MBT seminarji 2019

Seznam seminarjev iz Molekularne biotehnologije v študijskem letu 2018/19

Na tej strani je seznam odobrenih člankov za seminar ter povezave do člankov in do povzetkov, ki jih morate objaviti najkasneje do torka do polnoči v tednu, ko imate seminar (v četrtek). Angleški naslov prevedite tudi v slovenščino - to bo naslov povzetka, ki ga objavite na posebni strani, tako kot so to naredili kolegi pred vami (oz. predlani).

Način vnosa:

1. The importance of Arabidopsis glutathione peroxidase 8 for protecting Arabidopsis plant and E. coli cells against oxidative stress (A. Gaber; GM Crops & Food 5(1), 2014; http://dx.doi.org/10.4161/gmcr.26979) Pomen glutation peroksidaze 8 iz repnjakovca za zaščito rastline Arabidopsis thaliana in bakterije Escherichia coli pred oksidativnim stresom. Janez Novak

(slovenski naslov povežite z novo stranjo, na kateri bo povzetek)

Naslovi odobrenih člankov po temah:

Gensko spremenjene rastline (14. marec)

1. Production of functional human interleukin 37 using plants (N. Alqazlan, H. Diao, A. M. Jevnikar, and S. Ma; Plant Cell Rep. 38 (3), Mar. 2019; https://doi.org/10.1007/s00299-019-02377-2). Proizvodnja funkcionalnega človeškega interlevkina 37 v rastlinah. Špela Malenšek

Gensko spremenjene živali (21. marec)

1. Myopia disease mouse models: a missense point mutation (S673G) and a protein-truncating mutation of the Zfp644 mimic human disease phenotype. (K. I. Szczerkowska et al.; Cell Biosci. 9, 2019; https://doi.org/10.1186/s13578-019-0280-4). Mišji modeli kratkovidnosti: drugačnopomenska točkovna mutacija (S673G) in skrajševalna mutacija v Zfp644 posnemata fenotip človeške bolezni Rok Miklavčič
2. A chicken bioreactor for efficient production of functional cytokines (Herron L.R. et al.; BMC Biotechnol. 18 (1), Dec. 2018; https://doi.org/10.1186/s12896-018-0495-1).Uporaba kokošjega bioreaktorja za učinkovito proizvodnjo funkcionalnih citokinov Blaž Lebar
3. Influence of a growth hormone transgene on the genetic architecture of growth-related traits: A comparative analysis between transgenic and wild-type coho salmon (M. Kodama, K. A. Naish in R. H. Devlin; Evol Appl. 11(10), 2018; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6231474/). Vpliv transgena rastnega hormona na genetsko arhitekturo lastnosti povezanimi z rastjo: primerjalna analiza transgenega srebrnega lososa in srebrnega lososa divjega tipa Nuša Kelhar

Okolje (4. april)

1. Bioremediation of soil long-term contaminated with PAHs by algal-bacterial synergy of Chlorella sp. MM3 and Rhodococcus wratislaviensis strain 9 in slurry phase (S.R.Subashchandrabose, K. Venkateswarlu in K. Venkidusamy; Sci. Total Environ., 2019; https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S004896971835349X). Bioremediacija zemlje, dolgotrajno kontaminirane s policikličnimi aromatskimi ogljikovodiki z sinergijo alge Chlorella sp. MM3 in seva 9 bakterije Rhodococcus wratislaviensis v suspenziji. Eva Rajh
2. Anaerobic degradation of xenobiotic isophthalate by the fermenting bacterium Syntrophorhabdus aromaticivorans (M. Junghare, D. Spiteller in B. Schink; ISME J, 2019; https://doi.org/10.1038/s41396-019-0348-5). Anaerobna razgradnja ksenobiotika izoftalata pri fermentirajoči bakteriji Syntrophorhabdus aromaticivorans. Elvira Boršič
3. Biodegradation and toxicity of emerging contaminants: Isolation of an exopolysaccharide-producing Sphingomonas sp. for ionic liquids bioremediation. (M. Koutinas et al.; J. Haz. Mat. 365, Mar. 2019; https://doi.org/10.1016/j.jhazmat.2018.10.059). Biorazgradnja in toksičnost nastalih produktov: izolacija mikroorganizma Sphingomonas MKIV, ki proizvaja eksopolisaharide, za bioremediacijo ionskih tekočin Katja Dolenc

Terapevtski proteini in protitelesa (11. april)

1. Constructive approach for synthesis of a functional IgG using a reconstituted cell-free protein synthesis system (S. Murakami et al; Scientific Reports 9, 2019; https://doi.org/10.1038/s41598-018-36691-8). Učinkovit pristop za sintezo funkcionalnega IgG z uporabo rekonstruiranega brezceličnega sistema za sintezo proteinov. Vida Štrancar
2. New therapeutic approach for targeting Hippo signalling pathway (L. Dominguez-Berrocal et al; Scientific Reports 9(4771), 2019; https://www.nature.com/articles/s41598-019-41404-w). Nov terapevtski pristop za ciljanje signalne poti Hippo. Ana Halužan Vasle
3. Use of a design of experiments approach to optimise production of a recombinant antibody fragment in the periplasm of Escherichia coli: selection of signal peptide and optimal growth conditions (Kasli et al. AMB Expr (2019) 9:5; https://doi.org/10.1186/s13568-018-0727-8). Uporaba pristopa načrtovanja eksperimentov za optimizacijo proizvodnje rekombinantnega fragmenta protitelesa v periplazmi Escherichie coli: izbira signalnega peptida in optimalnih pogojev rasti. Nina Mavec

Diagnostiki in cepiva (18. april)

1. A viral-vectored RSV vaccine induces long-lived humoral immunity in cotton rats (J. Grieves, Z. Yin, A. Garcia-Sastre et al.; Vaccine 36(26), 2018; https://doi.org/10.1016/j.vaccine.2018.04.089) Cepivo proti RSV, pripravljeno z virusnim vektorjem, inducira dolgotrajno humoralno imunost pri bombažnih podganah. Nina Kobe
2. Optimization of a multivalent peptide vaccine for nicotine addiction (D. F. Zeigler, R. Roque, C. H. Clegg; Vaccine 37(12), 2019; https://doi.org/10.1016/j.vaccine.2019.02.003) Optimizacija večvalentnega peptidnega cepiva za nikotinsko odvisnost. Iza Oblak
3. Design of a Type-1 Diabetes Vaccine Candidate Using Edible Plants Expressing a Major Autoantigen (E. Bertini et al., Front. Plant Sci. 9, 2018 https://doi.org/10.3389/fpls.2018.00572) Načrtovanje kandidatnega cepiva za diabetes tipa I s pomočjo užitnih rastlin, ki izražajo pomemben avtoantigen. Katarina Petra van Midden

LMW učinkovine (25. april)

1. Metabolic engineering of Escherichia coli for de novo biosynthesis of vitamin B₁₂ (H. Fang et al., Nat Commun. 9(1), 2018 https://doi.org/10.1038/s41467-018-07412-6). Metabolno inženirstvo bakterije Escherichia coli za de novo sintezo vitamina B₁₂. Valentina Novak
2. Genome-Wide Mutagenesis Links Multiple Metabolic Pathways with Actinorhodin Production in Streptomyces coelicolor (Z. Xu et al, Appl. Environ. Microbiol. 85(7), 2019, https://doi.org/10.1128/AEM.03005-18). Mutageneza celotnega genoma odkriva povezave med metabolnimi potmi in produkcijo aktinorhodina v Streptomyces coelicolor. David Titovšek
3. Cost-effective production of recombinant peptides in Escherichia coli (A. Gaglione et al, N. Biotechnol. 51, 2019, https://doi.org/10.1016/j.nbt.2019.02.004.) Stroškovno učinkovita proizvodnja rekombinantnih peptidov v Escherichia coli Bor Klančnik

Male molekule in polimeri (9. maj)

1. Metabolic engineering of the thermophilic filamentous fungus Myceliophthora thermophila to produce fumaric acid (S. Gu et al.; Biotechnology for Biofuels, 11(1), 2019; https://doi.org/10.1186/s13068-018-1319-1)Metabolni inženiring termofilne filamentozne glive Myceliophthora thermophila za proizvodnjo fumarne kislinePrimož Bembič
2. Karin Dobravc Škof

Pretvorba biomase in bioenergenti (16. maj)

1. Maksimiljan Adamek
2. Aljoša Marinko
3. n-Butanol and ethanol production from cellulose by Clostridium cellulovorans overexpressing heterologous aldehyde/alcohol dehydrogenases (T. Bao, J. Zhao, J. Li, X. Liu in S.-T. Yang; Bioresource Technology 285, 2019; https://doi.org/10.1016/j.biortech.2019.121316) Proizvodnja n-butanola in etanola iz celuloze v bakteriji Clostridium cellulovorans s prekomernim izražanjem aldehid in alkohol dehidrogenaz Jošt Hočevar

Novi pristopi v molekularni biotehnologiji (23. maj)

1. Katja Kunčič
2. Peter Pečan
3. Jaka Kos

Rezervni termin (30. maj)

1. Mia Žganjar
2. Engineering Protein-Secreting Plasma Cells by Homology-Directed Repair in Primary Human B Cells (Hung et al., Mol Ther. 7;26(2):456-467. https://doi.org/10.1016/j.ymthe.2017.11.012). Inženirstvo spreminjanja plazmatk s popravljanjem primarnih človeških celic B na osnovi homologije. Nives Ražnjević
3. Ana Müller

Nazaj na predmet Molekularna_biotehnologija.