BIO2 Seminar 2020

From Wiki FKKT
Revision as of 11:33, 7 December 2020 by Luka Stanković (talk | contribs)
Jump to navigationJump to search

Biokemijski seminar

doc. dr. Gregor Gunčar, K2.022

Seznam seminarjev

ime in priimek poglavje naslov seminarja recenzent 1 recenzent 2 datum oddaje datum recenzije datum predstavitve
Ajda Beltram 12 Zgradba in dinamika signalnih kompleksov GPCR Luka Hafner Tinkara Božič 16/10/20 19/10/20 21/10/20
Jan Bregar 12 Protein retinoblastoma Nika Bedrač Martin Stanonik 16/10/20 19/10/20 21/10/20
Anja Moškrič 12 Presinaptični kalcijevi kanalčki kot specializiran nadzor za sproščanje nevrotransmiterjev Srna Anastasovska Luka Stanković 16/10/20 19/10/20 21/10/20
Gregor Strniša 12 Načini aktivacije GPCR Manca Pirc Ana Pervanja 23/10/20 26/10/20 28/10/20
Vid Dobrovoljc 12 Medsebojni vpliv signalnih poti na primeru RTK in GPCR signalnih poti Maruša Sernc Nika Banovšek 23/10/20 26/10/20 28/10/20
Nikola Janakievski 12 Selective androgen receptor modulators Ajda Beltram Aljaž Simonič 23/10/20 26/10/20 28/10/20
Rebeka Jerina 12 Kofein kot antagonist adenozinskih receptorjev Jan Bregar Luka Hafner 30/10/20 02/11/20 04/11/20
Eva Vene 12 Povezava bolečine z vezavo kapsaicina na TRPV1 Anja Moškrič Nika Bedrač 30/10/20 02/11/20 04/11/20
Zala Perko 12 Mehanizmi vezave ligandov in regeneracija fotoreceptorjev očesne mrežnice Gregor Strniša Srna Anastasovska 30/10/20 02/11/20 04/11/20
Erik Putar 14-15 AMPK: senzor glukoze in celičnega energijskega stanja Nikola Janakievski Manca Pirc 06/11/20 09/11/20 11/11/20
Iva Matić 14-15 Rebeka Jerina Maruša Sernc 06/11/20 09/11/20 13/01/21
Timotej Sotošek 14-15 Regulacija mišičnega glikogena: granula in njeni proteini Eva Vene Ajda Beltram 06/11/20 09/11/20 11/11/20
Nika Tomsič 16 Acetil-CoA: glavni metabolit in sekundarni obveščevalec Zala Perko Jan Bregar 13/11/20 16/11/20 18/11/20
Andrej Špenko 16 Erik Putar Anja Moškrič 13/11/20 16/11/20 18/11/20
Aleksandra Rauter 16 Vloga intermediatov Krebsovega cikla v makrofagih Iva Matić Gregor Strniša 13/11/20 16/11/20 18/11/20
Laura Unuk 17 Motnje oksidacije dolgoverižnih maščobnih kislin in karnitinskega transporta Timotej Sotošek Nikola Janakievski 20/11/20 23/11/20 25/11/20
Stefanija Ivanova 17 Vpliv telovadbe na metabolizem ketonskih telesc Nika Tomsič Rebeka Jerina 20/11/20 23/11/20 25/11/20
Jakob Tomšič 17 Funkcije ketonskih telesc v centralnem živčevju Andrej Špenko Eva Vene 20/11/20 23/11/20 25/11/20
Neža Leskovar 18 Urea transporterji in regulacija skoncentriranosti urina Aleksandra Rauter Zala Perko 27/11/20 30/11/20 02/12/20
Luka Šegota 18 Laura Unuk Erik Putar 27/11/20 30/11/20 02/12/20
Nika Perko 18 Encim karbamoil fosfat sintetaza 1 Stefanija Ivanova Iva Matić 27/11/20 30/11/20 02/12/20
Ela Bizjak 19 Mutacije mitohondrijske DNA, heterogenost in mitohondrijske bolezni Jakob Tomšič Timotej Sotošek 04/12/20 07/12/20 09/12/20
Bor Krajnik 19 Reaktivne kisikove zvrsti in njihova vloga pri regulaciji celične proliferacije Neža Leskovar Nika Tomsič 04/12/20 07/12/20 09/12/20
Maja Kobal 19 Od UCP1 odvisna in neodvisna termogeneza Luka Šegota Vid Dobrovoljc 04/12/20 07/12/20 09/12/20
Mateja Milošević 20 CAM tip fotosinteze: Crassualacean Acid Metabolism Nika Perko Andrej Špenko 11/12/20 14/12/20 16/12/20
Tinkara Božič 20 Pomen saharoze in njenega metabolizma za rastline Ela Bizjak Aleksandra Rauter 11/12/20 14/12/20 16/12/20
Martin Stanonik 20 Ekofiziologija obstoječih fototrofov in vplivi na evolucijo oksigene fotosinteze Bor Krajnik Laura Unuk 11/12/20 14/12/20 16/12/20
Luka Stanković 21 Nastanek, struktura in funkcija lipidnih kapelj v organizmu Maja Kobal Stefanija Ivanova 18/12/20 21/12/20 23/12/20
Ana Pervanja 21 Vpliv cirkadianega ritma na metabolizem lipidov Mateja Milošević Jakob Tomšič 18/12/20 21/12/20 23/12/20
Nika Banovšek 21 Tinkara Božič Neža Leskovar 18/12/20 21/12/20 23/12/20
Aljaž Simonič 22 Martin Stanonik Luka Šegota 23/12/20 28/12/20 30/12/20
Luka Hafner 22 Luka Stanković Ana Žagar 23/12/20 28/12/20 30/12/20
Ana Žagar 22 Vid Dobrovoljc Nika Perko 23/12/20 28/12/20 30/12/20
Nika Bedrač 23 Ana Pervanja Ela Bizjak 30/12/20 04/01/21 06/01/21
Srna Anastasovska 23 Nika Banovšek Bor Krajnik 30/12/20 04/01/21 06/01/21
Manca Pirc 23 Aljaž Simonič Maja Kobal 30/12/20 04/01/21 06/01/21
Maruša Sernc 23 Ana Žagar Mateja Milošević 08/01/21 11/01/21 13/01/21
Lea Nicouleau any chapter 06/01/21 11/01/21 13/01/21
Marjorie Leaud any chapter 06/01/21 11/01/21 13/01/21
  • številka v okencu za temo pomeni poglavje v Lehningerju, v katerega naj izbrana tema spada

Razporeditev je začasna in se lahko še spremeni, načeloma pa se termini do vključno 18. poglavja ne bodo spreminjali. Prosim,da mi sporočite morebitne napake ali če vas nisem razporedil.

Gradivo za predavanja

Gradivo za predavanja in seminarje najdete na http://bio.ijs.si/~zajec/bio2/ username: bio2 password: samozame

Naloga

Vaša naloga za seminar je:
Samostojno pripraviti seminar o seminarski temi, ki vam je bila dodeljena. Za osnovo morate vzeti pregledni članek iz revije, ki ima faktor vpliva nad 5 (npr. TIBS. Poiskati morate še vsaj tri znanstvene članke, ki se nanašajo na opisano temo in jih uporabiti kot podlago za seminarsko nalogo! Članki so dostopni tukaj.

Za pripravo seminarja velja naslednje:

  • Povzetek seminarja opišete na wikiju v 200 besedah (+- dvajset besed) - najkasneje do dne ko morate oddati seminar recenzentom.
  • Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
  • Seminar pripravite v obliki seminarske naloge na ~5-12 straneh A4 (pisava 12, enojni razmak, 2,5 cm robovi). Obseg seminarja naj bo 2700 do 3000 besed , a ne več kot 3500 besed. Seminarska naloga mora vsebovati najmanj tri slike, bolje več. Eno sliko morate narisati sami in to pod sliko posebej označiti. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko.
  • Seminar oddajte do datuma oddaje, ki je naveden v tabeli v elektronski obliki z uporabo tega obrazca.
  • Vsi seminarji so v elektronski obliki dostopni tukaj.
  • Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke (v elektronski obliki) in podajo oceno pisnega dela. Popravljen seminar oddajte z uporabo tega obrazca.
  • Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 20-25 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni.
  • Predstavitvi sledi razprava. Recenzenti podajo oceno predstavitve in postavijo najmanj dve vprašanji.Vsi ostali morajo postaviti še dve dodatni vprašanji v okviru celega seminarskega obdobja. Vprašanja, ki ste jih postavili vpišite na tukaj.
  • Na dan predstavitve morate docentu še pred predstavitvijo oddati končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu, elektronsko verzijo seminarja in predstavitev pa oddati na strežnik na dan predstavitve do polnoči.
  • Seminarska naloga in povzetek morajo biti v slovenskem jeziku, razen za študente, katerih materni jezik ni slovenščina. Ti lahko oddajo seminar v angleškem jeziku.

Imena datotek

Prosim vas, da vse datoteke, ki mi jih pošiljate poimenujete po naslednjem receptu:

  • 312_BIO_Priimek_Ime.doc(x) za seminar, npr. 312_BIO_Guncar_Gregor.docx
  • 312_BIO_Priimek_ime_final.doc(x) za končno verzijo seminarja
  • 312_BIO_Priimek_Ime_rec_Priimek2.doc(x) za recenzijo, kjer je Priimek2 priimek recenzenta, npr. 312_BIO_Guncar_Gregor_rec_Scott.docx (če se pišete Scott in odajate recenzijo za seminar, ki ga je napisal Gunčar)
  • 312_BIO_Priimek_Ime.ppt(x) za prezentacijo, npr 312_BIO_Guncar_Gregor.pptx
  • 312_BIO_Priimek_ime_poprava.doc(x) za popravljeno končno verzijo seminarja, če so popravki manjši

Ocenjevanje seminarjev

Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo recenzentsko poročilo na spletu. Recenzentsko poročilo morate oddati najkasneje do 21:00, en dan pred predstavitvijo seminarja.

Mnenje o predstavitvi

Vsak posameznik odda svoje mnenje o predstavitvi takoj po predstavitvi z online glasovanjem.

Urejanje spletnih strani na wikiju

Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.

Citiranje virov

Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se držite ene same. V seminarskih nalogah in diplomskih nalogah FKKT uprabljajte shemo citiranja, ki je pobarvana zeleno. Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati. Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.

Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.).

Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue, C., Glass, J. I., Alperovich, N., Pieper, R., Parmar, P. P., Hutchison III, C. A., Smith, H. O. in Venter, J. C. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, 317, str. 632-638.

Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.

Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)

V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne). Navesti morate tudi vse avtorje dela, razen v primeru, ko jih je 10 ali več. Takrat navedite le prvih devet, za ostale pa uporabite okrajšavo in sod. (in sodelavci). Pred zadnjim avtorjem naj bo vedno besedica "in".


Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.