RNaza H
RNaza H
Ribonukleaza H (RNaza H) je endonukleaza, torej encim, ki katalizira hidrolizo notranjih fosfoestrskih vezi v RNA. [1]. Najdemo jo lahko v evkariontskih in prokariontskih organizmih. RNaza H prepozna dupleks DNA-RNA in cepi RNA na naključnih mestih. Uporabljamo jo za odstranjevanje mRNA pri sintezi cDNA. Je standardni encim v tehnologiji rDNA.
RNaza H je bila prvič identificirana v telečjem timusu. Najbolje raziskan član družine Rnaze H pa je RNaza HI, ki jo najdemo v E.coli.
3-D struktura RNaze H je običajno sestavljena iz β-strukture, ki jo obdajajo α-vijačnice. Lahko pa, tako kot pri RNazi H, najdeni v virusu HIV-1, manjka ena od α-vijačnic, C-vijačnica, ki poveča sposobnost vezave. [2]. Njena molekulska masa je 18,5 kDa.<ref>http://www.neb.com/nebecomm/products/faqproductM0297.asp</ref>
RNaza H ima pomembno vlogo pri dozorevanju virusa HIV in je ena glavnih tarč farmacevtskih raziskav pri iskanju zdravila proti AIDSu. Pri procesu sinteze DNA v virusu je RNaza H del encima reverzna transkriptaza in degradira RNA v DNA-RNA hibridu. S tem osvobodi enoverižno DNA, komplementarno R sekvenci na 3' koncu mRNA retrotranspozona. Osvobojeni del verige DNA se premesti na 3' konec mRNA retrotranspozona, pri čemer se sinteza komplementarne verige DNA nadaljuje. [3].
Viri
- [1] R. Boyer: Temelji biokemije, stran 261-263
- [2] RNase H, Wikipedia
- [2] L. Ester: Aktivnost retrotranspozona Tpv2 u stanicama uročnjaka Arabidopsis thaliana L., stran 6
<ref>http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/</ref> <ref>http://en.wikipedia.org/wiki/RNase_H</ref> <ref>http://www.neb.com/nebecomm/products/faqproductM0297.asp</ref>
