Reverzna transkriptaza: Difference between revisions
From Wiki FKKT
Jump to navigationJump to search
Miha Virant (talk | contribs) No edit summary |
Miha Virant (talk | contribs) mNo edit summary |
||
| Line 1: | Line 1: | ||
'''Reverzna transkriptaza''' je encim [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html| (EC 2.7.7.49)], ki spada v razred transferaz. Katalizira podaljševanje DNA verige na 3'- koncu na osnovi RNA matrice, torej omogoča prepis RNA na DNA (en. RNA-directed DNA polymerase). Za začetek potrebuje že obstoječ RNA ali DNA primer – ne more ustvariti verige od začetka ("de novo" ).<sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[1]]]</sup> Kratka shema reakcije: deoxynucleoside triphosphate + DNA<sub>n</sub> = diphosphate + DNA<sub>n+1</sub> | '''Reverzna transkriptaza''' je encim [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html| (EC 2.7.7.49)], ki spada v razred transferaz. Katalizira podaljševanje DNA verige na 3'- koncu na osnovi RNA matrice, torej omogoča prepis RNA na DNA (''en. RNA-directed DNA polymerase''). Za začetek potrebuje že obstoječ RNA ali DNA primer – ne more ustvariti verige od začetka (''"de novo"'').<sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[1]]]</sup> Kratka shema reakcije: deoxynucleoside triphosphate + DNA<sub>n</sub> = diphosphate + DNA<sub>n+1</sub> | ||
Prepis poteka tako, da na obstoječi primer dodaja posamezne nukleotide, ki so komplementarni RNA matrici, torej katalizira proces, ki poteka v nasprotni smeri kakor [[Prepisovanje DNA v RNA|transkripcija]], od koder izvirata tako ime encima kot tudi procesa, ki ga katalizira - reverzna transkripcija [http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/images/453169b-f1.2.jpg| (shema procesa)]: <sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[4]]]</sup> | Prepis poteka tako, da na obstoječi primer dodaja posamezne nukleotide, ki so komplementarni RNA matrici, torej katalizira proces, ki poteka v nasprotni smeri kakor [[Prepisovanje DNA v RNA|transkripcija]], od koder izvirata tako ime encima kot tudi procesa, ki ga katalizira - reverzna transkripcija [http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/images/453169b-f1.2.jpg| (shema procesa)]: <sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[4]]]</sup> | ||
* Reverzna transkriptaza omogoča prepis RNA verige v dsDNA (double-stranded DNA) - reverzna transkripcija. | * Reverzna transkriptaza omogoča prepis RNA verige v dsDNA (''double-stranded DNA'') - reverzna transkripcija. | ||
* Najprej na podlagi matrične RNA sintetizira komplementarno verigo DNA - polimerazna funkcija encima. | * Najprej na podlagi matrične RNA sintetizira komplementarno verigo DNA - polimerazna funkcija encima. | ||
* Že med sintezo cepi RNA verigo na krajše kose - PPT (polypurine tract) - . | * Že med sintezo cepi RNA verigo na krajše kose - PPT (''polypurine tract'') - . | ||
* V nadaljnji sintezi druge verige DNA dobijo PPT-kosi vlogo primerja. | * V nadaljnji sintezi druge verige DNA dobijo PPT-kosi vlogo primerja. | ||
Odkrila sta jo neodvisno drug od drugega Howard Temin, University of Wisconsin-Madison in David Baltimore, MIT (Massachusetts Institute of Technology). Skupaj z Renatom Dulbeccom so za ta dosežek leta 1975 prejeli Nobelovo nagrado.<sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[2]]]</sup> | Odkrila sta jo neodvisno drug od drugega Howard Temin, University of Wisconsin-Madison in David Baltimore, MIT (''Massachusetts Institute of Technology''). Skupaj z Renatom Dulbeccom so za ta dosežek leta 1975 prejeli Nobelovo nagrado.<sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[2]]]</sup> | ||
Katalizira procese v:<sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[3]]]</sup> | Katalizira procese v:<sup>[[Reverzna transkriptaza#Viri|[3]]]</sup> | ||
| Line 24: | Line 24: | ||
* [http://www.pdb.org/pdb/static.do?p=education_discussion/molecule_of_the_month/pdb33_1.html Reverse Transcriptase, Molecule of the Month in September 2002] | * [http://www.pdb.org/pdb/static.do?p=education_discussion/molecule_of_the_month/pdb33_1.html Reverse Transcriptase, Molecule of the Month in September 2002] | ||
* [http://www.brenda-enzymes.org/php/result_flat.php4?ecno=2.7.7.49 Reverse transcriptase in BRENDA database] | * [http://www.brenda-enzymes.org/php/result_flat.php4?ecno=2.7.7.49 Reverse transcriptase in BRENDA database] | ||
* [http://www.expasy.org/cgi-bin/nicezyme.pl?2.7.7.49 Reverse transcriptase in ExPasy Proteomics Server] | |||
Revision as of 21:38, 12 December 2010
Reverzna transkriptaza je encim (EC 2.7.7.49), ki spada v razred transferaz. Katalizira podaljševanje DNA verige na 3'- koncu na osnovi RNA matrice, torej omogoča prepis RNA na DNA (en. RNA-directed DNA polymerase). Za začetek potrebuje že obstoječ RNA ali DNA primer – ne more ustvariti verige od začetka ("de novo").[1] Kratka shema reakcije: deoxynucleoside triphosphate + DNAn = diphosphate + DNAn+1
Prepis poteka tako, da na obstoječi primer dodaja posamezne nukleotide, ki so komplementarni RNA matrici, torej katalizira proces, ki poteka v nasprotni smeri kakor transkripcija, od koder izvirata tako ime encima kot tudi procesa, ki ga katalizira - reverzna transkripcija (shema procesa): [4]
- Reverzna transkriptaza omogoča prepis RNA verige v dsDNA (double-stranded DNA) - reverzna transkripcija.
- Najprej na podlagi matrične RNA sintetizira komplementarno verigo DNA - polimerazna funkcija encima.
- Že med sintezo cepi RNA verigo na krajše kose - PPT (polypurine tract) - .
- V nadaljnji sintezi druge verige DNA dobijo PPT-kosi vlogo primerja.
Odkrila sta jo neodvisno drug od drugega Howard Temin, University of Wisconsin-Madison in David Baltimore, MIT (Massachusetts Institute of Technology). Skupaj z Renatom Dulbeccom so za ta dosežek leta 1975 prejeli Nobelovo nagrado.[2]
Katalizira procese v:[3]
- retrovirusih - omogoča prepis virusne RNA na DNA gostitelja
- pararetrovirusih (hepadnavirusi - infekcije v jetrih živali, caulimovirusi - inficirajo rastline) - virusna genomska DNA se preko RNA prepiše na gostiteljevo
- retrotransposonih, tj. transposonih oz. delih DNA, ki se premeščajo znotraj genoma; retrotransponosi se v genomu premeščajo s preko RNA intermediatov, katerih sintezo katalizira reverzna transkriptaza
- retronski msr DNA - omogoča sintezo msDNA (multi-copy single-stranded DNA)
Viri
- [1] http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/7/49.html
- [2] http://www.nature.com/nature/journal/v453/n7192/fig_tab/453169b_F1.html
- [3] http://en.wikipedia.org/wiki/Reverse_transcriptase
- [4] http://pfam.sanger.ac.uk/family?acc=PF00078
