Seminarji SB 2022/23: Difference between revisions
No edit summary |
No edit summary |
||
(44 intermediate revisions by 20 users not shown) | |||
Line 1: | Line 1: | ||
V študijskem letu 2022/23 študentje pri Sintezni biologiji predstavljajo naslednje teme: | |||
RAZISKOVALNI ČLANKI | RAZISKOVALNI ČLANKI | ||
Line 14: | Line 13: | ||
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Sistem_za_nadzor_%C5%A1tevila_plazmidov_v_celici_%28Tulip%29 Sistem za nadzor števila plazmidov v celici (Tulip)] (Gregor Strniša) | # [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Sistem_za_nadzor_%C5%A1tevila_plazmidov_v_celici_%28Tulip%29 Sistem za nadzor števila plazmidov v celici (Tulip)] (Gregor Strniša) | ||
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Skupnostna_znanost_je_na%C4%8Drtovala_ribosome_s_koristnimi_fenotipi Skupnostna znanost je načrtovala ribosome s koristnimi fenotipi] (Tanja Gošnjak) | # [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Skupnostna_znanost_je_na%C4%8Drtovala_ribosome_s_koristnimi_fenotipi Skupnostna znanost je načrtovala ribosome s koristnimi fenotipi] (Tanja Gošnjak) | ||
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/ | # [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Pristop_sintezne_biologije_za_načrtovanje_kandidata_za_cepivo_proti_delta_različici_SARSCoV2_je_razkril_prekinitev_favoriziranega_para_kodonov_kot_boljšo_strategijo_pred_uporabo_redkih_kodonov Pristop sintezne biologije za načrtovanje kandidata za cepivo proti delta različici SARS-CoV-2 je razkril prekinitev favoriziranega para kodonov kot boljšo strategijo pred uporabo redkih kodonov] (Stefanija Ivanova) | ||
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Dvosmerni_hibridni_eritritol_–_inducibilni_promotor_za_sintezno_biologijo_v_Yarrowia_lipolytica Dvosmerni hibridni eritritol – inducibilni promotor za sintezno biologijo v ''Yarrowia lipolytica''] (Maša Andoljšek) | # [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Dvosmerni_hibridni_eritritol_–_inducibilni_promotor_za_sintezno_biologijo_v_Yarrowia_lipolytica Dvosmerni hibridni eritritol – inducibilni promotor za sintezno biologijo v ''Yarrowia lipolytica''] (Maša Andoljšek) | ||
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Utišanje_izražanja_genov_s_strukturo_definirano_zankasto_strukturo_male_nekodirajoče_RNA_s_programiranimi_regulatornimi_aktivnostmi Utišanje izražanja genov s | # [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Utišanje_izražanja_genov_s_strukturo_definirano_zankasto_strukturo_male_nekodirajoče_RNA_s_programiranimi_regulatornimi_aktivnostmi Utišanje izražanja genov s strukturno definirano zankasto strukturo male nekodirajoče RNA s programiranimi regulatornimi aktivnostmi] (Nika Bedrač) | ||
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Izbolj%C5%A1anje_evolucijske_stabilnosti_obremenjujo%C4%8Dih_in_toksi%C4%8Dnih_funkcij_v_E.coli_z_diferenciacijskim_genetskim_vezjem_posredovanim_z_integrazo Izboljšanje evolucijske stabilnosti obremenjujočih in toksičnih funkcij v E.coli z diferenciacijskim genetskim vezjem posredovanim z integrazo] (Nika Banovšek) | |||
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Nova_sintetična_mala_RNA%2C_ki_promovira_prekomerno_izražanje_proteinov_v_brezceličnem_sistemu Nova sintetična mala RNA, ki promovira prekomerno izražanje proteinov v brez-celičnem sistemu] (Ana Godeša) | |||
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Sistem_za_kontrolo_hitrosti_rasti_celic%2C_ki_zmanj%C5%A1uje_breme_aktivacije_genov Sistem za kontrolo hitrosti rasti celic, ki zmanjšuje breme aktivacije genov] (Neža Ribnikar) | |||
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Biohibridne_membrane_za_odstranjevanje_te%C5%BEkih_kovin_iz_vode Biohibridne membrane za odstranjevanje težkih kovin iz vode] (Tadej Uršič) | |||
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Uporaba_CIVT-SELEX_za_izbiro_aptamerov_kot_genskih_delov_za_regulacijo_genetskih_vezij_v_brezceličnem_sistemu Uporaba CIVT-SELEX za izbiro aptamerov kot genskih delov za regulacijo genetskih vezij v brezceličnem sistemu] (Klemen Kunej) | |||
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Inženiring_Cyborg_bakterij_preko_intracelularne_hidrogelacije Inženiring Cyborg bakterij preko intracelularne hidrogelacije] (Eva Oven) | |||
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Povezovanje_celi%C4%8Dne_komunikacije_z_optogenetiko:_implementacija_svetlobno_inducibilnega_medceli%C4%8Dnega_sistema_v_kvasovkah Povezovanje celične komunikacije z optogenetiko: implementacija svetlobno inducibilnega medceličnega sistema v kvasovkah] (Nika Perko) | |||
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Programabilni_sinteti%C4%8Dni_biomolekulski_kondenzati_za_nadzor_celi%C4%8Dnih_procesov Programabilni sintetični biomolekulski kondenzati za nadzor celičnih procesov] (Anja Konjc) | |||
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Razcepljena_%28split%29_aminoacil-tRNA_sintetaza_za_indukcijo_supresije_stop_kodona Razcepljena (split) aminoacil-tRNA sintetaza za indukcijo supresije stop kodona] (Špela Štor) | |||
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/S_svetlobo_inducirana_produkcija_izobutanola_in_3-metil-1-butanola_z_modificiranimi_cianobakterijami S svetlobo inducirana produkcija izobutanola in 3-metil-1-butanola s cianobakterijami] (Špela Katarina Deučman) | |||
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Raziskovanje_temperaturno_posredovane_replikacije_plazmida_kot_reverzibilnega_in_preklopljivega_proteinskega_ekspresijskega_sistema_v_Escherichia_coli Raziskovanje temperaturno posredovane replikacije plazmida kot reverzibilnega in preklopljivega proteinskega ekspresijskega sistema v ''Escherichia coli''] (Timotej Sotošek) | |||
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Konstrukcija_na_manitol_odzivnih_genetskih_stikal_na_osnovi_MtlR_škatle Konstrukcija na manitol odzivnih genetskih stikal na osnovi MtlR škatle] (Žan Fortuna) | |||
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Optogenetski_nadzor_bioprodukcije_beta-karotena_v_kvasovkah_v_%C5%A1tevilnih_laboratorijskih_proizvodnjah Optogenetski nadzor bioprodukcije beta-karotena v kvasovkah na številnih laboratorijskih skalah] (David Verdel) | |||
NAGRAJENI ŠTUDENTSKI PROJEKTI | NAGRAJENI ŠTUDENTSKI PROJEKTI | ||
Line 26: | Line 38: | ||
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/BINANOX BINANOX] (Vivian Nemanič) | # [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/BINANOX BINANOX] (Vivian Nemanič) | ||
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/CoBiota CoBiota] (Petra Sintič) | # [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/CoBiota CoBiota] (Petra Sintič) | ||
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Sporadicate Sporadicate] (Gašper Možina) | |||
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/FISHERLY FISHERLY] (Lucija Pišek) | |||
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/!MPACT !MPACT] (Jure Povšin) | |||
# [http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/AngelRoots AngelRoots] (Iva Matić) | |||
---- | ---- | ||
Latest revision as of 16:14, 29 May 2023
V študijskem letu 2022/23 študentje pri Sintezni biologiji predstavljajo naslednje teme:
RAZISKOVALNI ČLANKI
(Vpišite naslov seminarja v slovenščini in ga povežite z novo stranjo, kjer bo povzetek. Na tej novi strani naj bo pod naslovom povezava do izhodiščnega članka na spletu.)
- Rudarjenje in uporaba konstitutivnih promotorjev iz Rhodosporidium toruloides (Ana Babnik)
- Biomolekularni aktuatorji za gensko selektivno akustično manipulacijo celic (Greta Junger)
- In vivo samosestavljena siRNA kot način kombiniranega zdravljenja ulceroznega kolitisa (Tjaša Kos)
- Priprava kompleta orodij za zaznavanje kvoruma pri cianobakterijah: Razvoj medcelične koordinacije v mešanih avtotrofno-heterotrofnih skupnostih (Nuša Tkalec)
- Razvoj temperaturno inducibilnega transkripcijskega reostata pri Neurospori crassi (Luka Šegota)
- Priprava tumor ciljajočih bakterij s stikalnim sistemom, ki se odziva na dušikov(II) oksid (Ana Kodra)
- Razcepljeni ribocim, ki signale nativnih RNA poveže z ortogonalnimi proteinskimi izhodnimi signali (Ajda Beltram)
- Sistem za nadzor števila plazmidov v celici (Tulip) (Gregor Strniša)
- Skupnostna znanost je načrtovala ribosome s koristnimi fenotipi (Tanja Gošnjak)
- Pristop sintezne biologije za načrtovanje kandidata za cepivo proti delta različici SARS-CoV-2 je razkril prekinitev favoriziranega para kodonov kot boljšo strategijo pred uporabo redkih kodonov (Stefanija Ivanova)
- Dvosmerni hibridni eritritol – inducibilni promotor za sintezno biologijo v Yarrowia lipolytica (Maša Andoljšek)
- Utišanje izražanja genov s strukturno definirano zankasto strukturo male nekodirajoče RNA s programiranimi regulatornimi aktivnostmi (Nika Bedrač)
- Izboljšanje evolucijske stabilnosti obremenjujočih in toksičnih funkcij v E.coli z diferenciacijskim genetskim vezjem posredovanim z integrazo (Nika Banovšek)
- Nova sintetična mala RNA, ki promovira prekomerno izražanje proteinov v brez-celičnem sistemu (Ana Godeša)
- Sistem za kontrolo hitrosti rasti celic, ki zmanjšuje breme aktivacije genov (Neža Ribnikar)
- Biohibridne membrane za odstranjevanje težkih kovin iz vode (Tadej Uršič)
- Uporaba CIVT-SELEX za izbiro aptamerov kot genskih delov za regulacijo genetskih vezij v brezceličnem sistemu (Klemen Kunej)
- Inženiring Cyborg bakterij preko intracelularne hidrogelacije (Eva Oven)
- Povezovanje celične komunikacije z optogenetiko: implementacija svetlobno inducibilnega medceličnega sistema v kvasovkah (Nika Perko)
- Programabilni sintetični biomolekulski kondenzati za nadzor celičnih procesov (Anja Konjc)
- Razcepljena (split) aminoacil-tRNA sintetaza za indukcijo supresije stop kodona (Špela Štor)
- S svetlobo inducirana produkcija izobutanola in 3-metil-1-butanola s cianobakterijami (Špela Katarina Deučman)
- Raziskovanje temperaturno posredovane replikacije plazmida kot reverzibilnega in preklopljivega proteinskega ekspresijskega sistema v Escherichia coli (Timotej Sotošek)
- Konstrukcija na manitol odzivnih genetskih stikal na osnovi MtlR škatle (Žan Fortuna)
- Optogenetski nadzor bioprodukcije beta-karotena v kvasovkah na številnih laboratorijskih skalah (David Verdel)
NAGRAJENI ŠTUDENTSKI PROJEKTI
(Vpišite naslov seminarja v slovenščini in ga povežite z novo stranjo, kjer bo povzetek. Na tej novi strani naj bo pod naslovom povezava do wiki strani študentske ekipe, katere projekt opisujete.)
- MonChassis (Nika Tomsič)
- FIAT LUX (Neža Lanišek)
- NETLANTIS (Maša Gabrič)
- BINANOX (Vivian Nemanič)
- CoBiota (Petra Sintič)
- Sporadicate (Gašper Možina)
- FISHERLY (Lucija Pišek)
- !MPACT (Jure Povšin)
- AngelRoots (Iva Matić)
Povzetki v slovenščini naj imajo 1200-1500 besed (viri v to vsoto ne štejejo). Povzetek je treba objaviti dva dni pred predstavitvijo do polnoči (za seminarje v sredo torej v ponedeljek). Predstavitev seminarja naj bo dolga 15 minut (13-17). Sledila bo približno 5-minutna razprava.
Terminski razpored je razviden iz preglednice na strežniku Google Drive.
Kako je videti seznam seminarjev, lahko preverite pri lanskem letniku: Seminarji_SB_2021/22.