BIO1-seminar 2011

Temelji biokemije- seminar

Seminarje vodi doc. dr. Gregor Gunčar in so na urniku vsak ponedeljek od 10:00 do 11:30.

Ocena seminarjev predstavlja ??% končne ocene in vsebuje vse točke, ki jih študent/ka lahko zbere pri seminarju in ostalih dejavnostih, ki niso del pisnega izpita.

Seznam seminarjev

Ime in priimek	Slovenski naslov članka	Faktor vpliva revije	Rok za oddajo	Rok za recenzijo	Datum predstavitve	Recenzent 1	Recenzent 2	Recenzent 3
BOTONJIĆ SANDI	Tioredoksinu podoben protein (TXNL2) ščiti kancerogene celice pred oksidativnim stresom	15.387	28.02.	03.03.	07.03.	RODE URŠKA	KERIN INES	OGRIS IZA
VRANKAR ANDREJ	Število lasno-mešičnih matičnih celic se v plešastem lasišču moških z androgeno alopecijo ohranja za razliko od števila CD200-rich in CD34-positive lasno-mešičnih predniških celic		28.02.	03.03.	07.03.	HROVAT KARMEN	BOHNEC IVO	JAVORŠEK KAJA
ZALAR MATJA	Protein p53		28.02.	03.03.	07.03.	OGRIS IZA	CRČEK MITJA	ZOTTEL ALJA
ZOTTEL ALJA	Vloga imunskega sistema pri aterosklerozi	31.434	07.03.	10.03.	14.03.	RADOJKOVIĆ MARKO	KERT DOMINIK	HROVAT KARMEN
DOLINAR ANA	Prirojena ali prilagodljiva imunost? Primer naravnih celic ubijalk	28	07.03.	10.03.	14.03.	RAUTER URŠKA	MOHAR MAŠA	VERBANČIČ JANA
RAUTER URŠKA	Razvojna vloga Srf, kortikalnega citoskeleta in celične oblike v orientaciji epidermalnega vretena	19.527	07.03.	10.03.	14.03.	MUSTAR JERNEJ	JAVORŠEK KAJA	MOHAR MAŠA
MOHAR MAŠA	Sladkorna bolezen tipa 2 kot bolezen imunskega sistema	30,006	14.03.	17.03.	21.03.	VENE ROK	RAUTER URŠKA	GORIČAN TJAŠA
POHLEVEN ŠPELA	Prioni	34	14.03.	17.03.	21.03.	KEPIC LEA	RADOJKOVIĆ MARKO	DOLINAR ANA
KEPIC LEA	Agonisti adrenoreceptorjev β2	34.48	14.03.	17.03.	21.03.	VRANKAR ANDREJ	BRATOVŠ ANDREJA	MUSTAR JERNEJ
KMETIČ MIRJAM	Celična regulacija metabolizma železa	5,371	14.03.	17.03.	21.03.	MARIĆ TAMARA	REMŠKAR MAJA	KOMAN KATRA
JARC VERONIKA	Eksperimentalni modeli za študijo imunobiologije hepatitisa C	3.26	14.03.	21.03.	28.03.	REMŠKAR MAJA	MUSTAR JERNEJ	KEPIC LEA
KOMAN KATRA	Pomen dendritskih celic (DCs) in celic ubijalk (NK) v imunskem odzivu na okužbo z virusom HIV-1	32.245	21.03.	25.03.	28.03.	ČUPOVIĆ VANA	KARNER TAJA	KMETIČ MIRJAM
OGRIS IZA	Zakaj imajo možgani glikogen?	5,125	14.03.	21.03.	28.03.	KNAPIČ EVA	BRGLEZ ŽIVA	VRANKAR ANDREJ
KERIN INES	Kanabinoidi za zdravljenje shizofrenije? Uravnotežena nevrokemična sestava za škodljive in terapevtske učinke uživanja konoplje	4.458	14.03.	21.03.	28.03.	ŠTOK ULA	ŠTEMBERGER ROK	KERT DOMINIK
VERBANČIČ JANA	Apoptozi podobna smrt v bakterijah, ki jo povzroča HAMLET, človeški mlečni lipidno-proteinski kompleks	4.351	21.03.	28.03.	04.04.	KARNER TAJA	ZOTTEL ALJA	KNAPIČ EVA
KNAPIČ EVA	Kako virusi vodijo delovanje celice.	14.101	21.03.	28.03.	04.04.	ZALAR MATJA	POHLEVEN ŠPELA	LORBEK SARA
REMŽGAR ANA	Črevesna absorpcija vitamina D ne poteka le s pasivno difuzijo: dokazi za vpletenost enakih transporterjev kot pri holesterolu	4.356	21.03.	28.03.	04.04.	BOTONJIĆ SANDI	LORBEK SARA	ČUPOVIĆ VANA
GRDADOLNIK MAJA	Jedrni in nejedrni receptorji za estrogene	5.328	21.03.	28.03.	04.04.	MOHAR MAŠA	REMŽGAR ANA	FRANKO NIK
JAVORŠEK KAJA	Potencial matičnih celic pri Parkinsonovi bolezni in molekularni faktorji za tvorbo dopaminskih nevronov	4.139	28.03.	04.04.	11.04.	GEC KARMEN	MARIĆ TAMARA	RADOJKOVIĆ MARKO
BRATOVŠ ANDREJA	Vloga GPCR v patologiji Alzheimerjeve bolezni	26	28.03.	04.04.	11.04.	ZOTTEL ALJA	ČUPOVIĆ VANA	GRDADOLNIK MAJA
CRČEK MITJA	Matične celice in njihova vloga pri zdravljenju bolezni in poškodb	7.365	28.03.	04.04.	11.04.	BOHNEC IVO	KMETIČ MIRJAM	BRATOVŠ ANDREJA
MARIĆ TAMARA	Organizacija jedra	9.58	28.03.	04.04.	11.04.	NAVODNIK URŠKA	GEC KARMEN	REMŠKAR MAJA
ŠTEMBERGER ROK	povečano izražanje in imunogenosti HIV proteinov po inaktivaciji encimske aktivnosti	3.616	04.04.	11.04.	18.04.	JAVORŠEK KAJA	VRANKAR ANDREJ	BOTONJIĆ SANDI
LORBEK SARA	Sovplivanje maščobnih kislin ter genov na adipokine in debelost	3.072	04.04.	11.04.	18.04.	POHLEVEN ŠPELA	KNAPIČ EVA	VENE ROK
REMŠKAR MAJA	Evolucijska dinamika transponibilnih elementov (TE) v majhnem RNA svetu	8.689	04.04.	11.04.	18.04.	KERIN INES	POVŠE KATJA	CRČEK MITJA
ČUPOVIĆ VANA	naslov		04.04.	11.04.	18.04.	REMŽGAR ANA	VERBANČIČ JANA	RODE URŠKA
RODE URŠKA	vpliv c-reaktivnega proteina na patogenezo simptomov metaboličnega sindroma	6.614	03.05.	06.05.	09.05.	GRDADOLNIK MAJA	ŠTEMBERGER ROK	MARIĆ TAMARA
RADOJKOVIĆ MARKO	Vpliv rakastih celic in sepse na izraženost krvnega proteina trombina	14.608	03.05.	06.05.	09.05.	FRANKO NIK	VENE ROK	POVŠE KATJA
VENE ROK	Spremembe nivoja metilacije DNA so sorazmerne s starostjo človeških možganov	7.386	03.05.	06.05.	09.05.	VERBANČIČ JANA	NAVODNIK URŠKA	ZALAR MATJA
FRANKO NIK	naslov		03.05.	06.05.	09.05.	xx	HROVAT KARMEN	BOHNEC IVO
HROVAT KARMEN	Ciljanje kemokinih receptorjev v alergijskih boleznih	5,155	04.05.	09.05.	16.05.	KERT DOMINIK	JARC VERONIKA	KARNER TAJA
AMBROŽIČ MATEVŽ	Termogene snovi in regulacija telesne teže	4,434	04.05.	09.05.	16.05.	LORBEK SARA	KEPIC LEA	REMŽGAR ANA
NAVODNIK URŠKA	Stabilnost RNA/DNA in DNA/DNA dupleksa vpliva na mRNA transkripcijo		04.05.	09.05.	16.05.	AMBROŽIČ MATEVŽ	ŠTOK ULA	ŠTEMBERGER ROK
BRGLEZ ŽIVA	Kompleks Mre11	42.198	09.05.	16.05.	23.05.	DOLINAR ANA	BOTONJIĆ SANDI	JARC VERONIKA
KARNER TAJA	[1]Alkohol omogoča lažje nalaganje CD1d molekul, s tem aktivira NKT celic in zmanjša pojavljanje sladkorne bolezni pri NOD miškah		12.05.	17.05.	23.05.	KOMAN KATRA	OGRIS IZA	NAVODNIK URŠKA
KERT DOMINIK	Kako osteokalcin vpliva na reprodukcijo organizmov		09.05.	16.05.	23.05.	GORIČAN TJAŠA	GRDADOLNIK MAJA	RAUTER URŠKA
MUSTAR JERNEJ	Odpornost srpastih celic na okužbo z plazmodijem	31	16.05.	23.05.	30.05.	JARC VERONIKA	AMBROŽIČ MATEVŽ	BRGLEZ ŽIVA
GEC KARMEN	Učinki vadbe in/ali dodajanja antioksidantov na izražanje genov endotelnih celic	3.469	16.05.	23.05.	30.05.	POVŠE KATJA	ZALAR MATJA	AMBROŽIČ MATEVŽ
GORIČAN TJAŠA	Molekulske tarče oksidativnega stresa	17,902	16.05.	23.05.	30.05.	KMETIČ MIRJAM	RODE URŠKA	POHLEVEN ŠPELA
BOHNEC IVO	Alzheimerjev gen poruši možganske povezave 50 let preden bolezen izbruhne.		23.05.	30.05.	06.06.	CRČEK MITJA	GORIČAN TJAŠA	ŠTOK ULA
ŠTOK ULA	Mutacija mitohondrijske DNA v povezavi z rakom debelega črevesa kot posledica abnormalnega delovanja citokroma c oksidaze		23.05.	30.05.	06.06.	BRGLEZ ŽIVA	DOLINAR ANA	KERIN INES
nihce	naslov		23.05.	30.05.	06.06.	BRATOVŠ ANDREJA	KOMAN KATRA	GEC KARMEN

Naloga

• samostojno pripraviti seminar, katerega osnova je znanstveni članek s področja biokemije, ki ga po želji izberete v reviji s področja biokemije, ki ima faktor vpliva večji kot 3 in je bil objavljen v letu 2011. Poleg tega članka morate za seminar uporabiti še najmanj pet drugih virov! http://www.cobiss.si/scripts/cobiss?command=CONNECT&base=JCR
• osnovni članek in naslov pošljete meni, najkasneje pet dni pred rokom za oddajo (rok-5), da ocenim, če je primeren za predstavitev. Naslov vpišete v tabelo, takoj ko ste si ga izbrali!
• Povzetek seminarja opišete na wikiju v približno 200 besedah - najkasneje do dne ko morate oddati seminar recenzentom. Povezave do slik so dobrodošle, niso pa nujne.
• Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
• Seminar pripravite v obliki seminarske naloge (pisava 12, enojni razmak, 2,5 cm robovi; važno je, da je obseg od 1800 do 2000 besed), vsebovati mora najmanj eno sliko. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko.
• Natisnjen seminar oddajte do roka vsakemu od recenzentov (docentu ga pošljite po e-pošti v formatu .doc ali .docx).
• Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke in podajo oceno pisnega dela, v predpisanem formatu elektronskega obrazca na internetu.
• Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 15 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni.
• Predstavitvi sledi razprava- 5 minut. Recenzenti podajo oceno predstavitve in postavijo vsak vsaj dve vprašanji.
• Na dan predstavitve morate docentu oddati končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu.
• Seminarska naloga in povzetek na wikiju morajo biti v slovenskem jeziku!

Ocenjevanje seminarjev

Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo [recenzentsko poročilo] na spletu.

Mnenje o predstavitvi

Vsak posameznik mora oceniti seminar, tako da odda svoje mnenje najkasneje v treh dneh po predstavitvi. Kdor na seminarju ni bil prisoten, mnenja ne sme oddati.

Urejanje spletnih strani na wikiju

Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.

Faktor vpliva

Faktor vpliva (angl. impact factor) neke revije pove, kolikokrat so bili v poprečju citirani članki v tej reviji v dveh letih skupaj pred objavo tega faktorja. Faktorje vpliva za posamezno revijo lahko najdete v COBISS-u. V polje "Naslov revije" vnesite ime revije za katero želite izvedeti faktor vpliva in pritisnite na gumb POIŠČI. V skrajnem desnem stolpcu se bodo izpisali faktorji vpliva za revije, ki ustrezajo vašim iskalnim kriterijem. Zadetkov za posamezno revijo je več zato, ker so navedeni faktorji vpliva za posamezno leto. Za leto 2011 faktorji vpliva še niso objavljeni, zato se orientirajte po faktorjih vpliva zadnjih par let. Če faktorja vpliva za vašo izbrano revijo ne najdete v bazi COBISS, potem izberite članek iz kakšne druge revije.

Citiranje virov

Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se v seminarju držite ene same. Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati. Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.

Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.).

Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue C. et al. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, letn. 317, str. 632-638.

Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.

Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)

V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne).

Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.