Search results

*''Variabilna in konstantna domena:''

...ega proteina [Wiberg et al .2001]. Interakcija je z N-terminalne kroglasta domena kolagena VI kakor tudi interakcije z drugimi proteini. Kolagen VI se tudi v

• sredična domena s katalitično vlogo

...vrsto celic: prašičje monocite/ makrofage, kjer se veže na receptor CD163, domena SRCR5 (''ang.'' scavenger receptor cysteine-rich domain 5) pa predstavlja m ...nezrelih eritroblastov ter deluje kot hemoglobin-haptoglobinski receptor (domena SRCR3). Prosti hemaglobin je toksičen za celice, zato je pomembno, da ga m

• Patogena domena (P): zaradi le par spremenjenih aminokislinskih ostankov v tej domeni lahko • Variabilna domena (V): ta domena se najbolj razlikuje tudi pri viroidih, ki so si sorodni

...raj omenjene domene povezujejo presledkovni segmenti, ki so, tako kot tudi domena N3, strukturno neurejeni polipeptidi. ...silPS) ne glede na prisotnost PS divjega tipa. Ugotovitev, da je CTD tista domena, ki prepozna PS, ni v skladu s strukturnimi podatki obeh domen, saj NTD vse

...ostavljeno je tudi, da se kompleksi vežejo na DNA preko HMGbox (proteinska domena, vključena pri vezavi DNA). ...a. K slednjim uvrščamo različne družine encimov, vsem pa je skupna ATPazna domena. Preurejevalni strojčki sodelujejo pri podvojevanju DNA, transkripciji, po

.... osrednja domena iz dveh PRD (PTS regulacijska domena) in 3. C-terminalna domena. Njegovo delovanje je regulirano preko fosforilacije oz. defosforilacije PR

...erenciacija, regulacija celičnega cikla, produciranje spomina. RNA vezavna domena vsebuje 8 α-heličnih ponovitev, vsak izmed njih prepozna en nukleotid RNA ...razpolovni čas. Obratno kot DD deluje z ligandom inducirana degradacijska domena, ki kot že ime pove v prisotnosti male molekule pospeši razgradnjo fuzijs

...erenciacija, regulacija celičnega cikla, produciranje spomina. RNA vezavna domena vsebuje 8 α-heličnih ponovitev, vsak izmed njih prepozna en nukleotid RNA ...razpolovni čas. Obratno kot DD deluje z ligandom inducirana degradacijska domena, ki kot že ime pove v prisotnosti male molekule pospeši razgradnjo fuzijs

...težno (67 %) zvita v obliki α-vijačnice, pribl. 10 % je ß-strukture. Vsaka domena ima vsaj 2 dolga in en krajši zavoj. Molekulska masa znaša 66 kDa. Spada

...preko dodatne DNA vezavne domene. Rezultati so pokazali, da je DNA vezavna domena primernejša. Najnižji koncentraciji pri katerih je prišlo do popolne vez === DNA vezavna domena ===

...a - RT domena s funkcijo reverzne transkriptaze, na koncu pa se nahaja CTE domena. ...kDa. Ima štiri strukturne in funkcionalne domene: N-konec, TRBD domena, RT domena (funkcija reverzne transkriptaze) in C-konec. Regije TERT so pomembne za ak

...omskih zaporedij 3' terminalne regije nsp15 so ugotovili, da ima CoV EndoU domena zelo podobno zaporedje kot poli(U)- specifična endoribonukleaza iz organiz Do takrat je bila EndoU domena značilna le za viruse iz rodu ''Nidovirales'', v kasnejših raziskavah pa

...erov. Model celotnega proteina Par, vezanega na DNA, nakazuje, da osrednja domena CC posreduje pri nastanku Par A dimerov, ki se skozi interakcije med C-konc ...ijačnica 1. Vloga C-končne domene pri oligomerizaciji ni znana, vendar ima domena ključno vlogo pri aktivnosti StbA ''in vivo''.

...jem ter služi tudi kot prepoznavni element za PSTK in SepSecS. Akceptorska domena se nahaja v konfiguraciji 9/4, torej 9 bp v akceptorskem steblu in 4 bp v T ...c pri arhejah). Ker je za razliko od bakterijskega elongacijskega faktorja domena elongacijskega faktorja EFSec oz. aSelB prekratka, da bi se lahko neposredn

...otein-DNA in protein-protein [2]. TFE𝛽 vsebuje ohranjeni domeni WH in FeS. Domena WH TFE𝛼 tvori kontakt z navzgornjo nematrično verigo DNA in pomaga tvor ...a leži v interakcijah s terminacijskimi faktorji, na kar nakazuje NusG-KOW domena pri bakterijah.

...jo s katero se specifično veže na shRNA; primer take regije je RNA-vezavna domena (RBD) iz proteina Fox-1 [8]. * Ali se domena RBD iz proteina Fox-1 veže specifično na shRNA?

..., ki se pojavijo pri obeh tipih. V modularnih je N-končna encimsko aktivna domena (EAD) s kratko, fleksibilno verigo povezana s C-končno, ki je specifična ...a amidohidrolazna/peptidazna domena (PlyCCHAP) in N-acetilglukozaminidazna domena (PlyCGyH). Jedro PlyCGyH sestavlja struktura iz šestih α-heliksov, podobn

...veže z naslednjo stabilno domeno, t.j. DNA vezavna domena. Tretja stabilna domena verige je transaktivacijska, ki je pozicionirana na koncu vsake roke. P53 s

...domena NorR vsebuje vezavno mesto za NO. Če je NO vezan na NorR, N-končna domena ne preprečuje več vezave RNA polimeraze in prepisovanje genov je možno.

...domena NorR vsebuje vezavno mesto za NO. Če je NO vezan na NorR, N-končna domena ne preprečuje več vezave RNA polimeraze in prepisovanje genov je možno [

→ tRNA domena → mRNA domena

...da vsako podenoto sestavljata katalitična domena PD...D/ExK in DNA-vezavna domena, ki se nadalje deli na efektorsko in prepoznavno poddomeno ter spominja na ...er se ena domena odcepi od DNA, z drugo pa je encim še vedno vezan. Prosta domena se nato lahko ponovno veže na DNA, tudi na bolj oddaljeno mesto, pri čeme

...sko domeno. Če proteina med sabo interagirata, sta aktivacijska in vezavna domena dovolj blizu, da aktivirata transkripcijo genov: najpogosteje LacZ, kjer tr

...ko se ligand veže na receptor se fosforilira (serin ali treonin) citosolna domena. Fosforilirana oblika citoslne domene pa omogoči aktivacijo SMAD regulator

...tankov dolg protein, katerega glavna domena je bila identificirana kot PAZ domena. Prisotnost PAZ domene so odkrili tudi v proteinu AGO2 ter pokazali, da gr

...e in izvira iz ''Clostridium thermocellum''. Zamislili so si, da bi se CBD-domena vezala na celulozo, ki bi bila na filtru. Zato bi se organizmi, ki izražaj

...4 domen, med katerimi je za vezavo antraks toksina na receptorje pomembna domena PA4, zato predvidevajo, da je PA4 ključni antigen pri ojačitvi imunskega

...čnega transkripcijskega faktorja, kjer je bila spremenjena le aktivacijska domena. Za konec so želeli na transkripcijskem nivoju iz več vidikov določiti, V naslednji stopnji so želeli ugotoviti, katera aktivacijska domena bi lahko povzročila največjo transkripcijsko aktivnost. Sestavili so 5 ko

...ekula se veže na domeno na zunanji strani celične membrane. Znotrajcelična domena receptorja aktivira G protein, ki veže fosfatno skupino in iz GDP sintetiz

...sta N- in C- končni domeni, ki se ne prilegata DNA. Nespecifična nukleazna domena TALEN-ov, ki se nahaja na C-koncu proteinov, izvira iz endonukleaze ''Fok'' ...domeni določata zaporedje na DNA, ki ga TALEN prepozna in cepi. Nukleazna domena omogoča cepitev ene verige DNA, zato je potrebno pri uvajanju zlomov dvojn

Katalitična domena objema večinoma motiv IV, ki ima tudi ohranjeno skupno zaporedje. Večinom TRD domena prepozna, stabilizira in veže DNA, vendar njeno aminokislinsko zaporedje n

.../Hsp40 Hsp40] - vsebujejo zaporedja 70 aminokislinskih ostankov, znano kot domena J in igrajo pomembno vlogo pri uravnavanju ATP-azne aktivnosti Hsp70.

...je sestavljena iz 4-verižne β-plošče in iz 4 kratkih vijačnic. Globularna domena je vezana tako na sodčkasto domeno kot tudi na hidrofilne zanke usmerjene

...zavna domena (NTD; angl. N-terminal domain) in C-terminalna dimerizacijska domena (CTD; angl. C-terminal domain), ki sta povezani s Ser/Arg bogatim členom (

Celuloza vezavna domena je pogosto v uporabi na področju biotehnologije. Domeno združijo s tarčn

...epresor. Sestavljen je iz dveh domen (dimerizacijska domena in DNA-vezavna domena), vmes pa je prisotna povezovalna regija, ki bi se jo dalo spremeniti tako,

...vija v 4 različne domene. Domene I, II in III so primarne alfa vijačnice, domena IV pa oblikuje jelly-roll β-sodček, ki je pogosto prisoten v proteinih vi ...μ1N skrit znotraj hidrofobne votline, ki jo tvorijo domene I, II in III. Domena IV vsebuje anion-vezavno mesto, ki se poveže s fosfolipidnimi glavami v e

...rajo s povezovalno DNA in s tem povezujejo sosednje nukleosome, globularna domena histona pa ga veže na nukleosom. ...egijo imenovano kislinski obliž (acidic patch) na sosednjem nukleosomu, je domena histona H4. Ta se veže z 16-24 ostanki v kislinski obliž. Kislinski obli�

...nukleazna domena na C-koncu jo cepi, nato pa od Mg2+ odvisna HD-nukleazna domena do konca uniči ssDNA. Izpodrinjena veriga je tako uničena, ostane le še

...uporabljena v tem poskusu sta povezana preko 2A peptidne sekvence. Cepi ga domena, ki izhaja iz FokI endonukleaze. Ko je dvojna vijačnica popravljena pride

...dimerni obliki, je aktiven in nespecifično cepi molekulo DNA. DNA vezavna domena pa je sestavljena iz cinkovih prstov, to so približno 30 aminokislinskih o

...u je zakodirana tudi DNA-vezavna domena in včasih tudi endonukleazna (En) domena. ...o vijačnico DNA, intronski lariat se reverzno vstavi na zgornjo verigo, En domena proteina IEP pa cepi spodnjo verigo in predstavlja primer, ki se reverzno p

...ujemajoče bazne pare. Do dejanske tvorbe RNA sestavov pride, tako da se DD domena poveže z DD domeno druge RNA molekule (lahko je enaka, ni pa nujno) in s t ...ene poli-T odsek, kar prepreči aktivacijo PD domene, za katero je nujna DD domena. Monomer (d1 oz. d2') ni sposoben tvoriti osnovnega motiva in posledično R

...N- in C- terminalni domeni, ki se ne prilegata DNA. Nespecifična nukleazna domena TALEN-ov, ki se nahaja na C-koncu proteinov, izvira iz endonukleaze FokI te

Centralna domena proteina XPA (eksoni 3-5) se veže na poškodovani del DNA in RPA protein ( C-končna domena (ekson 6) se veže na TFIIH, mutacija na tem eksonu vodi do blažje oblike

...nikol in mesto začetka replikacije ColE1. Najprej je bila histidin kinazna domena ''envZ'' ligirana v ogrodje pPROTet in s tem so tvorili plazmid pPRO-HK. Fr ...isne aktivnosti in obstaja konstitutivna aktivnost, kadar je izražena samo domena histidin kinaze EnvZ, ali kadar ni inducirana presnovna pot PCB [1].

''Aktivna in DNA-vezavna domena SsCBF1''

...a veže na DNA, vendar Ku poveča hitrost vezave približno stokrat. C-končna domena DNA-PK glede na N-končno tvori klešče, skozi katere gre molekula DNA. In ...a fosforilacijo. Obadajata jo za PIKK značilni domeni: v N-terminalno smer domena FAT (»''FRAP-ATM-TRAPP''«), v C-terminalno smer pa FATC (»''FAT-C-termin