Deoksiribonukleaze
Deoksiribonukleaze
stran v izdelavi
Deoksiribonukleaze (DNaze) so encimi, ki katalizirajo hidrolizo fosfodiesterskih vezi v DNA. Spadajo v družino nukleaz. Njihova naloga je kataliza razgradnje poškodovanih, postaranih ali odvečnih nukleinskih kislin v procesih, ki so potrebni za splošno vzdrževanje reda v celici. Imamo različne tipe deoksiribonukleaz, ki se razlikujejo po delovanju na substrat, kemijskem mehanizmu in biološki funkciji.
Nekatere DNaze zelo indiskriminirano cepijo določeno ali drugo sekvenco DNA. Nekateri, kot restrikcijski encimi, pa so zelo specfični za eno področje. Lahko cepijo samo dvojne ali samo enojne vijačnice, lahko so aktivni na oboje.
DNaze, ki katalizirajo cepljenje končnih nukleotidov se imenujejo eksodeoksiribonukleaze (tip eksonukleaz). DNaze, ki cepijo notranje fosfodiesterske vezi so endodeoksiribonukleaze (tip endonukleaz).
DNaze razdelimo še na 3’-, ki cepijo a vezi (te povezujejo 3’- skupino nukleotida s fosfatno skupino) in 5’-, ki cepijo b vezi (te povezujejo 5’- skupino nukleotida s fosfatno skupino)
Endodeoksiribonukleaze se delijo še v Deoksiribonukleaze I , Deoksiribonukleaze II , Deoksiribonukleaze IV, UvrABC (multiencimski kompleks v bakteriji E.coli. Vpleten je v mehanizem popravljanja DNA), restrikcijske endonukleze in MNaze.
Deoksiribonukleaze I
DNaza I reže DNA predvsem pri fosfodiesterskih vezeh zraven pirimidinskega nukleotida. Pusti 5’-fosfatni konec polinukleotida s prosto hidroksidno skupino na 3’- poziciji. Deluje na enojno in dvojno vijačnico in kromatin. DNaza I se veže na protein aktin. V taki obliki je encmsko neaktivna. Mislijo, da je DNaza-aktin kompleks način shranjevanja DNaze, da ne poškoduje genetske informacije.
File:Deoksiribonukleaza na aktinu.jpg
Deoksiribonukleaza II
Ta hidrolizira vezi v nativni in denaturirani DNA. Produkti so 3’- fosfati. Aktivna je predvsem v kislem pH-ju. Imamo različne vrste : DNaze II alfa (DNaze II) in DNaze II beta (DLAD)
Restrikcijska endonukleaza
Restrikcijska endonukleaza prepozna specifična zaporedja baz v dvojni vijačnici DNA in katalizira hidrolizo obeh verig na vezavnem mestu ali v njegovi bližini. Restrikcijske endonukleaze se delijo na Tip I, Tip II in Tip III.
Encim DNaze je tudi uporaben pri zdravljenju cistične fibroze. Katalizira hidrolitičen razcep velikih molekul DNA v manjše nukleotidne fragmente in s tem zmanjšuje viskoznost sluzi, v kateri je raztopljena DNA.
Viri:
http://www.discoveriesinmedicine.com/images/mdis_0000_0002_0_img0065.jpg
Temelji Biokemije – Rodney Boyer
