TBK2019-seminar

Temelji biokemije- seminar

Seminarje vodi prof. dr. Brigita Lenarčič. Seminarji so obvezni.

Ocena seminarjev (6-10) predstavlja enako število odstotkov, ki se prišteje h končni pisni oceni izpita. Stran na strežniku s seminarskimi nalogami je zaščitena. Uporabniško ime je: tbk, password pa: samozame## "##" sta dve številki, ki ju izveste na predavanjih. Tudi za urejanje Wiki strani potrebujete geslo, ki se od zgornjega razlikuje. Postopek pridobitve Wiki uporabniškega imena in gesla je opisan tukaj.

Seznam seminarjev

Ime in priimek	Naslov seminarja	Povezava	Rok za oddajo	Rok za recenzijo	Datum predstavitve	Recenzent 1	Recenzent 2	Recenzent 3
Anna Scott	Moj naslov v slovenščini	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/02/190214100038.htm	28.10.	05.11.	07.11.	r1	r2	r3
Maša Andoljšek	Zrele človeške celice lahko spremenijo svojo funkcijo	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/02/190213132309.htm	21.02.	22.02.	25.02.	Isidora Stevanoska	Tina Arnšek	Lena Trnovec
Maja Trifkovič	Prepoznavanje in vezava RNA s proteinom Staufen2	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/04/190415104951.htm	21.02.	22.02.	25.02.	Manca Osolin	Tadej Uršič	Ana Vičič
Teo Nograšek	Kako se proteini vgradijo v celično membrano	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/02/190214100038.htm	21.02.	22.02.	25.02.	Ajda Košorok	Ana Potočnik	Maša Gabrič
Maja Kolar	Pomen velikosti aksonskih mitohondrijev v možganih	https://www.sciencedaily.com/releases/2018/11/181127110959.htm	28.02.	01.03.	04.03.	Hana Zajc	Mateja Milošević	Laura Unuk
Nina Varda	Kompleksne molekule, ki se zvijajo kot proteini, lahko nastanejo spontano	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/01/190117110824.htm	28.02.	01.03.	04.03.	Katja Benčuk	Nastja Feguš	Sašo Jakob
Anja Konjc	Nanodelci v boju proti raku	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/01/190117092550.htm	28.02.	01.03.	04.03.	Tina Logonder	Maja Mahorič	Alliana Kolar
Timotej Zgonik	Vijačna struktura v biomolekulah se lahko razvije na dokaj preprost način	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/01/190124095112.htm	28.02.	01.03.	04.03.	Špela Sotlar	Nika Banovšek	Nika Ramšak
Ela Sabadin	Genska terapija lahko ozdravi prirojeno gluhost pri miši	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/02/190219111643.htm	05.03.	08.03.	11.03.	Maša Andoljšek	Greta Junger	Tim Nograšek
Kim Glavič	Preveč popravljanja DNA lahko poškoduje tkiva	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/02/190212141409.htm	05.03	08.03.	11.03.	Maja Trifkovič	Isidora Stevanoska	Žan Fortuna
Oskar Nemec	Shizofrenija je povezana z nenavadnim imunskim odzivom na virus Epstein-Barr	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/01/190109090911.htm	05.03.	08.03.	11.03.	Teo Nograšek	Manca Osolin	Jure Povšin
Vivian Nemanič	Zmanjšanje stranskih učinkov kemoterapije z absorpcijsko napravo	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/01/190109090930.htm	05.03.	08.03.	11.03.	Maja Kolar	Ajda Košorok	Jernej Kastelic
Srna Anastasovska	Bakterijski genotoksin kolibaktin človeškega črevesa alkilira DNA.	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/02/190214153159.htm	12.03.	15.03.	18.03.	Nina Varda	Hana Zajc	Tina Arnšek
Karmen Ferjan	Sestavina zelenega čaja, ki pomaga siRNA zdrsniti v celico	https://www.sciencedaily.com/releases/2018/09/180919083446.htm	12.03.	15.03.	18.03.	Anja Konjc	Katja Benčuk	Tadej Uršič
Ana Babnik	Kako nas okuži določena vrsta bakterij?	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/02/190225075613.htm	12.03.	15.03.	18.03.	Timotej Zgonik	Tina Logonder	Ana Potočnik
Aleksandra Rauter	Izolirana bakterija črevesne flore in njena možna povezava z depresijo	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/02/190213124350.htm	12.03.	15.03.	18.03.	Ela Sabadin	Špela Sotlar	Mateja Milošević
Nika Vegelj	Nove poti iskanja funkcionalnega zdravila za virus HIV	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/02/190207173229.htm	19.03.	22.03.	25.03.	Kim Glavič	Maša Andoljšek	Nastja Feguš
Adela Šajn			19.03.	22.03.	25.03.	Oskar Nemec	Maja Trifkovič	Maja Mahorič
Michelle Oletič	Naivni makrofagi	https://www.sciencedaily.com/releases/2018/11/181129142441.htm?fbclid=IwAR2x562KFLljGOmHD5T40KXBf6I2L72TpMpvVM0I3lNBckrVxXW3cXQG-vM	19.03.	22.03.	25.03.	Vivian Nemanič	Teo Nograšek	Nika Banovšek
Tevž Levstek	Odkritje, ki izboljša razumevanje, kako se nekateri virusi množijo	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/03/190312123658.htm	19.03.	22.03.	25.03.	Srna Anastasovska	Maja Kolar	Greta Junger
Matevž Drnovšek	Koruzni sirup z visoko vsebnostjo fruktoze pospeši proliferacijo raka pri miših	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/03/190321141924.htm	26.03.	29.03.	01.04.	Karmen Ferjan	Nina Varda	Isidora Stevanoska
Marjeta Milostnik	Ključ do podaljšane življenjske dobe? Rubicon spremeni delovanje avtofagije med staranjem	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/02/190219111744.htm	26.03.	29.03.	01.04.	Ana Babnik	Anja Konjc	Manca Osolin
Lena Trnovec	Serotonin lahko regulira izražanje genov v nevronih.	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/03/190313143312.htm	26.03.	29.03.	01.04.	Aleksandra Rauter	Timotej Zgonik	Ajda Košorok
Ana Vičič	Snov, ki preprečuje malarijo pri komarjih.	https://www.sciencedaily.com/releases/2018/09/180918082059.htm	26.03.	29.03.	01.04.	Nika Vegelj	Ela Sabadin	Hana Zajc
Maša Gabrič	Cepivo, s katerim bi lahko izkoreninili otroško paralizo	https://www.sciencedaily.com/releases/2018/11/181127092558.htm	02.04.	05.04.	08.04.	Adela Šajn	Kim Glavič	Katja Benčuk
Laura Unuk	Kako HIV-1 protein zatira odgovore imunskega sistema	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/02/190205102525.htm	02.04.	05.04.	08.04.	Michelle Oletič	Oskar Nemec	Tina Logonder
Sašo Jakob	Terapija pljučnih bolezni z vdihavanjem mRNA	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/01/190104104032.htm	02.04.	05.04.	08.04.	Tevž Levstek	Vivian Nemanič	Špela Sotlar
Alliana Kolar	Hiperaktivnost možganskih celic bi lahko bila razlog za neučinkovitost antidepresivov	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/01/190131162500.htm	02.04.	05.04.	08.04.	Matevž Drnovšek	Srna Anastasovska	Maša Andoljšek
Nika Ramšak			09.04.	12.04.	15.04.	Marjeta Milostnik	Karmen Ferjan	Maja Trifkovič
Tim Nograšek	Molekulska proteza za bolnike s cistično fibrozo	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/03/190313143248.htm	09.04.	12.04.	15.04.	Lena Trnovec	Ana Babnik	Teo Nograšek
Žan Fortuna	Molekula, ki lahko odstrani virus hepatitisa C	https://www.sciencedaily.com/releases/2018/12/181219142543.htm	09.04.	12.04.	15.04.	Ana Vičič	Aleksandra Rauter	Maja Kolar
Jure Povšin	Vpliv položaja celice na njeno obnovo	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/03/190327112716.htm	09.04.	12.04.	15.04.	Maša Gabrič	Nika Vegelj	Nina Varda
Jernej Kastelic			23.04.	26.04.	29.04.	Laura Unuk	Adela Šajn	Anja Konjc
Tina Arnšek	Razvitje prvih funkcionalnih ciljnih inhibitorjev arašidovih alergenov	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/04/190408161718.htm	23.04.	26.04.	29.04.	Sašo Jakob	Michelle Oletič	Timotej Zgonik
Tadej Uršič	Proteina, ki navadno ubijeta celico, zatreta listerijo in ne poškodujeta gostiteljske celice	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/04/190418131251.htm	23.04.	26.04.	29.04.	Alliana Kolar	Tevž Levstek	Ela Sabadin
Ana Potočnik	Bakterija sodeluje z virusom, da poveča možnosti za okužbo	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/03/190328150753.htm	23.04.	26.04.	29.04.	Nika Ramšak	Matevž Drnovšek	Kim Glavič
Mateja Milošević	Kanabinoidne spojine lahko zavirajo rast celic raka debelega črevesa	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/02/190206091420.htm	30.04.	03.05.	06.05.	Tim Nograšek	Marjeta Milostnik	Oskar Nemec
Nastja Feguš	Specifično narejeni proteini, lahko pomagajo ustvariti protitelesa proti virusu HIV	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/02/190227081526.htm	30.04.	03.05.	06.05.	Žan Fortuna	Lena Trnovec	Vivian Nemanič
Maja Mahorič	Spreminjanje odprtih ran v kožo	https://www.sciencedaily.com/releases/2018/09/180905131831.htm	30.04.	03.05.	06.05.	Jure Povšin	Ana Vičič	Srna Anastasovska
Nika Banovšek	Kako nevroni nadzorujejo napačno zvite proteine	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/03/190327112652.htm	30.04.	03.05.	06.05.	Jernej Kastelic	Maša Gabrič	Karmen Ferjan
Greta Junger	Blokiranje proteina CD22 obnovi kognitivne sposobnosti pri starih miših	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/04/190403135103.htm	07.05.	10.05.	13.05.	Tina Arnšek	Laura Unuk	Ana Babnik
Isidora Stevanoska	Črni nanodelci upočasnjujejo rast tumorjev	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/04/190404104404.htm	07.05.	10.05.	13.05.	Tadej Uršič	Sašo Jakob	Aleksandra Rauter
Manca Osolin	Kako lahko mitohondrijski encim sproži celično smrt	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/03/190314151623.htm	07.05.	10.05.	13.05.	Ana Potočnik	Alliana Kolar	Nika Vegelj
Ajda Košorok	New pill can deliver insulin through the stomach	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/02/190207142206.htm	07.05.	10.05.	13.05.	Mateja Milošević	Nika Ramšak	Adela Šajn
Hana Zajc			14.05.	17.05.	20.05.	Nastja Feguš	Tim Nograšek	Michelle Oletič
Katja Benčuk			14.05.	17.05.	20.05.	Maja Mahorič	Žan Fortuna	Tevž Levstek
Tina Logonder	RNA-vezavni protein PUM2 je tarča v boju proti staranju	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/01/190110141826.htm	14.05.	17.05.	20.05.	Nika Banovšek	Jure Povšin	Matevž Drnovšek
Špela Sotlar	Vpogled v mehanizem, ki nadzira poškodbe DNA	https://www.sciencedaily.com/releases/2019/02/190226112344.htm	14.05.	17.05.	20.05.	Greta Junger	Jernej Kastelic	Marjeta Milostnik

Naloga

• samostojno pripraviti seminar, katerega tema je novica iz področja biokemije na portalu ScienceDaily, ki je bila objavljena kasneje kot 1. avgusta 2018. Osnova za seminar naj bo znanstveni članek, ki je podlaga za to novico. Poleg tega članka za seminar uporabite še najmanj pet drugih virov, od teh vsaj še dva druga znanstvena članka, ki se navezujeta na to vsebino.
• članke na temo lahko iščete z Google učenjakom.
• naslov izbrane teme in povezavo do novice vpišite v tabelo seminarjev takoj ko ste si izbrali temo, najkasneje pa en teden pred rokom za oddajo
• Povzetek seminarja opišete na wikiju v približno 200 besedah - najkasneje do dne, ko morate oddati seminar recenzentom.
• Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
• Seminar pripravite v obliki seminarske naloge (pisava Cambria, font 11, enojni razmak, 2,5 cm robovi; tekst naj obsega okoli 1000 besed), vsebuje naj 1-2 sliki. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko. Vse uporabljene vire citirajte v tekstu, kot npr. (Nobel, 2010), na koncu pa navedite točen seznam literature, kot je opisano spodaj!
• Celotni seminar naj obsega 2 strani A4 formata (po možnosti dvostransko tiskanje).
• Seminar oddajte do datuma oddaje, ki je naveden v tabeli v elektronski obliki z uporabo tega obrazca.
• vsi seminarji so v elektronski obliki dostopni tukaj.
• Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke in podajo oceno pisnega dela, v predpisanem formatu elektronskega obrazca na internetu.
• Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 12 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni. Prvi recenzent vodi predstavitve in razpravo ter skrbi za to, da vse poteka v zastavljenih časovnih okvirih.
• Predstavitvi sledi razprava do 8 minut. Sledijo vprašanja prisotnih, recenzenti postavijo vsak vsaj dve vprašanji in na koncu podajo oceno predstavitve.
• En dan pred predstavitvijo na strežnik oddajte tudi končno verzijo. Na dan predstavitve morate oddati tudi končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu.
• Seminarska naloga in povzetek na wikiju morajo biti v slovenskem jeziku!

Imena datotek

Prosim vas, da vse datoteke, ki jih pošiljate poimenujete po spodnjih pravilih. Ne uporabljajte ČŽŠčžš! Poslati morate naslednje datoteke:

• TBK_2019_Priimek_Ime.doc(x) za seminar, npr. TBK_2017_Guncar_Gregor.docx
• TBK_2019_Priimek_ime_final.doc(x) za končno verzijo seminarja
• TBK_2019_Priimek_Ime_rec_Priimek2.doc(x) za recenzijo, kjer je Priimek2 priimek recenzenta, npr. TBK_2019_Guncar_Gregor_rec_Scott.docx (če se pišete Scott in odajate recenzijo za seminar, ki ga je napisal Gunčar)
• TBK_2019_Priimek_Ime.ppt(x) za prezentacijo, npr TBK_2017_Guncar_Gregor.pptx
• TBK_2019_Priimek_Ime_clanek.pdf za datoteko PDF, ki vsebuje izvirni članek, npr. TBK_2017_Guncar_Gregor_clanek.pdf

Ocenjevanje seminarjev

Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo [recenzentsko poročilo] na spletu.

Mnenje o predstavitvi

Vsak posameznik mora oceniti seminar tako, da odda svoje mnenje najkasneje v enem tednu po predstavitvi. Kdor na seminarju ni bil prisoten, mnenja ne sme oddati.

Urejanje spletnih strani na wikiju

Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.

Faktor vpliva

Faktor vpliva (angl. impact factor) neke revije pove, kolikokrat so bili v poprečju citirani članki v tej reviji v dveh letih skupaj pred objavo tega faktorja. Faktorje vpliva za posamezno revijo lahko najdete v COBISS-u. V polje "Naslov revije" vnesite ime revije za katero želite izvedeti faktor vpliva in pritisnite na gumb POIŠČI. V skrajnem desnem stolpcu se bodo izpisali faktorji vpliva za revije, ki ustrezajo vašim iskalnim kriterijem. Zadetkov za posamezno revijo je več zato, ker so navedeni faktorji vpliva za posamezno leto. Za tekoče leto faktorji vpliva še niso objavljeni, zato se orientirajte po faktorjih vpliva zadnjih par let. Če faktorja vpliva za vašo izbrano revijo ne najdete v bazi COBISS, potem izberite članek iz kakšne druge revije.

==Citiranje virov==Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se v seminarju držite ene same. Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.
Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.).
Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue C. et al. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, letn. 317, str. 632-638.Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)
V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne).
Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.