Reverzna transkriptaza

From Wiki FKKT

(Difference between revisions)
Jump to: navigation, search
m
Current revision (16:22, 26 January 2011) (view source)
 
Line 1: Line 1:
-
'''Reverzna transkriptaza''' je encim [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html| (EC 2.7.7.49)], ki spada v razred transferaz. Katalizira podaljševanje DNA verige na 3'- koncu na osnovi RNA matrice, torej omogoča prepis RNA na DNA (''en. RNA-directed DNA polymerase''). Za začetek potrebuje že obstoječ RNA ali DNA primer – ne more ustvariti verige od začetka (''"de novo"'').<sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[1]]]</sup> Kratka shema reakcije: deoxynucleoside triphosphate + DNA<sub>n</sub> = diphosphate + DNA<sub>n+1</sub>
+
'''Reverzna transkriptaza''' je encim [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html| (EC 2.7.7.49)], ki spada v razred transferaz. Katalizira podaljševanje DNA verige na 3'- koncu na osnovi RNA-matrice, torej omogoča prepis RNA na DNA (''angl. RNA-directed DNA polymerase''). Za začetek potrebuje že obstoječ začetni oligonukleotid (RNA ali DNA) – ne more ustvariti verige od začetka (''"de novo"'').<sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[1]]]</sup>  
 +
 
 +
Kratka shema reakcije: deoksinukleozid-trifosfat + DNA<sub>n</sub> = difosfat + DNA<sub>n+1</sub>
{| border=3
{| border=3
  ![http://www.psc.edu/science/Madrid/images/2hmi_color-1400x1050.jpeg Slika: HIV reverse transcriptase]
  ![http://www.psc.edu/science/Madrid/images/2hmi_color-1400x1050.jpeg Slika: HIV reverse transcriptase]
  |}
  |}
-
Prepis poteka tako, da na obstoječi primer dodaja posamezne nukleotide, ki so komplementarni RNA matrici, torej katalizira proces, ki poteka v nasprotni smeri kakor [[Prepisovanje DNA v RNA|transkripcija]], od koder izvirata tako ime encima kot tudi procesa, ki ga katalizira -  reverzna transkripcija [http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/images/453169b-f1.2.jpg| (shema procesa)]: <sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[4]]]</sup>
+
Prepis poteka tako, da na obstoječi začetni oligonukleotid dodaja posamezne nukleotide, ki so komplementarni RNA-matrici, torej katalizira proces, ki poteka v nasprotni smeri kakor [[Prepisovanje DNA v RNA|transkripcija]], od koder izvirata tako ime encima kot tudi procesa, ki ga katalizira -  reverzna (obratna) transkripcija [http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/images/453169b-f1.2.jpg| (shema procesa)]: <sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[4]]]</sup>
-
* Reverzna transkriptaza omogoča prepis RNA verige v [[dsDNA|dsDNA]] (''double-stranded DNA'') - reverzna transkripcija.
+
* Reverzna transkriptaza omogoča prepis verige RNA v [[dsDNA|dsDNA]] (dvojnoverižna DNA, angl. ''double-stranded DNA'') - reverzna transkripcija.
* Najprej na podlagi matrične RNA sintetizira komplementarno verigo DNA - polimerazna funkcija encima.
* Najprej na podlagi matrične RNA sintetizira komplementarno verigo DNA - polimerazna funkcija encima.
-
* Že med sintezo cepi RNA verigo na krajše kose - PPT (''polypurine tract'').
+
* Že med sintezo cepi verigo RNA na krajše kose - PPT (angl. ''polypurine tract'').
* V nadaljnji sintezi druge verige DNA dobijo PPT-kosi vlogo primerja.   
* V nadaljnji sintezi druge verige DNA dobijo PPT-kosi vlogo primerja.   
-
Odkrila sta jo neodvisno drug od drugega Howard Temin, University of Wisconsin-Madison in David Baltimore, MIT (''Massachusetts Institute of Technology''). Skupaj z Renatom Dulbeccom so za ta dosežek leta 1975 prejeli Nobelovo nagrado.<sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[2]]]</sup>
+
Odkrila sta jo neodvisno drug od drugega Howard Temin (University of Wisconsin-Madison) in David Baltimore (MIT, ''Massachusetts Institute of Technology''). Skupaj z Renatom Dulbeccom so za ta dosežek leta 1975 prejeli Nobelovo nagrado.<sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[2]]]</sup>
Katalizira procese v:<sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[3]]]</sup>
Katalizira procese v:<sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[3]]]</sup>
-
* [[Retrovirus|retrovirusih]] - omogoča prepis virusne RNA na DNA gostitelja
+
* [[Retrovirus|retrovirusih]] - omogoča prepis virusne RNA v DNA, ki nato vstopi v genom gostitelja
-
* pararetrovirusih (hepadnavirusi - infekcije v jetrih živali, caulimovirusi - inficirajo rastline) - virusna genomska DNA se preko RNA prepiše na gostiteljevo
+
* pararetrovirusih (hepadnavirusi - infekcije v jetrih živali, kaulimovirusi - okužijo rastline) - virusna genomska DNA se preko RNA prepiše na gostiteljevo
-
* retrotransposonih, tj. [[transposon|transposonih]] oz. delih DNA, ki se premeščajo znotraj genoma; retrotransponosi se v genomu premeščajo s preko RNA intermediatov, katerih sintezo katalizira reverzna transkriptaza
+
* retrotranspozonih, tj. [[transpozon|transpozonih]] oz. delih DNA, ki se premeščajo znotraj genoma; retrotranspozoni se v genomu premeščajo preko RNA- intermediatov, katerih sintezo katalizira reverzna transkriptaza
-
* retronski [[msr DNA|msr DNA]] - omogoča sintezo [[msDNA|msDNA]] (multi-copy single-stranded DNA)
+
* retronski [[msr DNA|msr DNA]] - omogoča sintezo [[msDNA|msDNA]] (angl. ''multi-copy single-stranded DNA'')

Current revision

Reverzna transkriptaza je encim (EC 2.7.7.49), ki spada v razred transferaz. Katalizira podaljševanje DNA verige na 3'- koncu na osnovi RNA-matrice, torej omogoča prepis RNA na DNA (angl. RNA-directed DNA polymerase). Za začetek potrebuje že obstoječ začetni oligonukleotid (RNA ali DNA) – ne more ustvariti verige od začetka ("de novo").[1]

Kratka shema reakcije: deoksinukleozid-trifosfat + DNAn = difosfat + DNAn+1

Slika: HIV reverse transcriptase

Prepis poteka tako, da na obstoječi začetni oligonukleotid dodaja posamezne nukleotide, ki so komplementarni RNA-matrici, torej katalizira proces, ki poteka v nasprotni smeri kakor transkripcija, od koder izvirata tako ime encima kot tudi procesa, ki ga katalizira - reverzna (obratna) transkripcija (shema procesa): [4]

  • Reverzna transkriptaza omogoča prepis verige RNA v dsDNA (dvojnoverižna DNA, angl. double-stranded DNA) - reverzna transkripcija.
  • Najprej na podlagi matrične RNA sintetizira komplementarno verigo DNA - polimerazna funkcija encima.
  • Že med sintezo cepi verigo RNA na krajše kose - PPT (angl. polypurine tract).
  • V nadaljnji sintezi druge verige DNA dobijo PPT-kosi vlogo primerja.

Odkrila sta jo neodvisno drug od drugega Howard Temin (University of Wisconsin-Madison) in David Baltimore (MIT, Massachusetts Institute of Technology). Skupaj z Renatom Dulbeccom so za ta dosežek leta 1975 prejeli Nobelovo nagrado.[2]

Katalizira procese v:[3]

  • retrovirusih - omogoča prepis virusne RNA v DNA, ki nato vstopi v genom gostitelja
  • pararetrovirusih (hepadnavirusi - infekcije v jetrih živali, kaulimovirusi - okužijo rastline) - virusna genomska DNA se preko RNA prepiše na gostiteljevo
  • retrotranspozonih, tj. transpozonih oz. delih DNA, ki se premeščajo znotraj genoma; retrotranspozoni se v genomu premeščajo preko RNA- intermediatov, katerih sintezo katalizira reverzna transkriptaza
  • retronski msr DNA - omogoča sintezo msDNA (angl. multi-copy single-stranded DNA)


Viri

Zunanje povezave

Personal tools