_poprava.doc(x) za popravljeno končno verzijo seminarja, če so popravki manjši

Ocenjevanje seminarjev

Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo recenzentsko poročilo na spletu. Recenzentsko poročilo morate oddati najkasneje do 21:00, en dan pred predstavitvijo seminarja.

Mnenje o predstavitvi

Vsak posameznik odda svoje mnenje o predstavitvi takoj po predstavitvi z online glasovanjem.

Urejanje spletnih strani na wikiju

Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.

Citiranje virov

Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se držite ene same. V seminarskih nalogah in diplomskih nalogah FKKT uprabljajte shemo citiranja, ki je pobarvana zeleno. Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati. Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.

Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.).

Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue, C., Glass, J. I., Alperovich, N., Pieper, R., Parmar, P. P., Hutchison III, C. A., Smith, H. O. in Venter, J. C. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, 317, str. 632-638.

Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.

Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)

V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne). Navesti morate tudi vse avtorje dela, razen v primeru, ko jih je 10 ali več. Takrat navedite le prvih devet, za ostale pa uporabite okrajšavo in sod. (in sodelavci). Pred zadnjim avtorjem naj bo vedno besedica "in".

Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.