Molekularna biologija

Predmet 2. letnika študijskega programa Biokemija. Izvaja se v poletnem semestru. Ima 45 h predavanj, 20 h semnarjev in 10 h laboratorijskih vaj, skupaj 5 kreditnih točk ECTS.

Nosilec predmeta: doc. dr. Marko Dolinar. Temi Dinamika proteinske strukture in Povezava struktura - funkcija predava doc. dr. Gregor Gunčar.

Urnik predavanj in seminarjev: sreda 10h - 12h in petek 11h - 13h v veliki predavalnici IJS.

Razpored vaj bo objavljen kasneje. Vaje bomo predvidoma izvedli v zadnjem tednu maja in prvem tednu junija (10 h).

Izpitni roki: 27.6., 6.7., 30.8. in 23.9. 2011.
Delnih izpitov ne bo.

Teme predavanj

1. Mehanizem podvojevanja DNA (4P)
2. Rekombinacija in popravljanje mutacij (4P)
3. Transkripcija in posttranskripcijski procesi (5P)
4. Genetski kod in tRNA (2P)
5. Ribosomi in translacija (5P)
6. Struktura kromosomov in organizacija genoma (2P, 2S)
7. Kontrola izražanja pri prokariontih (4P, 4S)
8. Kontrola izražanja pri evkariontih (2P, 2S)
9. Usmerjanje proteinov in posttranslacijske modifikacije (4P, 2S)
10. Razgradnja proteinov (3P)
11. *Dinamika proteinske strukture (2P, 4S)
12. *Primeri povezave med strukturo in delovanjem proteina (2P, 4S)
13. Virusi (2P, 2S)
14. Čutila (4P)

(P = predavanje, S = seminar) * predava G. Gunčar

Teme seminarjev

Seminarji bodo vključeni v termine predavanj, obdelali pa bomo poglavja, ki se navezujejo na snov predavanj oziroma jo dodatno ilustrirajo. En teden bo namenjen skupnemu delu na isto temo, ki bo letos Epigenetsko uravnavanje izražanja genov. Temo bomo razdelali z več vidikov, delo pa bo potekalo v manjših skupinah. Skupine bodo predstavile svoja poglavja na spletu in s kratkim (ustrezno slikovno podprtim) nastopom v predavalnici.

Teme laboratorijskih vaj

Navodila za vaje boste dobili pred začetkom vaj, to bo predvidoma v mesecu aprilu. Predvidene teme so:

• Plazmidi in transformacija bakterijskih celic
• Laktozni operon in alfa-komplementacija
• Utišanje genov

Ocenjevanje

Ocena je sestavljena iz 10 % za seminar (pol za pisni del na wikiju, pol za predstavitev), 20 % za vaje in 70 % za teorijo. Čeprav ti deleži na videz niso usklajeni z deleži kontaktnih ur, del ocene iz teorije vključuje znanje s seminarskih predstavitev in bodo vprašanja vključena v zaključni izpit. Pol ocene iz vaj bo predstavljalo sodelovanje pri vajah in poročila z vaj, druge pol pa odgovori na vprašanja z vaj, ki bodo dodana zaključnemu izpitu. Popravljanje ocene je možno samo s ponovnim pisanjem izpita (ki vključuje seminarske teme in vprašanja z vaj). Primer sestavljanja ocene:

Literatura

Voet & Voet: Biochemistry, 3. izdaja. Wiley, 2004. - Tema tega predmeta je 5. del knjige, poglavja 29-34. Temi, ki ju bo predstavil doc. Gunčar, sta opisani v poglavjih 8 in 9 iste knjige. Tema Čutila bo povzeta po učbeniku Berg, Tymoczko & Stryer: Biochemistry, 5. izdaja (Freeman, 2001). Učite se lahko tudi po novejših verzijah istih dveh učbenikov.