BIO2 Seminar 2022: Difference between revisions
No edit summary |
No edit summary |
||
Line 130: | Line 130: | ||
|- | |- | ||
! Patricija Kolander | ! Patricija Kolander | ||
| 23 || | | 23 || Vpliv metabolitov črevesnega mikrobioma na apetit || Sofija Stevanović || Lara Zupanc || 06/01/21 || 09/01/21 || 11/01/21 | ||
|} | |} | ||
Revision as of 11:56, 28 December 2022
Biokemijski seminar
doc. dr. Gregor Gunčar, K2.022
Seznam seminarjev
ime in priimek | poglavje | naslov seminarja | recenzent 1 | recenzent 2 | datum oddaje | datum recenzije | datum predstavitve |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Tinkara Korošec | 12 | Vpliv bakterijskega oponašanja evkariontskih signalih molekul na človeka | Martin Kresal | Lena Kogoj | 24/10/20 | 25/10/20 | 26/10/20 |
Marcel Tušek | 12 | Pomembnost mitofagije, njena vloga ter korelacija z Atg32 receptorjem | Laura Trček | Naja Pečovnik Wutt | 24/10/20 | 25/10/20 | 26/10/20 |
Pia Kristanc | 12 | Toksini kot inhibitorji ionskih kanalov | Filip Petrovič | Matija Novel | 24/10/20 | 25/10/20 | 26/10/20 |
Samo Pucihar | 12 | Vpliv dopaminskega D1 receptorja na raka | Patricija Kolander | Sofija Stevanović | 24/10/20 | 25/10/20 | 26/10/20 |
Luka Fink | 12 | Kako fosforilacija integrinov regulira celične stike in signalizacijo | Tonja Jeromelj | Martin Kresal | 28/10/20 | 31/10/20 | 02/11/20 |
Tin Vranješ | 12 | Strukturni pogled signalizacije z G proteini povezanih receptorjev v zunanjem segmentu paličice | Marcel Tušek | Laura Trček | 28/10/20 | 31/10/20 | 02/11/20 |
Lucija Kovaček | 12 | Nekroptoza in njena vloga pri raku | Pia Kristanc | Filip Petrovič | 28/10/20 | 31/10/20 | 02/11/20 |
Mark Varlamov | 12 | GPCR-nadzorovana kemotaksa v amebah vrste D. discoideum | Samo Pucihar | Patricija Kolander | 28/10/20 | 31/10/20 | 02/11/20 |
Klemen Justin | 14-15 | Luka Fink | Tonja Jeromelj | 04/11/20 | 07/11/20 | 09/11/20 | |
Teja Mohar | 14-15 | Encimi za popravilo metabolitov | Tin Vranješ | Marcel Tušek | 04/11/20 | 07/11/20 | 09/11/20 |
Tea Amidović | 14-15 | Karakterizacija glikoproteoma | Lucija Kovaček | Pia Kristanc | 04/11/20 | 07/11/20 | 09/11/20 |
Taja Pojbič | 14-15 | Pentoza-fosfatna pot in rak | Mark Varlamov | Samo Pucihar | 04/11/20 | 07/11/20 | 09/11/20 |
Deni Krašna | 16 | Krebsov cikel - zvezdišče viroimunometabolizma | Klemen Justin | Luka Fink | 11/11/20 | 14/11/20 | 16/11/20 |
Zara Bunc | 16 | Krebsov cikel kot tarča za zdravljenje raka | Teja Mohar | Tin Vranješ | 11/11/20 | 14/11/20 | 16/11/20 |
Urša Lah | 16 | Acetil CoA in kromatin | Tea Amidović | Lucija Kovaček | 11/11/20 | 14/11/20 | 16/11/20 |
Žiga Koren | 16 | Vloga intermediatov krebsovega cikla pri zaščiti pred ishemijo | Taja Pojbič | Mark Varlamov | 11/11/20 | 14/11/20 | 16/11/20 |
Tim-David Agrež | 17 | Trenutni dosežki raziskav lncRNA v lipidnem metabolizmu in signalizaciji | Deni Krašna | Klemen Justin | 18/11/20 | 21/11/20 | 23/11/20 |
Aleš Poljanšek | 17 | Ketonska telesca in njihov vpliv na nevrodegenerativne bolezni | Zara Bunc | Teja Mohar | 18/11/20 | 21/11/20 | 23/11/20 |
Tonja Jeromelj | 17 | Alteracije lipidnega metabolizma v rakavih matičnih celicah | Urša Lah | Tea Amidović | 18/11/20 | 21/11/20 | 23/11/20 |
Miha Tomšič | 17 | Žiga Koren | Taja Pojbič | 18/11/20 | 21/11/20 | 23/11/20 | |
Leila Bohorč | 18 | Katabolizem lizina pri rastlinah: vloga saharopinske poti pri odzivu na abiotski in biotski stres | Tim-David Agrež | Deni Krašna | 25/11/20 | 28/11/20 | 30/11/20 |
Teo Trost | 18 | Oslabljen metabolizem razvejanih aminokislin | Aleš Poljanšek | Zara Bunc | 25/11/20 | 28/11/20 | 30/11/20 |
Ivana Stojić | 18 | Motnje cikla sečnine v povezavi z zgodnjimi znaki raka | Tinkara Korošec | Urša Lah | 25/11/20 | 28/11/20 | 30/11/20 |
Lara Rajterič | 18 | Vloga metabolizma razvejanih aminokislin pri zdravljenju raka | Miha Tomšič | Žiga Koren | 25/11/20 | 28/11/20 | 30/11/20 |
Primož Šenica Pavletič | 19 | Mehanizmi mitohondrijske respiratorne prilagoditve | Leila Bohorč | Tim-David Agrež | 02/12/20 | 05/12/20 | 07/12/20 |
Špela Auer | 19 | Kompleks II sukcinat dehidrogenaza | Teo Trost | Aleš Poljanšek | 02/12/20 | 05/12/20 | 07/12/20 |
Gal Kastelic | 19 | Sestavljalne poti kompleksov oksidativne fosforilacije | Ivana Stojić | Tinkara Korošec | 02/12/20 | 05/12/20 | 07/12/20 |
Tim-David Agrež | 17 | Trenutni dosežki raziskav lncRNA v lipidnem metabolizmu in signalizaciji | Deni Krašna | Klemen Justin | 02/12/20 | 05/12/20 | 07/12/20 |
Taja Mužič | 20 | ROS in njihova vloga v rastlinah | Primož Šenica Pavletič | Leila Bohorč | 09/12/20 | 12/12/20 | 14/12/20 |
Mia Kobal | 20 | Zgradba in delovanje rubisca, najpogostejšega encima | Špela Auer | Teo Trost | 09/12/20 | 12/12/20 | 14/12/20 |
Laura Simonič | 20 | Prilagoditev tilakoidnih membran na spremembe svetlobe | Gal Kastelic | Ivana Stojić | 09/12/20 | 12/12/20 | 14/12/20 |
Karin Rak | 20 | Manipulacija rastlin proti višjim izkoristkom fotosinteze preko fotorespiracije | Miljan Trajković | Lara Rajterič | 09/12/20 | 12/12/20 | 14/12/20 |
Ula Mikoš | 21 | Sintezna pot in funkcija vitamina E | Taja Mužič | Primož Šenica Pavletič | 16/12/20 | 19/12/20 | 21/12/20 |
Lara Zupanc | 21 | Sinteza vitamina D in njegova vloga pri imunskem sistemu | Mia Kobal | Špela Auer | 16/12/20 | 19/12/20 | 21/12/20 |
Lena Kogoj | 21 | Lipidi SPM in njihova vloga pri delovanju imunskega sistema | Laura Simonič | Gal Kastelic | 16/12/20 | 19/12/20 | 21/12/20 |
Naja Pečovnik Wutt | 22 | Biosinteza pirimidinskih nukleotidov kot tarča za protivirusno kemoterapijo | Karin Rak | Miljan Trajković | 16/12/20 | 19/12/20 | 21/12/20 |
Matija Novel | 22 | Dopaminski transporter: regulacija in mehanizem interakcije z dopaminom | Ula Mikoš | Taja Mužič | 30/12/20 | 02/01/21 | 04/01/21 |
Sofija Stevanović | 22 | Vpliv prekomernega izražanja RRM2 na odpornost na kemoterapijo | Lara Zupanc | Mia Kobal | 30/12/20 | 02/01/21 | 04/01/21 |
Martin Kresal | 23 | Lena Kogoj | Laura Simonič | 30/12/20 | 02/01/21 | 04/01/21 | |
Miljan Trajković | 23 | Naja Pečovnik Wutt | Karin Rak | 30/12/20 | 02/01/21 | 04/01/21 | |
Filip Petrovič | 23 | Matija Novel | Ula Mikoš | 06/01/21 | 09/01/21 | 11/01/21 | |
Patricija Kolander | 23 | Vpliv metabolitov črevesnega mikrobioma na apetit | Sofija Stevanović | Lara Zupanc | 06/01/21 | 09/01/21 | 11/01/21 |
- številka v okencu za temo pomeni poglavje v Lehningerju, v katerega naj izbrana tema spada
Razporeditev je začasna in se lahko še spremeni, načeloma pa se termini do vključno 18. poglavja ne bodo spreminjali. Prosim, da mi sporočite morebitne napake ali če vas nisem razporedil.
Gradivo za predavanja
Gradivo za predavanja in seminarje najdete na http://bio.ijs.si/~zajec/bio2/ username: bio2 password: samozame
Naloga
Vaša naloga za seminar je:
Samostojno pripraviti seminar o seminarski temi, ki vam je bila dodeljena. Za osnovo morate vzeti pregledni članek iz revije, ki ima faktor vpliva nad 5 (npr. TIBS. Poiskati morate še vsaj tri znanstvene članke, ki se nanašajo na opisano temo, in jih uporabiti kot podlago za seminarsko nalogo! Članki so dostopni tukaj.
Za pripravo seminarja velja naslednje:
- Povzetek seminarja opišete na wikiju v 200 besedah (+- dvajset besed) - najkasneje do dne, ko morate oddati seminar recenzentom. Pvzetek je tudi del pisnega izdelka.
- Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
- Seminar pripravite v obliki seminarske naloge na ~5–12 straneh A4 (pisava 12, enojni razmak, 2,5 cm robovi). Obseg seminarja naj bo 2700 do 3000 besed , a ne več kot 3500 besed. Seminarska naloga mora vsebovati najmanj tri slike, bolje več. Eno sliko morate narisati sami in to pod sliko posebej označiti. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko.
- Seminar oddajte do datuma oddaje, ki je naveden v tabeli, v elektronski obliki z uporabo tega obrazca.
- Vsi seminarji so v elektronski obliki dostopni tukaj.
- Recenzenti do dneva, določenega v tabeli, določijo popravke (v elektronski obliki) in podajo oceno pisnega dela. Popravljen seminar oddajte z uporabo tega obrazca.
- Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 15-18 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni.
- Predstavitvi sledi razprava. Recenzenti podajo oceno predstavitve in postavijo najmanj dve vprašanji. Vsi ostali morajo postaviti še dve dodatni vprašanji v okviru celega seminarskega obdobja. Vprašanja, ki ste jih postavili, vpišite na tukaj.
- Na dan predstavitve morate docentu še pred predstavitvijo oddati končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu, elektronsko verzijo seminarja in predstavitev pa oddati na strežnik na dan predstavitve do polnoči.
- Seminarska naloga in povzetek morajo biti v slovenskem jeziku, razen za študente, katerih materni jezik ni slovenščina. Ti lahko oddajo seminar v angleškem jeziku.
Imena datotek
Prosim vas, da vse datoteke, ki mi jih pošiljate, poimenujete po naslednjem receptu:
- 312_BIO_Priimek_Ime.docx za seminar, npr. 312_BIO_Guncar_Gregor.docx
- 312_BIO_Priimek_ime_final.docx za končno verzijo seminarja
- 312_BIO_Priimek_Ime_rec_Priimek2.docx za recenzijo, kjer je Priimek2 priimek recenzenta, npr. 312_BIO_Guncar_Gregor_rec_Scott.docx (če se pišete Scott in odajate recenzijo za seminar, ki ga je napisal Gunčar)
- 312_BIO_Priimek_Ime.pptx za prezentacijo, npr 312_BIO_Guncar_Gregor.pptx
- 312_BIO_Priimek_ime_poprava.doc(x) za popravljeno končno verzijo seminarja, če so popravki manjši
Ocenjevanje seminarjev
Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo recenzentsko poročilo na spletu. Recenzentsko poročilo morate oddati najkasneje do 21:00, en dan pred predstavitvijo seminarja.
Mnenje o predstavitvi
Vsak posameznik odda svoje mnenje o predstavitvi takoj po predstavitvi z online glasovanjem.
Urejanje spletnih strani na wikiju
Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje ... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.
Citiranje virov
Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se držite ene same. V seminarskih nalogah in diplomskih nalogah FKKT uprabljajte shemo citiranja, ki je pobarvana zeleno.
Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati.
Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.
Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.).
Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue, C., Glass, J. I., Alperovich, N., Pieper, R., Parmar, P. P., Hutchison III, C. A., Smith, H. O. in Venter, J. C.
Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, 317, str. 632-638.
Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.
Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)
V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne). Navesti morate tudi vse avtorje dela, razen v primeru, ko jih je 10 ali več. Takrat navedite le prvih devet, za ostale pa uporabite okrajšavo in sod. (in sodelavci). Pred zadnjim avtorjem naj bo vedno besedica "in".
Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.