Avidin: Difference between revisions

From Wiki FKKT
Jump to navigationJump to search
 
(7 intermediate revisions by 2 users not shown)
Line 1: Line 1:
=== Avidin ===
=== Avidin ===
'''Avidin''' je tetrameričen protein proizveden v ptičjih jajcevodih, plazilci in doživke pa ga odlagajo v beljak njihovih jajc. V kokošjem jajcu avidin predstavlja približno 0,05% skupnih proteinov oziroma beljakovin beljaka(približno 1,8 mg na jajce). Tetrameričen protein vsebuje štiri enake podenote(homotetramere) od katerih se lahko vsaka veže na biotin( Vitamin B<sub><small>7</small></sub>, vitamin H) z visoko afiniteto in specifičnostjo. Konstanta asociacije avidina je izmerjena na ''K''<sub>D</sub> ≈ 10<sup>-15</Sup> M zaradi tega je ena od najmočnejših nekovalentnih vezi.  
'''Avidin''' je tetrameren protein, ki se sintetizira v ptičjih jajcevodih, plazilci in doživke pa ga odlagajo v beljak njihovih jajc. V kokošjem jajcu avidin predstavlja približno 0,05 % skupnih proteinov beljaka (približno 1,8 mg na jajce). Tetramerni protein vsebuje štiri enake podenote(torej gre za homotetramer) od katerih se lahko vsaka veže na [[biotin]] (vitamin B<sub><small>7</small></sub>, vitamin H) z visoko afiniteto in specifičnostjo. Konstanta asociacije avidina za biotin je ''K''<sub>D</sub> ≈ 10<sup>-15</Sup> M - gre za eno najmočnejših znanih nekovalentnih vezi.  


V svoji tetramerni obliki ima avidin molekulsko maso 66-69 kDa. Deset odstotkov molekulske mase predstavljajo ogljikovi hidrati, ki so sestavljeni iz štirih do petih manoznih in treh N-acetilglukozaminskih ostankov.


V svoji tetraedrični obliki je avidin izmerjen na približno 66-69 kDa velikosti. Deset odstotkov molekulske mase je posledica vsebnosti ogljikovih hidratov v sestavi od štirih do petih manoz in treh N-acetilglukozamidnih ostankov. Ogljikovi hidrati avidina vsebujejo najmanj tri edinstvene oligosaharidne strukturne vrste, ki so si podobne po strukturi in sestavi.
=== Odkritje avidina ===
Avidin je odkril Esmond Emerson Snell. Pot do odkritja se je začela z ugotovitvijo, da so piščanci, ki so se hranili s surovim beljakom, imeli pomanjkanje biotina, kljub razpoložjivosti tega vitamina v svoji prehrani. Snell je pozneje izoliral sestavine jajčnega beljaka, odgovorne za vezavo biotina in v sodelovanju s Paulom Gyorgyem sta potrdila, da je bil izolirani protein vzrok pomanjkanja biotina. Včasih je bilo ime proteina avidalbumin (dobesedno, lačni albumin). Kasneje so ime proteina spremenili v avidin zaradi njegove sorodnosti z biotinom.


=== Odkritje Avidina ===
=== Uporaba avidina ===
Avidin je prvič odkril Esmond Emerson Snell. Pot do odkritja se je začela z ugotovitvijo, da so piščanci na prehrani surovega beljaka bili v pomanjkanju biotina, kljub razpoložjivosti vitamina v svoji prehrani. Zato je bilo sklenjeno, da je sestavni del beljaka izoliran biotin. Snell pozneje izolira sestavine jajčnega beljaka, odgovorne za vezavo biotina in v sodelovanju s Paul Gyorgyem, sta potrdila, da je bil izoliran protein vzrok pomanjkanja biotina. Včasih je bilo ime proteina avidalbumin (dobesedno, lačni albumin). Ime proteina je bilo kasneje spremenjeno na avidin, zaradi njegove sorodnosti z biotinom.
Zaradi moči in specifičnosti kompleksa avidin-biotin raziskovalci uporabljajo avidin kot sondo in afinitetni matriks v številnih raziskovalnih projektih. Raziskovalca Bayer in Wilchek sta razvila nove metode in reagente za biotinilacijo protiteles in drugih biomolekul, ki omogočajo uporabo avidin-biotinskega sistema v različnih biotehnoloških procesih. Danes avidin uporabljajo v različnih procesih, od raziskav do diagnostike z medicinskimi in farmacevtskimi pripomočki. Interakcijo avidin - biotin izkoriščajo v številnih biokemijskih testih, vključno s prenosom Western in tehniko ELISA.
 
=== Uporaba Avidina ===
Zavedajoč se moči in specifičnosti avidin-biotin kompleksa, so raziskovalci uporabljati avidin kot sondo in afiniteto matrike v številnih raziskovalnih projektih. Raziskovalca Bayer in Wilchek sta razvila nove metode in reagente za biotinilatna protitelesa in druge biomolekule, ki omogočajo prenos avidin-biotinskega sistema na različne biotehnološke procesih. Danes se avidin uporablja v različnih procesih, od raziskav do diagnostike z medicinskimi in farmacevtskimi pripomočki. Sorodnost avidin - biotin se izkorišča v obsežnih biokemičnih testih, vključno z Western blot, ELISA in ELISPOT.


=== Slike ===
=== Slike ===
 
* [http://www.rcsb.org/pdb/images/2c4i_bio_r_500.jpg Zgradba avidinskega tetramera]
Beljak kokošjih jajc [http://www.mahi.in/images/weight_loss/Egg_Whites.JPG]
* [http://160.114.99.91/astrojan/protein/pictures/avidin.gif Struktura kompleksa avidin-biotin] - prikazana je samo ena podenota avidina
Avidin-biotin struktura [http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/gallery/biggifs/70.gif]
Avidin [http://www.cryst.bbk.ac.uk/pps97/assignments/projects/rosano/vbp/biot.gif]
Biotin [http://www.worldofmolecules.com/supplements/biotin_b7.jpg]
Struktura biotina [http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/f/f9/Biotin_structure_JA.png]
Struktura avidina [http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/2/20/Biotin2.svg]


=== Viri ===
=== Viri ===
    * Nemška wikipedija, (2009) , http://de.wikipedia.org/wiki/Avidin
* Nemška wikipedija (2009) http://de.wikipedia.org/wiki/Avidin
    * Angleška wikipedija , (2009) , http://en.wikipedia.org/wiki/Avidin
* Angleška wikipedija (2009) http://en.wikipedia.org/wiki/Avidin
    * Podatki o avidinu , (2009) , http://www.worthington-biochem.com/AV/default.html
* Podatki o avidinu (2009) http://www.worthington-biochem.com/AV/default.html
    * Podatki o avidin-biotin povezavi , (2002) , http://www.bio.davidson.edu/courses/GENOMICS/method/biotin_avidin.html#
* Podatki o povezavi avidin-biotin (2002) http://www.bio.davidson.edu/courses/GENOMICS/method/biotin_avidin.html
    * Green, N. , (1975). (Avidin) Advances in Protein Chemistry 29, 85-133.
* Derivati avidina in uporaba le-teh (2007) http://www.patentstorm.us/patents/7217575/description.html
    * Kresge, N. , (2004). The Discovery of Avidin by Esmond E. Snell. J. Bio. Chem. 279
* Green, N. (1975) Avidin. Advances in Protein Chemistry 29, 85-133.
 
* Kresge, N. (2004) The discovery of avidin by Esmond E. Snell. J. Biol. Chem. 279




[[Category:LEX]]
[[Category:LEX]]

Latest revision as of 09:07, 19 February 2010

Avidin

Avidin je tetrameren protein, ki se sintetizira v ptičjih jajcevodih, plazilci in doživke pa ga odlagajo v beljak njihovih jajc. V kokošjem jajcu avidin predstavlja približno 0,05 % skupnih proteinov beljaka (približno 1,8 mg na jajce). Tetramerni protein vsebuje štiri enake podenote(torej gre za homotetramer) od katerih se lahko vsaka veže na biotin (vitamin B7, vitamin H) z visoko afiniteto in specifičnostjo. Konstanta asociacije avidina za biotin je KD ≈ 10-15 M - gre za eno najmočnejših znanih nekovalentnih vezi.

V svoji tetramerni obliki ima avidin molekulsko maso 66-69 kDa. Deset odstotkov molekulske mase predstavljajo ogljikovi hidrati, ki so sestavljeni iz štirih do petih manoznih in treh N-acetilglukozaminskih ostankov.

Odkritje avidina

Avidin je odkril Esmond Emerson Snell. Pot do odkritja se je začela z ugotovitvijo, da so piščanci, ki so se hranili s surovim beljakom, imeli pomanjkanje biotina, kljub razpoložjivosti tega vitamina v svoji prehrani. Snell je pozneje izoliral sestavine jajčnega beljaka, odgovorne za vezavo biotina in v sodelovanju s Paulom Gyorgyem sta potrdila, da je bil izolirani protein vzrok pomanjkanja biotina. Včasih je bilo ime proteina avidalbumin (dobesedno, lačni albumin). Kasneje so ime proteina spremenili v avidin zaradi njegove sorodnosti z biotinom.

Uporaba avidina

Zaradi moči in specifičnosti kompleksa avidin-biotin raziskovalci uporabljajo avidin kot sondo in afinitetni matriks v številnih raziskovalnih projektih. Raziskovalca Bayer in Wilchek sta razvila nove metode in reagente za biotinilacijo protiteles in drugih biomolekul, ki omogočajo uporabo avidin-biotinskega sistema v različnih biotehnoloških procesih. Danes avidin uporabljajo v različnih procesih, od raziskav do diagnostike z medicinskimi in farmacevtskimi pripomočki. Interakcijo avidin - biotin izkoriščajo v številnih biokemijskih testih, vključno s prenosom Western in tehniko ELISA.

Slike

Viri