Seminarji SB 2022/23: Difference between revisions

From Wiki FKKT
Jump to navigationJump to search
No edit summary
No edit summary
 
(48 intermediate revisions by 20 users not shown)
Line 1: Line 1:
== [[Image:Headline text]][[Image:[[Media:Example.jpg]]]] ==
V študijskem letu 2022/23 študentje pri Sintezni biologiji predstavljajo naslednje teme:  
[[http://www.example.com link title]]V študijskem letu 2022/23 študentje pri Sintezni biologiji predstavljajo naslednje teme:  


RAZISKOVALNI ČLANKI
RAZISKOVALNI ČLANKI
Line 14: Line 13:
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Sistem_za_nadzor_%C5%A1tevila_plazmidov_v_celici_%28Tulip%29 Sistem za nadzor števila plazmidov v celici (Tulip)] (Gregor Strniša)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Sistem_za_nadzor_%C5%A1tevila_plazmidov_v_celici_%28Tulip%29 Sistem za nadzor števila plazmidov v celici (Tulip)] (Gregor Strniša)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Skupnostna_znanost_je_na%C4%8Drtovala_ribosome_s_koristnimi_fenotipi Skupnostna znanost je načrtovala ribosome s koristnimi fenotipi] (Tanja Gošnjak)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Skupnostna_znanost_je_na%C4%8Drtovala_ribosome_s_koristnimi_fenotipi Skupnostna znanost je načrtovala ribosome s koristnimi fenotipi] (Tanja Gošnjak)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Pristop_sintezne_biologije_za_načrtovanje_kandidata_za_cepivo_proti_delta_različici_SARSCoV2_je_razkril_motnjo_favoriziranega_para_kodonov_kot_boljšo_strategijo_pred_uporabo_redkih_kodonov Pristop sintezne biologije za načrtovanje kandidata za cepivo proti delta različici SARS-CoV-2 je razkril motnjo favoriziranega para kodonov kot boljšo strategijo pred uporabo redkih kodonov] (Stefanija Ivanova)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Pristop_sintezne_biologije_za_načrtovanje_kandidata_za_cepivo_proti_delta_različici_SARSCoV2_je_razkril_prekinitev_favoriziranega_para_kodonov_kot_boljšo_strategijo_pred_uporabo_redkih_kodonov Pristop sintezne biologije za načrtovanje kandidata za cepivo proti delta različici SARS-CoV-2 je razkril prekinitev favoriziranega para kodonov kot boljšo strategijo pred uporabo redkih kodonov] (Stefanija Ivanova)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Dvosmerni_hibridni_eritritol_–_inducibilni_promotor_za_sintezno_biologijo_v_Yarrowia_lipolytica Dvosmerni hibridni eritritol – inducibilni promotor za sintezno biologijo v ''Yarrowia lipolytica''] (Maša Andoljšek)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Dvosmerni_hibridni_eritritol_–_inducibilni_promotor_za_sintezno_biologijo_v_Yarrowia_lipolytica Dvosmerni hibridni eritritol – inducibilni promotor za sintezno biologijo v ''Yarrowia lipolytica''] (Maša Andoljšek)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Utišanje_izražanja_genov_s_strukturo_definirano_zankasto_strukturo_male_nekodirajoče_RNA_s_programiranimi_regulatornimi_aktivnostmi Utišanje izražanja genov s strukturo definirano zankasto strukturo male nekodirajoče RNA s programiranimi regulatornimi aktivnostmi] (Nika Bedrač)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Utišanje_izražanja_genov_s_strukturo_definirano_zankasto_strukturo_male_nekodirajoče_RNA_s_programiranimi_regulatornimi_aktivnostmi Utišanje izražanja genov s strukturno definirano zankasto strukturo male nekodirajoče RNA s programiranimi regulatornimi aktivnostmi] (Nika Bedrač)
# [http://www.wiki.fkkt.uni-lj.com Z integrazo nadzorovan diferenciacijski sistem izboljša evolucijsko stabilnost bremenskih in toksičnih funkcij v E.coli] (Nika Banovšek)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Izbolj%C5%A1anje_evolucijske_stabilnosti_obremenjujo%C4%8Dih_in_toksi%C4%8Dnih_funkcij_v_E.coli_z_diferenciacijskim_genetskim_vezjem_posredovanim_z_integrazo Izboljšanje evolucijske stabilnosti obremenjujočih in toksičnih funkcij v E.coli z diferenciacijskim genetskim vezjem posredovanim z integrazo] (Nika Banovšek)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Nova_sintetična_mala_RNA%2C_ki_promovira_prekomerno_izražanje_proteinov_v_brezceličnem_sistemu Nova sintetična mala RNA, ki promovira prekomerno izražanje proteinov v brez-celičnem sistemu] (Ana Godeša)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Sistem_za_kontrolo_hitrosti_rasti_celic%2C_ki_zmanj%C5%A1uje_breme_aktivacije_genov Sistem za kontrolo hitrosti rasti celic, ki zmanjšuje breme aktivacije genov] (Neža Ribnikar)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Biohibridne_membrane_za_odstranjevanje_te%C5%BEkih_kovin_iz_vode Biohibridne membrane za odstranjevanje težkih kovin iz vode] (Tadej Uršič)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Uporaba_CIVT-SELEX_za_izbiro_aptamerov_kot_genskih_delov_za_regulacijo_genetskih_vezij_v_brezceličnem_sistemu Uporaba CIVT-SELEX za izbiro aptamerov kot genskih delov za regulacijo genetskih vezij v brezceličnem sistemu] (Klemen Kunej)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Inženiring_Cyborg_bakterij_preko_intracelularne_hidrogelacije Inženiring Cyborg bakterij preko intracelularne hidrogelacije] (Eva Oven)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Povezovanje_celi%C4%8Dne_komunikacije_z_optogenetiko:_implementacija_svetlobno_inducibilnega_medceli%C4%8Dnega_sistema_v_kvasovkah Povezovanje celične komunikacije z optogenetiko: implementacija svetlobno inducibilnega medceličnega sistema v kvasovkah] (Nika Perko)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Programabilni_sinteti%C4%8Dni_biomolekulski_kondenzati_za_nadzor_celi%C4%8Dnih_procesov Programabilni sintetični biomolekulski kondenzati za nadzor celičnih procesov] (Anja Konjc)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Razcepljena_%28split%29_aminoacil-tRNA_sintetaza_za_indukcijo_supresije_stop_kodona Razcepljena (split) aminoacil-tRNA sintetaza za indukcijo supresije stop kodona] (Špela Štor)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/S_svetlobo_inducirana_produkcija_izobutanola_in_3-metil-1-butanola_z_modificiranimi_cianobakterijami S svetlobo inducirana produkcija izobutanola in 3-metil-1-butanola s cianobakterijami] (Špela Katarina Deučman)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Raziskovanje_temperaturno_posredovane_replikacije_plazmida_kot_reverzibilnega_in_preklopljivega_proteinskega_ekspresijskega_sistema_v_Escherichia_coli Raziskovanje temperaturno posredovane replikacije plazmida kot reverzibilnega in preklopljivega proteinskega ekspresijskega sistema v ''Escherichia coli''] (Timotej Sotošek)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Konstrukcija_na_manitol_odzivnih_genetskih_stikal_na_osnovi_MtlR_škatle Konstrukcija na manitol odzivnih genetskih stikal na osnovi MtlR škatle] (Žan Fortuna)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Optogenetski_nadzor_bioprodukcije_beta-karotena_v_kvasovkah_v_%C5%A1tevilnih_laboratorijskih_proizvodnjah Optogenetski nadzor bioprodukcije beta-karotena v kvasovkah na številnih laboratorijskih skalah] (David Verdel)


NAGRAJENI ŠTUDENTSKI PROJEKTI
NAGRAJENI ŠTUDENTSKI PROJEKTI
Line 27: Line 38:
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/BINANOX BINANOX] (Vivian Nemanič)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/BINANOX BINANOX] (Vivian Nemanič)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/CoBiota CoBiota] (Petra Sintič)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/CoBiota CoBiota] (Petra Sintič)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Sporadicate Sporadicate] (Gašper Možina)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/FISHERLY FISHERLY] (Lucija Pišek)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/!MPACT !MPACT] (Jure Povšin)
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/AngelRoots AngelRoots] (Iva Matić)
----
----



Latest revision as of 16:14, 29 May 2023

V študijskem letu 2022/23 študentje pri Sintezni biologiji predstavljajo naslednje teme:

RAZISKOVALNI ČLANKI

(Vpišite naslov seminarja v slovenščini in ga povežite z novo stranjo, kjer bo povzetek. Na tej novi strani naj bo pod naslovom povezava do izhodiščnega članka na spletu.)

  1. Rudarjenje in uporaba konstitutivnih promotorjev iz Rhodosporidium toruloides (Ana Babnik)
  2. Biomolekularni aktuatorji za gensko selektivno akustično manipulacijo celic (Greta Junger)
  3. In vivo samosestavljena siRNA kot način kombiniranega zdravljenja ulceroznega kolitisa (Tjaša Kos)
  4. Priprava kompleta orodij za zaznavanje kvoruma pri cianobakterijah: Razvoj medcelične koordinacije v mešanih avtotrofno-heterotrofnih skupnostih (Nuša Tkalec)
  5. Razvoj temperaturno inducibilnega transkripcijskega reostata pri Neurospori crassi (Luka Šegota)
  6. Priprava tumor ciljajočih bakterij s stikalnim sistemom, ki se odziva na dušikov(II) oksid (Ana Kodra)
  7. Razcepljeni ribocim, ki signale nativnih RNA poveže z ortogonalnimi proteinskimi izhodnimi signali (Ajda Beltram)
  8. Sistem za nadzor števila plazmidov v celici (Tulip) (Gregor Strniša)
  9. Skupnostna znanost je načrtovala ribosome s koristnimi fenotipi (Tanja Gošnjak)
  10. Pristop sintezne biologije za načrtovanje kandidata za cepivo proti delta različici SARS-CoV-2 je razkril prekinitev favoriziranega para kodonov kot boljšo strategijo pred uporabo redkih kodonov (Stefanija Ivanova)
  11. Dvosmerni hibridni eritritol – inducibilni promotor za sintezno biologijo v Yarrowia lipolytica (Maša Andoljšek)
  12. Utišanje izražanja genov s strukturno definirano zankasto strukturo male nekodirajoče RNA s programiranimi regulatornimi aktivnostmi (Nika Bedrač)
  13. Izboljšanje evolucijske stabilnosti obremenjujočih in toksičnih funkcij v E.coli z diferenciacijskim genetskim vezjem posredovanim z integrazo (Nika Banovšek)
  14. Nova sintetična mala RNA, ki promovira prekomerno izražanje proteinov v brez-celičnem sistemu (Ana Godeša)
  15. Sistem za kontrolo hitrosti rasti celic, ki zmanjšuje breme aktivacije genov (Neža Ribnikar)
  16. Biohibridne membrane za odstranjevanje težkih kovin iz vode (Tadej Uršič)
  17. Uporaba CIVT-SELEX za izbiro aptamerov kot genskih delov za regulacijo genetskih vezij v brezceličnem sistemu (Klemen Kunej)
  18. Inženiring Cyborg bakterij preko intracelularne hidrogelacije (Eva Oven)
  19. Povezovanje celične komunikacije z optogenetiko: implementacija svetlobno inducibilnega medceličnega sistema v kvasovkah (Nika Perko)
  20. Programabilni sintetični biomolekulski kondenzati za nadzor celičnih procesov (Anja Konjc)
  21. Razcepljena (split) aminoacil-tRNA sintetaza za indukcijo supresije stop kodona (Špela Štor)
  22. S svetlobo inducirana produkcija izobutanola in 3-metil-1-butanola s cianobakterijami (Špela Katarina Deučman)
  23. Raziskovanje temperaturno posredovane replikacije plazmida kot reverzibilnega in preklopljivega proteinskega ekspresijskega sistema v Escherichia coli (Timotej Sotošek)
  24. Konstrukcija na manitol odzivnih genetskih stikal na osnovi MtlR škatle (Žan Fortuna)
  25. Optogenetski nadzor bioprodukcije beta-karotena v kvasovkah na številnih laboratorijskih skalah (David Verdel)

NAGRAJENI ŠTUDENTSKI PROJEKTI

(Vpišite naslov seminarja v slovenščini in ga povežite z novo stranjo, kjer bo povzetek. Na tej novi strani naj bo pod naslovom povezava do wiki strani študentske ekipe, katere projekt opisujete.)

  1. MonChassis (Nika Tomsič)
  2. FIAT LUX (Neža Lanišek)
  3. NETLANTIS (Maša Gabrič)
  4. BINANOX (Vivian Nemanič)
  5. CoBiota (Petra Sintič)
  6. Sporadicate (Gašper Možina)
  7. FISHERLY (Lucija Pišek)
  8. !MPACT (Jure Povšin)
  9. AngelRoots (Iva Matić)

Povzetki v slovenščini naj imajo 1200-1500 besed (viri v to vsoto ne štejejo). Povzetek je treba objaviti dva dni pred predstavitvijo do polnoči (za seminarje v sredo torej v ponedeljek). Predstavitev seminarja naj bo dolga 15 minut (13-17). Sledila bo približno 5-minutna razprava.

Terminski razpored je razviden iz preglednice na strežniku Google Drive.

Kako je videti seznam seminarjev, lahko preverite pri lanskem letniku: Seminarji_SB_2021/22.