Organizacija mitohondrijskega nukleoida in vloga TFAM pri tem
Osnovne informacije
TFAM ali mitohondrijski transkripcijski faktor A (PDB: 3TMM) je mitohondrijski protein, ki sestavlja ga 294 aminokislinksih ostankov, njegova molekulska masa znaša okoli 25 kDa. Njegovo strukturo lahko razdelimo na 4 dele: 2 HMG-škatli (ang. high mobility group box domain), povezovalni heliks in C-rep. Vsak od teh elementov ima svojo specifično funkcijo. HMG-škatle (primer v PDB: 2LEF) so posebne domene proteinov, ki interagirajo z DNA, povezovalni heliks omogoča nastanek U-zavoja, C-rep pa sodeluje pri iniciaciji replikacije in transkripcije mtDNA. Opravlja več funkcij. Lahko sodeluje pri uravnavanju koncentracije kalcijevih ionov v mitohondrijskem matriksu ali pa s svojo vezavo na mtDNA pomaga pri iniciaciji replikacije, transkripcije, hkrati pa jo tudi kompaktira in ščiti pred ROS (reaktivnimi kisikovimi zvrstmi), ki so v mitohondriju prisotni. Hkrati pa z vezavo na mtDNA zaščiti tudi sebe pred razgradnjo s proteazo Lon.