BIO2 Seminar 2011
Biokemijski seminar
Seminarje vodi doc. dr. Gregor Gunčar in so na urniku vsako sredo in petek po eni uri predavanj iz Biokemije.
Ocena seminarjev predstavlja 30% končne ocene in vsebuje vse točke, ki jih študent/ka lahko zbere pri seminarju in ostalih dejavnostih, ki niso del pisnega izpita.
Seznam seminarjev
Vpišite svoj izbrani naslov!!!
| Ime in priimek | Naslov seminarja | Rok za oddajo | Rok za recenzijo | Datum predstavitve | Recenzent1 | Recenzent2 |
| Ula Štok | Tipping the mind | 17.10.11 | 19.10.11 | 21.10.11 | ||
| Maša Mirković | The twisted way of things | 17.10.11 | 19.10.11 | 21.10.11 | ||
| Sara Draščič | On the spur of a whim | 17.10.11 | 19.10.11 | 21.10.11 | ||
| Katra Koman | Protein of the 20th century | 18.10.11 | 23.10.11 | 26.10.11 | ||
| Ime in priimek | Naslov | 21.10.11 | 25.10.11 | 28.10.11 | ||
| Ana Dolinar | The juice of life | 21.10.11 | 25.10.11 | 28.10.11 | ||
| Urška Rauter | A green glow | 21.10.11 | 25.10.11 | 28.10.11 | ||
| Taja Karner | Throb | 21.10.11 | 26.10.11 | 02.11.11 | ||
| Rok Štemberger | Forbidden fruit | 21.10.11 | 28.10.11 | 04.11.11 | ||
| Maša Mohar | The tenuous nature of sex | 21.10.11 | 28.10.11 | 04.11.11 | ||
| Veronika Jarc | Our hollow architecture | 21.10.11 | 28.10.11 | 04.11.11 | ||
| Mirjam Kmetič | Mint condition | 26.10.11 | 02.11.11 | 09.11.11 | ||
| Janez Meden | The Japanese Horseshoe Crab and Deafness | 28.10.11 | 04.11.11 | 11.11.11 | ||
| Tjaša Flis | Naslov seminarja | 28.10.11 | 04.11.11 | 11.11.11 | ||
| Sandi Botonjić | Nature's junkie | 28.10.11 | 04.11.11 | 11.11.11 | ||
| Kaja Javoršek | Naslov seminarja | 02.11.11 | 09.11.11 | 16.11.11 | ||
| Rok Vene | Naslov seminarja | 04.11.11 | 11.11.11 | 18.11.11 | ||
| Ines Šterbal | Naslov seminarja | 04.11.11 | 11.11.11 | 18.11.11 | ||
| Matja Zalar | Do it yourself | 04.11.11 | 11.11.11 | 18.11.11 | ||
| Matevž Ambrožič | Moody wallpaper | 09.11.11 | 16.11.11 | 23.11.11 | ||
| Matevž Merljak | Naslov seminarja | 11.11.11 | 18.11.11 | 25.11.11 | ||
| Mitja Crček | When your day draws to an end | 11.11.11 | 18.11.11 | 25.11.11 | ||
| Dominik Kert | Naslov seminarja | 11.11.11 | 18.11.11 | 25.11.11 | ||
| Petra Malavašič | The man behind the molecular lung | 16.11.11 | 23.11.11 | 30.11.11 | ||
| Eva Knapič | Life's first breath | 18.11.11 | 25.11.11 | 02.12.11 | ||
| Marko Radojković | Paint my thoughts | 18.11.11 | 25.11.11 | 02.12.11 | ||
| Tjaša Goričan | Nerve regrowth: nipped by a no-go | 18.11.11 | 25.11.11 | 02.12.11 | ||
| Tina Gregorič | Gut feelings | 23.11.11 | 30.11.11 | 07.12.11 | ||
| Tamara Marić | The dark side of RNA | 25.11.11 | 02.12.11 | 09.12.11 | ||
| Ana Remžgar | Naslov seminarja | 25.11.11 | 02.12.11 | 09.12.11 | ||
| Maja Remškar | Questioning Colour | 25.11.11 | 02.12.11 | 09.12.11 | ||
| Andreja Bratovš | The power behind pain | 30.11.11 | 07.12.11 | 14.12.11 | ||
| Urška Navodnik | Darwin's dessert | 02.12.11 | 09.12.11 | 16.12.11 | ||
| Jernej Mustar | Silent pain | 02.12.11 | 09.12.11 | 16.12.11 | ||
| Ines Kerin | A queen's dinner | 02.12.11 | 09.12.11 | 16.12.11 | ||
| Alja Zottel | Sleepless nights | 07.12.11 | 14.12.11 | 21.12.11 | ||
| Alenka Mikuž | Molecular chastity | 09.12.11 | 16.12.11 | 23.12.11 | ||
| Maja Grdadolnik | Ear of Stone | 09.12.11 | 16.12.11 | 23.12.11 | ||
| Jana Verbančič | Hidden power | 09.12.11 | 16.12.11 | 23.12.11 | ||
| Petra Gorečan | Naslov seminarja | 14.12.11 | 21.12.11 | 04.01.12 | ||
| Karmen Hrovat | Naslov seminarja | 16.12.11 | 23.12.11 | 06.01.12 | ||
| Andrej Vrankar | The things we forget | 16.12.11 | 23.12.11 | 06.01.12 | ||
| Teja Banič | Cool news | 16.12.11 | 23.12.11 | 06.01.12 | ||
| Špela Pohleven | The making of crooked | 21.12.11 | 04.01.12 | 11.01.12 | ||
| Sabina Mavretič | A short story | 23.12.11 | 06.01.12 | 13.01.12 | ||
| Karmen Belšak | Another dark horse | 23.12.11 | 06.01.12 | 13.01.12 | ||
| Iza Ogris | Love,love, love... | 23.12.11 | 06.01.12 | 13.01.12 | ||
| Monika Škrjanc | The greenest of us all | 04.01.12 | 11.01.12 | 18.01.12 | ||
| Ana Potočnik | Skin-deep | 06.01.12 | 13.01.12 | 20.01.12 | ||
| Ime in priimek | Naslov seminarja | 06.01.12 | 13.01.12 | 20.01.12 | ||
| Ime in priimek | Naslov seminarja | 06.01.12 | 13.01.12 | 20.01.12 |
Gradivo za seminarje
NOVO Gradivo za predavanja in seminarje najdete na http://bio.ijs.si/~zajec/bio2/ username: bio2 password: samozame
Naloga
Vaša naloga za seminar je:
Samostojno pripraviti seminar o enem od proteinov opisanih v ProteinSpotlight Poiskati morate vsaj še tri znanstvene članke, ki se nanašajo na opisano temo in jih uporabiti kot podlago za seminarsko nalogo!
V seminarsko nalogo mora biti vključeno:
- sekvenca proteina in SwissProt oznaka proteina
- slika strukture proteina (če je le-ta znana), ki jo naredite sami s programom Pymol. Če struktura še ni znana, vključite sliko proteina, ki je vašemu najbolj podoben po sekvenci in katerega struktura je znana
- poiskati morate, na katerem kromosomu se v človeškem genu nahaja ta protein in narisati shematsko sliko gena (eksonov in intronov) tega proteina. Če protein ni človeškega izvora, poiščite protein, ki je vašemu najbolj podoben in vse navedeno opišite za ta protein.
Za pripravo seminarja velja naslednje:
- Povzetek seminarja opišete na wikiju v približno 200 besedah, besedilo naj vsebuje sliko strukture proteina, ki jo sami narišete s programom PyMol - najkasneje do dne ko morate oddati seminar recenzentom.
- Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
- Seminar pripravite v obliki seminarske naloge na ~5-9 straneh A4 (pisava 12, enojni razmak, 2,5 cm robovi; važno je, da je obseg od 2700 do 3000 besed), vsebovati mora najmanj tri slike. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko.
- Natisnjen seminar oddajte dva tedna pred predstavitvijo vsakemu od recenzentov (docentu ga pošljite po e-pošti v formatu .doc ali .docx).
- Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke in podajo oceno pisnega dela.
- Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 20-30 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni.
- Predstavitvi sledi razprava. Recenzenti podajo oceno predstavitve in postavijo najmanj dve vprašanji.
- Na dan predstavitve morate docentu oddati končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu.
- Seminarska naloga in povzetek morajo biti v slovenskem jeziku!
Ocenjevanje seminarjev
Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo [recenzentsko poročilo] na spletu.
Mnenje o predstavitvi
Vsak posameznik mora oceniti seminar, tako da odda svoje mnenje najkasneje v treh dneh po predstavitvi. Kdor na seminarju ni bil prisoten, mnenja ne sme oddati.
Urejanje spletnih strani na wikiju
Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.
Citiranje virov
Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se v seminarju držite ene same.
Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati.
Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.
Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.).
Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue C. et al. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, letn. 317, str. 632-638.
Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.
Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)
V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne).
Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.
