BIO1-seminar-2012
Temelji biokemije- seminar
Seminarje vodi doc. dr. Gregor Gunčar in so na urniku vsak ponedeljek od 10:00 do 11:30.
Ocena seminarjev predstavlja ??% končne ocene in vsebuje vse točke, ki jih študent/ka lahko zbere pri seminarju in ostalih dejavnostih, ki niso del pisnega izpita.
Seznam seminarjev
| Ime in priimek | Naslov seminarja | Link | Rok za oddajo | Rok za recenzijo | Datum predstavitve | Recenzent 1 | Recenzent 2 | Recenzent 3 |
| Gregor Gunčar | Sintetični DNA vezavni proteini | link | 28.02. | 03.03. | 07.03. | rec1 | rec2 | rec3 |
| VRANKAR ANDREJ | Število lasno-mešičnih matičnih celic se v plešastem lasišču moških z androgeno alopecijo ohranja za razliko od števila CD200-rich in CD34-positive lasno-mešičnih predniških celic | 28.02. | 03.03. | 07.03. | HROVAT KARMEN | BOHNEC IVO | JAVORŠEK KAJA | |
| ZALAR MATJA | Protein p53 | 28.02. | 03.03. | 07.03. | OGRIS IZA | CRČEK MITJA | ZOTTEL ALJA | |
| ZOTTEL ALJA | Vloga imunskega sistema pri aterosklerozi | 31.434 | 07.03. | 10.03. | 14.03. | RADOJKOVIĆ MARKO | KERT DOMINIK | HROVAT KARMEN |
| DOLINAR ANA | Prirojena ali prilagodljiva imunost? Primer naravnih celic ubijalk | 28 | 07.03. | 10.03. | 14.03. | RAUTER URŠKA | MOHAR MAŠA | VERBANČIČ JANA |
| RAUTER URŠKA | Razvojna vloga Srf, kortikalnega citoskeleta in celične oblike v orientaciji epidermalnega vretena | 19.527 | 07.03. | 10.03. | 14.03. | MUSTAR JERNEJ | JAVORŠEK KAJA | MOHAR MAŠA |
| MOHAR MAŠA | Sladkorna bolezen tipa 2 kot bolezen imunskega sistema | 30,006 | 14.03. | 17.03. | 21.03. | VENE ROK | RAUTER URŠKA | GORIČAN TJAŠA |
| POHLEVEN ŠPELA | Prioni | 34 | 14.03. | 17.03. | 21.03. | KEPIC LEA | RADOJKOVIĆ MARKO | DOLINAR ANA |
| KEPIC LEA | Agonisti adrenoreceptorjev β2 | 34.48 | 14.03. | 17.03. | 21.03. | VRANKAR ANDREJ | BRATOVŠ ANDREJA | MUSTAR JERNEJ |
| KMETIČ MIRJAM | Celična regulacija metabolizma železa | 5,371 | 14.03. | 17.03. | 21.03. | MARIĆ TAMARA | REMŠKAR MAJA | KOMAN KATRA |
| JARC VERONIKA | Eksperimentalni modeli za študijo imunobiologije hepatitisa C | 3.26 | 14.03. | 21.03. | 28.03. | REMŠKAR MAJA | MUSTAR JERNEJ | KEPIC LEA |
| KOMAN KATRA | Pomen dendritskih celic (DCs) in celic ubijalk (NK) v imunskem odzivu na okužbo z virusom HIV-1 | 32.245 | 21.03. | 25.03. | 28.03. | ČUPOVIĆ VANA | KARNER TAJA | KMETIČ MIRJAM |
| OGRIS IZA | Zakaj imajo možgani glikogen? | 5,125 | 14.03. | 21.03. | 28.03. | KNAPIČ EVA | BRGLEZ ŽIVA | VRANKAR ANDREJ |
| KERIN INES | Kanabinoidi za zdravljenje shizofrenije? Uravnotežena nevrokemična sestava za škodljive in terapevtske učinke uživanja konoplje | 4.458 | 14.03. | 21.03. | 28.03. | ŠTOK ULA | ŠTEMBERGER ROK | KERT DOMINIK |
| VERBANČIČ JANA | Apoptozi podobna smrt v bakterijah, ki jo povzroča HAMLET, človeški mlečni lipidno-proteinski kompleks | 4.351 | 21.03. | 28.03. | 04.04. | KARNER TAJA | ZOTTEL ALJA | KNAPIČ EVA |
| KNAPIČ EVA | Kako virusi vodijo delovanje celice. | 14.101 | 21.03. | 28.03. | 04.04. | ZALAR MATJA | POHLEVEN ŠPELA | LORBEK SARA |
| REMŽGAR ANA | Črevesna absorpcija vitamina D ne poteka le s pasivno difuzijo: dokazi za vpletenost enakih transporterjev kot pri holesterolu | 4.356 | 21.03. | 28.03. | 04.04. | BOTONJIĆ SANDI | LORBEK SARA | ČUPOVIĆ VANA |
| GRDADOLNIK MAJA | Jedrni in nejedrni receptorji za estrogene | 5.328 | 21.03. | 28.03. | 04.04. | MOHAR MAŠA | REMŽGAR ANA | FRANKO NIK |
| JAVORŠEK KAJA | Potencial matičnih celic pri Parkinsonovi bolezni in molekularni faktorji za tvorbo dopaminskih nevronov | 4.139 | 28.03. | 04.04. | 11.04. | GEC KARMEN | MARIĆ TAMARA | RADOJKOVIĆ MARKO |
| BRATOVŠ ANDREJA | Vloga GPCR v patologiji Alzheimerjeve bolezni | 26 | 28.03. | 04.04. | 11.04. | ZOTTEL ALJA | ČUPOVIĆ VANA | GRDADOLNIK MAJA |
| CRČEK MITJA | Matične celice in njihova vloga pri zdravljenju bolezni in poškodb | 7.365 | 28.03. | 04.04. | 11.04. | BOHNEC IVO | KMETIČ MIRJAM | BRATOVŠ ANDREJA |
| MARIĆ TAMARA | Organizacija jedra | 9.58 | 28.03. | 04.04. | 11.04. | NAVODNIK URŠKA | GEC KARMEN | REMŠKAR MAJA |
| ŠTEMBERGER ROK | povečano izražanje in imunogenosti HIV proteinov po inaktivaciji encimske aktivnosti | 3.616 | 04.04. | 11.04. | 18.04. | JAVORŠEK KAJA | VRANKAR ANDREJ | BOTONJIĆ SANDI |
| LORBEK SARA | Sovplivanje maščobnih kislin ter genov na adipokine in debelost | 3.072 | 04.04. | 11.04. | 18.04. | POHLEVEN ŠPELA | KNAPIČ EVA | VENE ROK |
| REMŠKAR MAJA | Evolucijska dinamika transponibilnih elementov (TE) v majhnem RNA svetu | 8.689 | 04.04. | 11.04. | 18.04. | KERIN INES | POVŠE KATJA | CRČEK MITJA |
| ČUPOVIĆ VANA | naslov | 04.04. | 11.04. | 18.04. | REMŽGAR ANA | VERBANČIČ JANA | RODE URŠKA | |
| RODE URŠKA | vpliv c-reaktivnega proteina na patogenezo simptomov metaboličnega sindroma | 6.614 | 03.05. | 06.05. | 09.05. | GRDADOLNIK MAJA | ŠTEMBERGER ROK | MARIĆ TAMARA |
| RADOJKOVIĆ MARKO | Vpliv rakastih celic in sepse na izraženost krvnega proteina trombina | 14.608 | 03.05. | 06.05. | 09.05. | FRANKO NIK | VENE ROK | POVŠE KATJA |
| VENE ROK | Spremembe nivoja metilacije DNA so sorazmerne s starostjo človeških možganov | 7.386 | 03.05. | 06.05. | 09.05. | VERBANČIČ JANA | NAVODNIK URŠKA | ZALAR MATJA |
| FRANKO NIK | naslov | 03.05. | 06.05. | 09.05. | xx | HROVAT KARMEN | BOHNEC IVO | |
| HROVAT KARMEN | Ciljanje kemokinih receptorjev v alergijskih boleznih | 5,155 | 04.05. | 09.05. | 16.05. | KERT DOMINIK | JARC VERONIKA | KARNER TAJA |
| AMBROŽIČ MATEVŽ | Termogene snovi in regulacija telesne teže | 4,434 | 04.05. | 09.05. | 16.05. | LORBEK SARA | KEPIC LEA | REMŽGAR ANA |
| NAVODNIK URŠKA | Stabilnost RNA/DNA in DNA/DNA dupleksa vpliva na mRNA transkripcijo | 04.05. | 09.05. | 16.05. | AMBROŽIČ MATEVŽ | ŠTOK ULA | ŠTEMBERGER ROK | |
| BRGLEZ ŽIVA | Kompleks Mre11 | 42.198 | 09.05. | 16.05. | 23.05. | DOLINAR ANA | BOTONJIĆ SANDI | JARC VERONIKA |
| KARNER TAJA | [1]Alkohol omogoča lažje nalaganje CD1d molekul, s tem aktivira NKT celic in zmanjša pojavljanje sladkorne bolezni pri NOD miškah | 12.05. | 17.05. | 23.05. | KOMAN KATRA | OGRIS IZA | NAVODNIK URŠKA | |
| KERT DOMINIK | Kako osteokalcin vpliva na reprodukcijo organizmov | 09.05. | 16.05. | 23.05. | GORIČAN TJAŠA | GRDADOLNIK MAJA | RAUTER URŠKA | |
| MUSTAR JERNEJ | Odpornost srpastih celic na okužbo z plazmodijem | 31 | 16.05. | 23.05. | 30.05. | JARC VERONIKA | AMBROŽIČ MATEVŽ | BRGLEZ ŽIVA |
| GEC KARMEN | Učinki vadbe in/ali dodajanja antioksidantov na izražanje genov endotelnih celic | 3.469 | 16.05. | 23.05. | 30.05. | POVŠE KATJA | ZALAR MATJA | AMBROŽIČ MATEVŽ |
| GORIČAN TJAŠA | Molekulske tarče oksidativnega stresa | 17,902 | 16.05. | 23.05. | 30.05. | KMETIČ MIRJAM | RODE URŠKA | POHLEVEN ŠPELA |
| BOHNEC IVO | Alzheimerjev gen poruši možganske povezave 50 let preden bolezen izbruhne. | 23.05. | 30.05. | 06.06. | CRČEK MITJA | GORIČAN TJAŠA | ŠTOK ULA | |
| ŠTOK ULA | Mutacija mitohondrijske DNA v povezavi z rakom debelega črevesa kot posledica abnormalnega delovanja citokroma c oksidaze | 23.05. | 30.05. | 06.06. | BRGLEZ ŽIVA | DOLINAR ANA | KERIN INES | |
| nihce | naslov | 23.05. | 30.05. | 06.06. | BRATOVŠ ANDREJA | KOMAN KATRA | GEC KARMEN |
Naloga
- samostojno pripraviti seminar, katerega tema je novica iz področja biokemije na portalu ScienceDaily, ki je bila objavljena kasneje kot 1. avgusta 2011. Osnova za seminar naj bo znanstveni članek, ki je podlaga za to novico. Poleg tega članka morate za seminar uporabiti še najmanj pet drugih virov, od teh vsaj še dva druga znanstvena članka, ki se navezujeta na to vsebino.
- naslov izbrane teme in link do novice vpišite v tabelo seminarjev takoj ko ste si izbrali temo, najkasneje pa en teden pred rokom za oddajo
- Povzetek seminarja opišete na wikiju v približno 200 besedah - najkasneje do dne ko morate oddati seminar recenzentom.
- Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
- Seminar pripravite v obliki seminarske naloge (pisava 12, enojni razmak, 2,5 cm robovi; važno je, da je obseg od 1800 do 2000 besed), vsebovati mora najmanj eno sliko. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko. Vse uporabljene vire citirajte v tekstu, kot npr. (Nobel, 2010), na koncu pa navedite točen seznam literature, kot je opisano spodaj!
- Natisnjen seminar oddajte do roka za oddajo vsakemu od recenzentov (docentu ga pošljite po e-pošti v formatu .doc ali .docx).
- Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke in podajo oceno pisnega dela, v predpisanem formatu elektronskega obrazca na internetu.
- Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 15 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni.
- Predstavitvi sledi razprava- 7 minut. Recenzenti podajo oceno predstavitve in postavijo vsak vsaj dve vprašanji.
- En dan pred predstavitvijo oddajte končno verzijo doc. Gunčarju po e-mailu, v subject napišite TB-seminar in pripnite datoteko, ki ima ime v obliki TB-2012-Ime-Priimek.docx. Na dan predstavitve morate docentu oddati tudi končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu.
- Seminarska naloga in povzetek na wikiju morajo biti v slovenskem jeziku!
Ocenjevanje seminarjev
Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo [recenzentsko poročilo] na spletu.
Mnenje o predstavitvi
Vsak posameznik mora oceniti seminar, tako da odda svoje mnenje najkasneje v enem tednu po predstavitvi. Kdor na seminarju ni bil prisoten, mnenja ne sme oddati.
Urejanje spletnih strani na wikiju
Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.
Faktor vpliva
Faktor vpliva (angl. impact factor) neke revije pove, kolikokrat so bili v poprečju citirani članki v tej reviji v dveh letih skupaj pred objavo tega faktorja. Faktorje vpliva za posamezno revijo lahko najdete v COBISS-u. V polje "Naslov revije" vnesite ime revije za katero želite izvedeti faktor vpliva in pritisnite na gumb POIŠČI. V skrajnem desnem stolpcu se bodo izpisali faktorji vpliva za revije, ki ustrezajo vašim iskalnim kriterijem. Zadetkov za posamezno revijo je več zato, ker so navedeni faktorji vpliva za posamezno leto. Za leto 2011 faktorji vpliva še niso objavljeni, zato se orientirajte po faktorjih vpliva zadnjih par let. Če faktorja vpliva za vašo izbrano revijo ne najdete v bazi COBISS, potem izberite članek iz kakšne druge revije.
Citiranje virov
Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se v seminarju držite ene same.
Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati.
Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.
Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.).
Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue C. et al. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, letn. 317, str. 632-638.
Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.
Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)
V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne).
Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.
