Search results

== Seznam projektov - v seznam se še ne vpisujte == ...na maksimalno dveh straneh, a ne sme vsebovati manj kot 350 besed (sem se ne šteje literatura).

'''Pravila za zaključne naloge na dodiplomskem in magistrskem študijskem programu Biokemija'''<br> Ta navodila veljajo za vse študente biokemije, ki boste svoje zaključne naloge poslali v pregled mentorjem od vključno 20.6.2022 dalje.

...odnja vprašanja morajo biti da, če niso, članom komisije utemeljite, zakaj ne. - Ali ste povsod uporabili decimalno vejico, ne pike?<br>

...uje povezave do slik in videov na spletu. Navedite do 5 ključnih virov (ti ne štejejo v vsoto 1200–1800 besed), ki ste jih uporabili. Če izjemoma sem ..., in vključite le malo splošnega uvoda, kjer je mogoče pa izpostavite ključne razlike v procesih med bakterijami, evkarionti in arhejami. Če seminar pre

...intezne biologije, v katerem so obdelana poglavja od osnov do kompleksnih, ne pa toliko aplikativnih, izvedb načel sintezne biologije. ...(ki pa imajo osnovno znanje s področja biokemije in molekularne biologije) ne morejo v celoti razumeti. S seznama 40 najbolj citiranih člankov s področ

...načrtovanju medproteinskih interakcij, uravnavanih s svetlobnimi stikali] (Neža Žerjav) ...intetične_alosterije_luciferaze_NanoLuc Inžiniring in izkoriščanje sintetične alosterije luciferaze NanoLuc] (Rebeka Dajčman)

Zelo moteče je, če se številka strani v dokumentu (na dnu strani) ne ujema s tisto v datoteki (ki jo prikazuje prikazovalnik). Tudi kazalo je v ...ode>, <code>16</code> zamenjamo z dejanskimi številkami strani, kjer se začne posamezni odsek. Številke so 0-based.

...je neka tema primerna za magistrsko nalogo in jo bo uvrstil na seznam ali ne.<br> Če mentor nima pedagoškega naziva (vsaj docent) oz. če ne sodeluje v pedagoškem procesu na UL FKKT, je treba študentu imenovati še

...zasnovali in preizkusili nov inovativen pristop za zdravljenje raka trebušne slinavke. ...ačilne za rakave celice) in sprožila celično smrt rakavih celic, hkrati pa ne bi škodovala zdravim celicam.

...o sestavljanja primosoma. Potek obeh kategorij se od nalaganja DnaB naprej ne razlikuje, oboji se zanašata na gostiteljsko holoecim polimerazo III za do .... Tako IncP Rep kot DnaA kooperativno oligomerizirajo ob vezavi na specifične ponovitve, kar ustvarja torzijske sile, ki vodijo v taljenje dvojne DNA vij

...lne naprave, vendar pa jih kljub tristopenjskem čiščenju, čistilne naprave ne zmorejo odstraniti [1]. ...siosira pseudonana. Thalassiosira pseudonana spada med diatomeje - enocelične alge, ki se nahajajo v sladkovodnih in morskih okoljih. Diatomeje rastejo s

...lo doma - so ocene tveganja za delo z GSO. S temi seminarji dobite 7 % končne ocene predmeta. ...se sklicujete na nek vir, a ste ga napisali sami, naj bo napisano s črno, ne z modro.

...vtoregulatorni sistem, kjer je preživetje celic odvisno od proizvodnje tarčne molekule. Sistem temelji na uporabi treh komponent: 1. tarčno specifičnem .... Kadar je aptamer v določeni konformaciji (lahko je ob vezavi liganda ali ne) onemogoča vezavo ribosoma in tako translacija ni mogoča. V primeru proiz

''(dopolnjeno 28. septembra 2020 in ne vsebuje sprememb, ki so bile uveljavljene po tem datumu)'' ...ima lahko največ 3 diplomante, lahko pa se odloči tudi za manj kot tri, če ne more zagotoviti kvalitetne izvedbe naloge (na primer na Katedri za biokemij

...o sestavljanja primosoma. Potek obeh kategorij se od nalaganja DnaB naprej ne razlikuje, oboji se zanašata na gostiteljsko holoecim polimerazo III za do .... Tako IncP Rep kot DnaA kooperativno oligomerizirajo ob vezavi na specifične ponovitve, kar ustvarja torzijske sile, ki vodijo v taljenje dvojne DNA vij

...i na eksperimentalnih opažanjih, da plazmidi s podobnim replikonom pogosto ne morejo stabilno obstajati v isti gostiteljski celici. Takšna plazmida se o ...dov po zapisu gena za relaksazo. Takšno razporejanje je ponovno omejeno in ne vključuje plazmidov, ki konjugativnega prenosa niso sposobni. Opisani klas

...kovin. Te lahko pridobimo iz mikroorganizmov, ki za rast uporabljajo različne substrate, kot so CO2, metan, odpadni materiali iz živilske industrije in ...MHET razgradi do TPA. Encimska razgradnja poteka zunaj celice, ker polimer ne more prehajati membrane, zato izločanje izraženih proteinov v gojišče i

...eksa ali za modifikacije kromatina. Prepisi tudi niso zaščiteni na koncih, ne potrebujejo izvenjedrnega transporta in so brez intronov. ...m med iniciacijo odpre glavni kanal RNAP, kar olajša vhod in izhod dvoverižne DNA, z zaprtjem pa prepreči pobeg DNA-RNA hibrida. Na konformacijo vplivaj

...rat povezane z njihovo velikostjo; manjši plazmidi zapisujejo za bolj sebične funkcije, večji plazmidi pa kodirajo tudi funkcije, ki lahko zmanjšajo me ...porablja energijo za njihovo vzdrževanje, jih nekateri opisujejo kot sebične elemente ali genetske parazite. Kljub temu pa so lahko kriptični plazmidi

Kljub veliki uporabnosti tega pristopa pa zaenkrat ne obstaja veliko orodij za ustvarjanje ko-kultur industrijsko pomembne kvasov ...sev j. Gledali so občutljivost različnih parametrov, in sicer velikost končne skupne populacije in njeno sestavo, čas gojenja kulture, stopnjo rasti vsa

...apljanje celotnega sistema transkripcije. Prav tako omogoča izražanje gena ne glede na stopnjo razvoja organizma [3]. ...rodošle na tem področju. Z uporabo različnih logičnih vrat bi lahko prišli ne le do aktivatorjev transkripcije v rastlinah, temveč tudi do represorjev i

na hmelj, pritisk v prostoru ter nanju ne vpliva pomanjkanje hranil. Kisline v hmelju bakterijah. Predpostavili so, da se različne funkcije (aktivnosti črpalke hmeljne kisline iz

...so nosijo megaplazmid pQBR10, so bile za 25% manj konkurenčne in manj uspešne v primerjavi s celicami, ki ni so imele tega plazmida. Po eksperimentalni e ...nižjo vsebnost GC parov kot gostiteljska bakterija. Čeprav plazmidni H-NS ne nadomestijo popolnoma endogenih H-NS, so pomembni za bakterijski fitnes, sa

...a in se lahko še spremeni, načeloma pa se termini do vključno 18. poglavja ne bodo spreminjali. ...ovi). Obseg seminarja naj bo <font color=red>2700 do 3000 besed </font>, a ne več kot 3500 besed. Seminarska naloga mora vsebovati najmanj tri slike, bo

...ujejo temperature višje od 1100 ^oC, mikroorganizmi jih načeloma ne morejo razgraditi. Znani so tudi kot bioakumulanti in imajo za človeka št **kolori/fluorimetrične

.... Tip III ima tubulinu podobne GTP-aze, ki prav tako delujejo preko dinamične polimerizacije mehanizma. ...(vsebuje HTH2 motiv) tvorita podobne komplekse in sicer, oba tvorita vijačne, obročaste strukture in povzročita upogib DNA.

...diagnoze. Zato so razvili čip za biološki test, ki bi lahko zaznal specifične znake na jetrnih rakavih celicah. Ta metoda je enostavna za uporabo, saj za Prvi korak, da imunska celica prepozna adenovirus in začne naslednje imunsko vedenje, je medsebojna povezava med receptorjem TLR9 na p

...ovanih konstruktov za proizvodnjo bistvenih proteinov za detoksikacije oljčne odpadne vode (OMW), nastajanje in izločanje prostih maščobnih kislin (an ...olimeri imajo podobne mehanske in fizikalne lastnosti kot različne sintetične plastike, kot sta polipropilen in polistiren. Predstavljajo trajnostni nač

...i imajo delujoče RNA-stikalo, ki omogoča izražanje gena ob prisotnosti tarčne RNA [1] ...A se lasnična zanka razvije in je ribosomu omogočena vezava. Izražanje tarčne RNA je pod kontrolo promotorja pLac. Tega se v laboratoriju inducira z doda

Konjugativni plazmidi so krožne molekule DNK, ki jih bakterije replicirajo med celično delitvijo in konjug ...rijskih sevov v zdravstvenih ustanovah. Čeprav so bile predlagane hipotetične interakcije med gostiteljem in mikroorganizmi (HMI), jih je bilo le malo ek

''Chlamydia trachomatis'' je bakterija, ki povzroča različne okužbe na sluzničnih mestih pri ljudeh, vključno z očesno konjunktivo, ...ko privede do resnih zapletov, kot je medenično vnetna bolezen, in dolgoročne posledice, kot sta neplodnost ali zunajmaternična nosečnost.

| 12 || Kako fosforilacija integrinov regulira celične stike in signalizacijo || Tonja Jeromelj || Martin Kresal || 28/10/20 || 31 ...a in se lahko še spremeni, načeloma pa se termini do vključno 18. poglavja ne bodo spreminjali.

...merov), ki se kopičijo na smetiščih ali pa jih sežgejo v sežigalnicah, ker ne obstaja metoda, s katero bi lahko tako plastiko ustrezno reciklirali [1]. ...pa nastanejo fragmenti, krajši od 17 C-atomov. Dolgoverižni alkani namreč ne morejo prehajati membrane z difuzijo, v membrani Pseudomonas fluorescens pa

...//wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Cellect Cellect - Fenotipsko stabilne celične linije] (Lucija Voga) Povzetki v slovenščini naj imajo 1200-1500 besed (viri v to vsoto ne štejejo). Povzetek je treba objaviti dva dni pred predstavitvijo do polno�

...radi kompleksnosti in raznolikosti te bolezni velikokrat nobena izmed njih ne zadošča. Novejše raziskave se zato veliko bolj osredotočajo na molekula ...imunski odziv, poleg tega pa še prilagojen imunski odziv, različne nekrotične faktorje in celice ubijalke.

...vi Teb. Natančnost SIQ so dokazali tudi z generiranjem druge stabilne celične linije s istim transgenom in vsemi komponentami SIQ razen pogonskega modula ...irokega sprektra celičnih linij. Poleg tega narava adenovirusa je taka, da ne pride do integracije v genom gostiteljskega organizma, kar sčasoma privede

...ina. Dizajnirali so silinker s cepitvenim mestom za MMP2 kot način specifične dostave do tumorskih celic, kjer je pogosto prisotno povečano izražanje m ...nta, medtem ko so ga zaznali v frakcijah spiranja, kar potrjuje, da se BSA ne adsorbira na površino.

...ki se uporabljajo v kmetijstvu. Vir te mikroplastike so velikokrat plastične zastirke za zatiranje pleveli in ogrevanje zemlje in gnojila s kontrolirani ...proizvodnimi procesi za plastike iz fosilnih virov. Težava proizvodnje takšne bioplastike je, da tradicionalen vir ogljika – sladkor, ni trajnosten vir

...ne. Nekatere glive kvasovke pa nimajo prisotnega gena za invertazo in tako ne morejo hidrolizirati saharoze. Te, tako imenovane, goljufive celice so v ce ...rati kooperacijo kot v tekočih gojiščih. V tekočih gojiščih je zaradi celične rasti prišlo do izrivanja kooperatorjev iz osvetljenih območij. Poleg teg

...preprečevanje ali obvladovanje virusnih okužb, kot je uporaba pesticidov, ne zagotavljajo zadostnih rezultatov za ustavitev upadanja populacij čebel [1 ...odoben proteinu Dicer. Dolge dsRNA molekule se cepijo na majhne interferenčne RNA (ang. small interfering RNA; siRNA) dolžine 21-22 baznih parov. Moleku

...rekombinacijo v ''Saccharomyces cerevisiae''. Ker v kvasovkah v večji meri ne pride do izražanja fagnih proteinov, v njih sestavljeni genomi nimajo veli ...divjega tipa, vendar ti fagi nimajo idealnih lastnosti za uporabo v klinične namene. V raziskavi, predstavljeni v tem seminarju, so Ipoutcha in sodelavc

...nskem inženiringu za konstrukcijo rekombinantne DNA in proizvodnjo enoverižne DNA ter predstavlja potencialno tarčo za razvoj protimikrobnih sredstev, s ...modul za replikacijo vodilne verige, mesto sso za začetek sinteze dvoverižne DNA na enoverižni zastajajoči verigi, DET za odpornost na antibiotike in

Skupaj ti rezultati kažejo, da visoko število kopij plazmidnih genov ne le optimizira obstoječe lastnosti, ampak tudi olajša evolucijo novih akti ...terijske rekombinaze lahko popravijo. Nekateri plazmidi imajo celo specifične gene za takšno popravilo, kar kaže, da je rekombinacijsko izogibanje gost

...stema segregacije, ki sta odvisna zgolj od enega DNA-vezavnega proteina in ne vključujeta NTPaz, sta prisotna v stafilokoknem plazmidu pSK1, kjer je DNA ...bS''. Pri oligomerizaciji StbA je ključna dolga α-vijačnica 1. Vloga C-končne domene pri oligomerizaciji ni znana, vendar ima domena ključno vlogo pri a

...hno podvrženi ciklom iztegovanja in umikanja, s čimer preiskujejo okolico, ne glede na prisotnost prejemnih celic. Po vzpostavitvi stika s prejemno celic ...- na delu nic, ki se nahaja na začetku tra genov (oriT) in rezanje enoverižne DNA (T-veriga), ki bo kasneje prenešena. Ti dve reakciji izvede TraI relak

...a sintetizirajo diTPS razreda II. V tem primeru nastane karbokation, ki začne reakcijo ciklizacije. Obstajajo tudi diterpen sintaze, ki so sposobne izvaj ...penov in s tem povečajo raznolikost diterpenoidov. Pri CYP je zanimivo, da ne izvajajo reakcij le na naravnih substratih, vendar tudi na molekulah, ki im

...ulucijski pritisk pogosto vodi do mutacije na teh genih in njihove posledične inaktivacije [1],[2]. Tretji pristop se osredotoči na pozitivno kontrolo e ...tevilo nastalih kolonij. Variante z le enim označenim genom so imele različne frekvence pobega, pri čimer je imel najnižjo frekvenco sev SPC110-ERdd (3

Na začetku 20. stoletja so bile raziskave osredotočene ne le na razumevanje vloge agrobakterij kot fitopatogena, temveč tudi na razi ...ksacijo dušika. Kljub temu pa lahko prisotnost plazmida v določenih vrstah ne povzroči fiksacije dušika, čeprav nastanejo na koreninah noduli.

Plazmidi, zunajkromosomske (običajno) krožne molekule DNA, spadajo poleg transpozonov, fagov in integronov med mobilne g ...i''. Njena prednost je, da lahko z njo uspešno izoliramo tudi plazmide, ki ne vsebujejo konvencionalnih selekcijskih markerjev.

...kov za samoprijavo in kliničnih razgovorov, na katerih pacienti velikokrat ne odgovarjajo resnično ravno zaradi strahu pred diagnozo z depresijo, saj š ...rtna, obstaja v lasni strukturi in drži dušilec blizu fluoroforja, tako da ne oddaja signala. Ko se ciljna miRNA veže na sondo, lahko hibridizacija cilj

...santinski reporterski sistem naj bi omogočal zaznavo s prostim očesom, saj ne temelji na fluorescenci, ampak na obarvanju in je tako primeren za enostavn ...a zmanjšal na 10 pM. V primerjavi s Sc-G1.0-Ca se je ''k'' povečal, vendar ne drastično, Kc pa se je signifikantno zmanjšal. Iz kinetičnih in statisti

...ionov napram kadmiju. Predvidena struktura EC20 je protein v obliki lasnične zanke, ki ga utrjuje 9 disulfidnih vezi. Sestavljen je iz 41 aminokislin (i ...terim lahko organizmi pridobijo nove genetske informacije iz drugih virov, ne le od svojih neposrednih prednikov. Ta proces bi lahko predstavljal težavo

...energetski industriji. Je učinkovit proizvajalec etanola, vitamina B2, mlečne kisline, hialuronske kisline, L-alanina, vitamina B11… <br/> ...skih metod. ''L. lactis'' je bolj varen za uporabo kot pa ''E. coli'', saj ne sintetizira močnih imunogenih lipopolisaharidov, ki povzročajo lokalne vn

...ša Sec na aktivno mesto ribosoma. Ker selenoproteini kažejo višje katalitične hitrosti in odpornost proti nepovratni oksidaciji, kar omogoča Sec-vsebujo ...kih molekulah, da bi zagotovili vezavo le na rekombinantno pripravljene in ne na naravne mRNA molekule. Te modificirane fuzijske molekule so poimenovali

...primarni energiji. Samo na Kitajskem poraba premoga za proizvodnjo električne energije za leto 2021 presega 1,57 milijarde ton, poraba zemeljskega plina .... Na Kitajskem slednja predstavlja kar 10–12 % celotne proizvodnje električne energije. Razsvetljava tako povzroča ogromno okoljsko škodo, zato je potr

...gira s tarčno molekulo, svojo regulatorno vlogo pa lahko opravlja na različne načine. Prvi način je že omenjeni motiv heliks-zavoj-heliks, drugi je fo ...alo konfiguracije. Ker so N-končne domene Rap_pLS20 zasedene, ta ne more interagirati z Rco_pLS20, torej Phr*_pLS20 inhibir

...nost integracije v genom, poleg tega pa jo lahko v celice vnesemo na različne načine: s transfekcijo z linearno, samopodvajajočo in cirkularno mRNA ter ...Kd = 1 nM), rezultati so bili podobni. Uporaba torej ni omejena na specifične pare aptamer-RNA-vezavni protein, ampak je ta princip splošno uporaben, po

...išlo dokler so TEV proteaze aktivne, to pa pomeni, da razgradnja proteinov ne mora biti regulirana v krajših časovnih intervalih. ...lic. Povišana količina CAR v teh celicah lahko v nekaterih primerih vodi v neželene stranske učinke zaradi prekomerne aktivacije, kot so npr. citokinsk

...ko rasti, sestavljeno iz faze (eksponentne) rasti, stacionarne faze in končne faze upada/smrti. Nadzorovano rast, delitev in vzdrževanje v kulturah sesa ...lin in zavora« bi naj omogočal spremenljivo pospeševanje in zaviranje celične rasti in tvorbe rekombinantnih proteinov. Za izdelavo tovrstnega sistema je

...je, ki lahko proizvajajo kalcit (CaCO3). Številne bakterijske vrste so zmožne precipitacije CaCO3, npr. žveplo-reducirajoče bakterije in tiste, ki vseb ...snov med segrevanjem ves čas tehtamo in lahko na ta način opazujemo različne procese kot so npr. fazni prehodi v materialu, adsorpcija in absorpcija, te

...movanju iGEM 2023. DARWINS je programska oprema za določanje idealne termične stabilnosti (Tm) proteinov v procesu njihove usmerjene evolucije. Motivacij #Izuriti model za napovedovanje termične stabilnosti in njegova prilagoditev za proteine Ago in mutantne seve.

Terapija z litijevimi spojinami povzroča kar nekaj neželenih stranskih učinkov. Vpliva lahko na prebavila, delovanje srca, ledv ...in izražanja genov. Ponavadi se nahajajo v regiji na 5'-koncu mRNA, ki se ne prevaja (UTR), tam pa tvori aptamerno strukturno domeno, ki je sposobna vez

...in sicer za faktor 2.5. IPTG je povzročil zelo podoben odziv. Meritve celične rasti za vse indukcijske pogoje so pokazale, da ekspresija gena za mišji p ...1 na MSI-1 in preko konformacijske spremembe MSI-1 prepreči prepoznavo tarčne RNA. Z eksperimentom, ki temelji na spremenjeni mobilnosti molekul pri elek

...ga mehanizma vklopijo ali izklopijo določene poti prenosa signala. Na celične procese pomembno vpliva asimetrija holesterola v plazemski membrani, ki se ...c. Njena nenormalna aktivacija lahko povzroči nastanek tumorjev. Pot se začne z aktivacijo RAS, do katere pride zaradi zunajceličnih signalov. RAS potem