Nukleaza S1: Difference between revisions
No edit summary |
No edit summary |
||
| Line 1: | Line 1: | ||
[ | [[Encim]] nukleaza S1 je [[endonukleaza]], ki katalizira cepitev fosfodiestrskih vezi med [[nukleinske kisline|nukleinskimi kislinami]]. Pogosto se uporablja v laboratoriju pri [[molekularna biologija|molekularni biologiji]]. | ||
Njena molska masa je ~31 kDa. Ob določanju aminokslinskega zaporedja nukleaze S1 je bilo potrjeno, da je [ | Njena molska masa je ~31 kDa. Ob določanju aminokslinskega zaporedja nukleaze S1 je bilo potrjeno, da je [[monomer]], torej iz ene polipeptidne verige. Ta je dolga 267 aminokislinskih ostankov z N-glikoziliranim [[Asn]] na mestih 92 in 228. | ||
== Funkcije nukleaze S1 == | == Funkcije nukleaze S1 == | ||
| Line 10: | Line 10: | ||
- Redko cepi tudi dsDNA (dvojna), če so prisotne zareze<br /> | - Redko cepi tudi dsDNA (dvojna), če so prisotne zareze<br /> | ||
Optimalni [ | Optimalni [[pH]] njenega delovanja je med 4.0 – 4.6, aktivira pa se ob prisotnosti Zn<sup>2+</sup> ionov (nukleazo S1 izolirano iz ''Neurospore crassa'' aktivirajo tudi Ca<sup>2+</sup> ioni). [[Inhibitorji]], ki zavirajo njeno aktivnost so: kovinski kelatorji – EDTA in citrati, ter visoke koncentracije [[NaDS]] (SDS). Inhibira pa se lahko tudi v nizkih koncentracijah spojin, ki vsebujejo fosfate. Encim se deaktivira pri 10 minutnem segrevanju na 70°C, v prisotnosti EDTA (ta nase veže proste kovinske ione). | ||
Encim nukleaze S1 se večinoma pridobiva iz plesni [ | Encim nukleaze S1 se večinoma pridobiva iz plesni [[''Aspergillus Oryzae'']].<br /> | ||
[ | [[EC številka]]: 3.1.30.1 | ||
== Alternativni imeni == | == Alternativni imeni == | ||
| Line 35: | Line 35: | ||
SPLET:<br /> | SPLET:<br /> | ||
http://www.molecularstation.com/dna/s1-mapping/<br /> | http://www.molecularstation.com/dna/s1-mapping/<br /> | ||
Revision as of 22:49, 2 January 2013
Encim nukleaza S1 je endonukleaza, ki katalizira cepitev fosfodiestrskih vezi med nukleinskimi kislinami. Pogosto se uporablja v laboratoriju pri molekularni biologiji. Njena molska masa je ~31 kDa. Ob določanju aminokslinskega zaporedja nukleaze S1 je bilo potrjeno, da je monomer, torej iz ene polipeptidne verige. Ta je dolga 267 aminokislinskih ostankov z N-glikoziliranim Asn na mestih 92 in 228.
Funkcije nukleaze S1
- Selektivno cepi enoverižno DNA in RNA, s petkrat večjo aktivnostjo na DNA
- Odceplja enoverižne konce dvoverižni DNA (dsDNA) in tako tvori tope konce (to se rabi npr. pri sintezi cDNA iz mRNA
- Mapiranje transkriptov (identificira 5' in 3' konce gena
- Linearizira dodatno zvite plazmide
- Specifično cepi antikodone tRNA
- Redko cepi tudi dsDNA (dvojna), če so prisotne zareze
Optimalni pH njenega delovanja je med 4.0 – 4.6, aktivira pa se ob prisotnosti Zn2+ ionov (nukleazo S1 izolirano iz Neurospore crassa aktivirajo tudi Ca2+ ioni). Inhibitorji, ki zavirajo njeno aktivnost so: kovinski kelatorji – EDTA in citrati, ter visoke koncentracije NaDS (SDS). Inhibira pa se lahko tudi v nizkih koncentracijah spojin, ki vsebujejo fosfate. Encim se deaktivira pri 10 minutnem segrevanju na 70°C, v prisotnosti EDTA (ta nase veže proste kovinske ione).
Encim nukleaze S1 se večinoma pridobiva iz plesni ''Aspergillus Oryzae''.
EC številka: 3.1.30.1
Alternativni imeni
- Deoksiribonukleaza S1
- Endonukleaza S1
Viri
STROKOVNI ČLANKI:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC334256/pdf/nar00229-0225.pdf
http://www.jbc.org/content/250/22/8848
KATALOGI RAZNIH PODJETIJ:
http://www.sigmaaldrich.com/etc/medialib/docs/Sigma/Datasheet/4/n5661dat.Par.0001.File.tmp/n5661dat.pdf
http://www.thermoscientificbio.com/uploadedFiles/Resources/EN032_TS_5.pdf
http://www.thermoscientificbio.com/dna-and-rna-modifying-enzymes/s1-nuclease/
http://www.worthington-biochem.com/nucs1/default.html
BAZE:
http://www.uniprot.org/uniprot/P24021
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/1939022
