Search results
From Wiki FKKT
Jump to navigationJump to search
Page title matches
- 10 KB (1,527 words) - 05:16, 19 May 2023
- ...[[Razcepljena (split) aminoacil-tRNA sintetaza za indukcijo supresije stop kodona]]93 bytes (10 words) - 05:08, 19 May 2023
Page text matches
- *UUU in UUC sta kodona2 KB (277 words) - 21:00, 4 January 2010
- ...zmed 20 aminokislin, ki v človeškem organizmu tvorijo beljakovine. Njegova kodona sta AAU in AAC. Za človeka je neesencialna aminokislina, kar pomeni, da jo2 KB (268 words) - 18:35, 5 January 2010
- ...kodonov, se lahko uporablja za optimizacijo kodona (CO) in deoptimizacijo kodona (CD) [2]. RSCU pomeni relativno sinonimno uporabo kodona in je merilo, ki pomaga identificirati prednostne in neprednostne kodone za10 KB (1,460 words) - 07:19, 9 May 2023
- ...kodonov, se lahko uporablja za optimizacijo kodona (CO) in deoptimizacijo kodona (CD) [2]. RSCU pomeni relativno sinonimno uporabo kodona in je merilo, ki pomaga identificirati prednostne in neprednostne kodone za10 KB (1,455 words) - 16:11, 8 May 2023
- ...kariontih, kot so vstop ribosoma znotraj mRNA, prepustno iskanje začetnega kodona, iniciacija z nekanoničnim začetnim kodonom, ribosomski preskok, reinicia ...ture oz. "preskoči" del zaporedja in nadaljuje z iskanjem novega začetnega kodona. TGEV ima ORF 3a, ki mu manjka začetni kratek ORF, z tem mehanizmom se pre10 KB (1,564 words) - 22:40, 12 May 2021
- ...a''' ('''Glu''') je ena od dvajsetih proteinogenih kislin in jo zapisujeta kodona GAA in GAG. Je ne[http://sl.wikipedia.org/wiki/Esencialna_aminokislina esen2 KB (357 words) - 09:38, 5 January 2010
- ...seva ''ADP'' bakterije ''Pseudomonas sp.'', pri čemer so optimizirali rabo kodona za ''C. reinhardtii''. Uporabili so t.i. metodo Golden Gate Modular Cloning ...73001] || CDS gena ''atzA'' iz ''Pseudomonas sp. ADP'' z optimizirano rabo kodona za ''C. reinhardtii''13 KB (1,884 words) - 17:57, 10 April 2021
- ...lahko pripelje do tvorbe ne homolognih baznih parov znotraj novo nastalega kodona. ...orpholino tarčno sekvenco homolognih regij v obe smeri okoli GFP začetnega kodona.5 KB (719 words) - 19:29, 14 October 2013
- ...20 aminokislin, ki v človeškem organizmu tvorijo beljakovine ali proteine. Kodona, ki zapisujeta omenjeno aminokislino, sta GAU in GAC. Anion asparaginske ki3 KB (517 words) - 08:26, 17 May 2010
- ...a so preko jantarnega stop kodona (UAG) in redko uporabljenega levcinskega kodona (CUA) tudi uspeli izražati proteine z vgrajenimi nekanoničnimi aminokisli ...minokislin preko jantarnega stop kodona ali manj uporabljenega levcinskega kodona (CTA) ima omejitev vgradnje le dveh AK. Pokazali so tudi, da vgradnja preko10 KB (1,461 words) - 08:05, 15 January 2018
- ...translacije pride, če ribosom zastane na 3'-koncu mRNA, ki ne vsebuje stop-kodona, na katerem bi sicer potekla terminacija translacije ter razpad kompleksa r ...TLD domena. Zanimivo pri tem pa je, da ne vsebuje AUG (Met) iniciacijskega kodona, kot tudi ne Shine-Dalgarno zaporedja. Po translaciji je, s tem zaporedjem11 KB (1,590 words) - 18:53, 31 May 2016
- ...in se med različnimi mRNA lahko razlikuje), dolžine vmesnika in tipa start-kodona (poleg AUG so možni še alternativni start-kodoni, t.j. GUG, UUG, AUU, AUC ...ja na mRNA in anti-SD-zaporedja na 16S rRNA, kar omogoči orientacijo start-kodona na P-mesto, kamor se tedaj rekrutira fMet-tRNA.16 KB (2,426 words) - 16:47, 10 December 2018
- ...1540g in YALI0F01672g narobe napovedana in anotirana (nimata enakega start kodona pri različnih sevih, dolžina pa je bila med 3 000 in 4 000 baznih parov). ...sevi rodu ''Yarrowia''. Našli so še drugo škatlo TATA blizu ''EYK1'' start kodona.10 KB (1,458 words) - 22:05, 7 May 2023
- ...1540g in YALI0F01672g narobe napovedana in anotirana (nimata enakega start kodona pri različnih sevih, dolžina pa je bila med 3 000 in 4 000 baznih parov). ...sevi rodu ''Yarrowia''. Našli so še drugo škatlo TATA blizu ''EYK1'' start kodona [3].10 KB (1,482 words) - 19:21, 8 May 2023
- ...Cisteinski ostanek na položaju 73 (TGC) so spremenili v alanin s spremembo kodona v GCC, s tem se je VVD spremenil v fluoroprotein. Nastal je VVD36-C73A ([ht ...je kodona bo izboljšala izražanje proteina VVD v primerjavi z divjim tipom kodona ([http://parts.igem.org/Part:BBa_K3140006 BBa_K3140006], [http://parts.igem11 KB (1,772 words) - 18:48, 13 April 2020
- '''Raba kodona:''' ...nih ekstraktov tobaka presenetljivo višja, kot v primeru optimizacije rabe kodona za tobak. Razlog za nepričakovan rezultat bi lahko bil nastanek sekundarni10 KB (1,485 words) - 20:08, 2 May 2022
- '''Raba kodona:''' ...nih ekstraktov tobaka presenetljivo višja, kot v primeru optimizacije rabe kodona za tobak. Razlog za nepričakovan rezultat bi lahko bil nastanek sekundarni10 KB (1,488 words) - 20:23, 2 May 2022
- ...a Razcepljena (split) aminoacil-tRNA sintetaza za indukcijo supresije stop kodona] (Špela Štor)8 KB (1,152 words) - 16:14, 29 May 2023
- ...nju vezja je tako prišla zaradi hitrosti translacije zaradi spremembe rabe kodona.9 KB (1,394 words) - 00:59, 16 January 2017
- ...lantifolia'' (''VpVAN''), ki so ga modificirli tako, da so upoštevali rabo kodona v rastlini''Nicotania benthamiana''. Sintezno zaporedje so vstavili v vekto5 KB (680 words) - 21:22, 5 March 2017
- ...lantifolia'' (''VpVAN''), ki so ga modificirli tako, da so upoštevali rabo kodona v rastlini''Nicotania benthamiana''. Sintezno zaporedje so vstavili v vekto5 KB (682 words) - 19:24, 5 March 2017
- ...sta RBS, pomembna tudi sekundarna struktura mRNA v regijah okrog začetnega kodona, kar je botrovalo ''in silico'' razvoju različnih stikal toehold. Alternat ...novno sledi dvoverižno deblo lasnice (9 bp). Ne-komplementarnost začetnega kodona nasprotni verigi omogoči večje število razvoja potencialnih sprožilcev,13 KB (1,937 words) - 06:46, 29 November 2018
- ...je možna odstranitev HisTag-a. Z dodatkom začetnega kodona ATG in TAA stop kodona so zagotovili, da se je protein res izražal. Iz pET43.1a vektorja so dodal10 KB (1,606 words) - 19:48, 5 December 2016
- ...e razlike v dolžini genov, so večinoma bile zaradi napak v določitvi start kodona.5 KB (738 words) - 14:11, 5 January 2014
- ...labost metode MPX je tudi zmanjšana detekcija ene ali obeh mutacij, če sta kodona, pri katerih testiramo mutaciji, blizu skupaj na genomu in je bila potrebna6 KB (877 words) - 17:28, 9 December 2013
- ...1, MSP1<sub>19</sub> ter GK1. Bralne okvirje so optimizirali glede na rabo kodona v kloroplastih [3]. 766 bp dolg Malchloroplast konstrukt so vstavili v pBic5 KB (816 words) - 15:45, 24 March 2021
- ...>Δ8</SUP>'') in zamika bralnega okvirja, kar je privedlo do zgodnjega STOP kodona. Posledično se pri miškah ''Zfp644<SUP>Δ8</SUP>'' sintetizira skrajšana6 KB (1,041 words) - 16:21, 19 March 2019
- ...om-peptid (ribosome complex), ki zaradi dejstva, da mRNA ni vsebovala stop kodona, ni razpadel takoj po prepisu peptida. Reakcijo so ustavili tako, da so me�6 KB (929 words) - 17:45, 20 October 2013
- ...ažene transkripcijo gena za polimerazo T7, ki pa ima dva vmesna amber stop kodona. Taka mRNA je translacijsko neaktivna. Aktivira jo gen supD, ki ga aktivira7 KB (1,149 words) - 19:40, 18 December 2017
- Poleg optimizacije rabe kodona je ključna sprememba v zaporedju menjava dveh kodonov, ki se na nivoju pro11 KB (1,557 words) - 14:15, 8 April 2021
- ...ori zanko. Takšna RNA je sestavljena iz 5 delov: sprožilca, RBS, začetnega kodona, linkerja in reporterja.10 KB (1,541 words) - 06:49, 12 May 2021
- ...ori zanko. Takšna RNA je sestavljena iz 5 delov: sprožilca, RBS, začetnega kodona, linkerja in reporterja.10 KB (1,546 words) - 08:10, 11 May 2021
- Uspešno so optimizirali rabo kodona obeh proteinov in proteina izrazili v bakteriji ''E. coli'' v vektorju pET29 KB (1,401 words) - 22:28, 12 December 2016
- ...dprtih bralnih okvirjev kodirata za en protein zaradi puščajočega UAG stop kodona, njun produkt pa je replikaza z metilacijsko in helikazno podenoto, hkrati9 KB (1,443 words) - 19:29, 5 May 2018
- ...i tri nukleotide navzdol od '''yEGFP''' (ang. ''yeast enhanced GFP'') stop kodona in navzgor od terminatorja ADH1. S plazmidi so transformirali kompetentne c10 KB (1,480 words) - 22:10, 21 January 2018
- Na začetku projekta so pri vseh izbranih genih izvedli optimizacijo kodona in nato so zaporedja pripravili z direktno sintezo. Pripravljene zapise so10 KB (1,528 words) - 07:35, 20 December 2016
- ...ozna TAG kodon vezana ustrezna aminokislina, kar bo omogočilo preskok stop kodona. Sinteza dCas9 bo potekla, kadar bo na tako tRNA vezana nenaravna aminokisl10 KB (1,597 words) - 15:03, 28 November 2016
- ...u bi tako lahko dodali samo še gen, ki nas zanima, zapisan navzdol od stop kodona, ustrezno obkroženega z dvema rox mestoma. V celicah, kjer je prisotna rek10 KB (1,647 words) - 08:01, 14 April 2021
- ...ez statistične pristranskosti za regije genoma, za vrsto mutacije (položaj kodona, transverzija, prehod) ali za sinonimne, nesinonimne ali nekodirajoče muta11 KB (1,621 words) - 08:14, 23 July 2021
- ...izira se Gag/Pol fuzijski protein. Za proces pravilnega prepoznavanja stop kodona je ključna sekundarna struktura RNA – pseudoknot.11 KB (1,665 words) - 07:00, 22 April 2018
- ...s''. Za optimalno izražanje genov v ''K. phaffii'' so izvedli optimizacijo kodona. Za delovanje kompleksa pMMO se morajo vse tri podenote transportirati do m10 KB (1,594 words) - 22:24, 2 May 2022
- ...ni iz kvasovke ''S. cerevisiae'' seva BY474, obsegajo pa 225 bp navzdol od kodona stop šestih kvasnih genov z največjo stopnjo izražanja. Izbrani so termi10 KB (1,612 words) - 13:39, 9 May 2020
- ...stom že vsebuje promotor Ptrc. Vsem zapisom za encime so optimizirali rabo kodona za uporabo v E. coli. V konstrukte za pot 2 so poleg zapisov za kandidatne12 KB (1,760 words) - 20:48, 3 April 2021
- ...in njen prenos do citosolnih celičnih ribosomov, kjer pride do translacije kodona in sinteze α proteinov. Enako kot pri takojšnjih zgodnjih genih tudi zgod11 KB (1,739 words) - 13:07, 14 April 2018
- ...čno prilagoditev organizma na temperaturo okolja so: delež parov GC, raba kodona, pogostost določenih aminokislin, disulfidne, ionske in hidrofobne interak13 KB (1,856 words) - 20:54, 17 April 2021
- ...tako so na 5'-konec ''dolge strukture'' pripeli reverzni komplement START-kodona ATG in 21 nt dolg zapis za zeleni fluorescirajoči protein (GFP) ter to izr12 KB (1,830 words) - 09:13, 8 May 2023
- ...zivni elementi HRE navadno nahajajo 100-1000 baznih parov navzgor od start kodona ATG [1].12 KB (1,761 words) - 16:40, 17 May 2021
- ...sintetičnih RBS-jev, protismernih RNA, ribocimov, peptidnih oznak in rabe kodona v veliki meri vplivamo na hitrost translacije in degradacijo proteinov.12 KB (1,748 words) - 01:25, 14 December 2015
- • reporterskega gena ''lacZ'' z optimizirano rabo kodona za E.coli ([http://parts.igem.org/Part:BBa_K3806012 BBa_K3806012])12 KB (1,782 words) - 20:41, 12 April 2022
- ...veyi'', ki pa so jih morali v veliki meri spremeniti. Optimizirali so rabo kodona in 6 genov v operonu je bilo razdeljenih v tri bicistronske pare, med kater ...m transkripcije ali translacije. Eden izmed pristopov je uporaba celičnega kodona tako, da ni več enaka univerzalnem genetskem kodu. Določene kodone in z n23 KB (3,443 words) - 23:22, 17 January 2016
- ...unkcionalnih polipeptidnih verig. Vse se začne pri molekuli mRNA brez stop kodona. Pri translaciji takšne molekule pride do prevajanja nekodirajočih regij, ...ljuje, da se »skeniranje« nadaljuje, kljub temu da je že prišlo do zaznave kodona AUG. To so kasneje tudi potrdili z ostalimi eksperimenti. Najverjetnejša r56 KB (8,731 words) - 16:52, 30 May 2016
- ...so optimalni kodoni, tisti, ki se bolj počasi, so neoptimalni. Optimalnost kodona je torej neko merilo, kako hitro translacijo omogoča ta kodon, prav tako p70 KB (10,882 words) - 12:16, 25 May 2020