Seminarji SB 2018/19: Difference between revisions

From Wiki FKKT
Jump to navigationJump to search
No edit summary
No edit summary
 
(84 intermediate revisions by 29 users not shown)
Line 11: Line 11:
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Raznoliko_in_modelno_zasnovana_priprava_sinteti%C4%8Dnih_genskih_vezij_s_predvidenimi_lastnostmi Raznoliko in modelno zasnovana priprava sintetičnih genskih vezij s predvidenimi lastnostmi] (Matej Kolarič)
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Raznoliko_in_modelno_zasnovana_priprava_sinteti%C4%8Dnih_genskih_vezij_s_predvidenimi_lastnostmi Raznoliko in modelno zasnovana priprava sintetičnih genskih vezij s predvidenimi lastnostmi] (Matej Kolarič)


[[Dispersing biofilms with engineered enzymatic bacteriophage]] (Fran Krstanović)
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Nekaj_pogledov_na_sistemsko_biologijo_kvasovke Nekaj pogledov na sistemsko biologijo kvasovke] (Gašper Žun)
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Organizacija_znotrajceli%C4%8Dnih_reakcij_z_razumsko_na%C4%8Drtovanimi_RNA_sestavi#Na.C4.8Drtovanje_in_sestavljanje_RNA_sestavov Organizacija znotrajceličnih reakcij z razumsko načrtovanimi RNA sestavi] (Urška Jelenovec)
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Biolo%C5%A1ko_vezje_na_osnovi_RNA-interference_za_identifikacijo_specifi%C4%8Dnih_rakavih_celic Biološko vezje na osnovi RNA-interference za identifikacijo specifičnih rakavih celic] (Gašper Marinšek)
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Kontrola_hitrosti_translacije_preko_pomožnega_mesta_5’-UTR:_energijski_kompromis_med_dostopnostjo%2C_selektivnim_razvijanjem_RNA-struktur_in_drsenjem_30S_ribosomske_podenote_po_RNA-strukturah Kontrola hitrosti translacije preko pomožnega mesta 5’-UTR: energijski kompromis med dostopnostjo, selektivnim razvijanjem RNA-struktur in drsenjem 30S ribosomske podenote po RNA-strukturah] (Neža Koritnik)
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Preoblikovanje_genskega_skupka_za_fiksacijo_dušika_bakterije_Klebsiella_oxytoca Preoblikovanje genskega skupka za fiksacijo dušika bakterije ''Klebsiella oxytoca''] (Gašper Virant)
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Negativna_samoregulacija_linearizira_odziv_na_odmerek_in_zavira_heterogenost_genskega_izražanja Negativna samoregulacija linearizira odziv na odmerek in zavira heterogenost genskega izražanja] (Primož Tič)
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Design_and_analysis_of_synthetic_carbon_fixation_pathways Design and analysis of synthetic carbon fixation pathways] (Marija Atanasova)
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Pol-sinteti%C4%8Den_organizem_z_raz%C5%A1irjeno_gensko_abecedo Pol-sintetičen organizem z razširjeno gensko abecedo] (Peter Pečan)
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Programirano_uti%C5%A1anje_in_aktivacija_izra%C5%BEanja_bakterijskega_gena_z_uporabo_konstruiranega_CRISPR-Cas_sistema Programirano utišanje in aktivacija izražanja bakterijskega gena z uporabo konstruiranega CRISPR-Cas sistema] (Tjaša Sorčan)
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Sintezna_optogenetska_transkripcijska_naprava_za_izboljšanje_homeostaze_krvnega_sladkorja_pri_miših Sintezna optogenetska transkripcijska naprava za izboljšanje homeostaze krvnega sladkorja pri miših] (Natalija Pucihar)
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Inženiring_bakterij_Escherichia_coli_odzivnih_na_svetlobo Inženiring bakterij ''Escherichia coli'' odzivnih na svetlobo] (Karmen Žbogar)
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Kombinatori%C4%8Dni_in%C5%BEeniring_intergenskih_regij_v_operonih_uravnava_izra%C5%BEanje_ve%C4%8D_genov Kombinatorični inženiring intergenskih regij v operonih uravnava izražanje več genov] (Urška Kašnik)
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Stohasti%C4%8Dna_oja%C4%8Ditev_in_signalizacija_v_substratnih_ciklih_s_%C5%A1umom_induciranih_bistabilnosti_z_oscilacijami Stohastična ojačitev in signalizacija v substratnih ciklih s šumom induciranih bistabilnosti z oscilacijami] (Uroš Zavrtanik)
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Zaznavalni_niz_genetskih_biopikslov_sklopljenih_preko_radikalov Zaznavalni niz genetskih "biopikslov", sklopljenih preko radikalov] (Miha Koprivnikar Krajnc)
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Modularna_optimizacija_večgenskih_poti_za_proizvodnjo_maščobnih_kislin_v_E._coli Modularna optimizacija večgenskih poti za proizvodnjo maščobnih kislin v ''E. coli''] (Špela Koren)
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Razodetje_povezovalnega_kompleksa_med_endoplazemskim_retikulumom_in_mitohondrijem_s_presejalnim_testom_sintezne_biologije Razodetje povezovalnega kompleksa med endoplazemskim retikulumom in mitohondrijem s presejalnim testom sintezne biologije] (Blaž Lebar)


NAGRAJENI ŠTUDENTSKI PROJEKTI  
NAGRAJENI ŠTUDENTSKI PROJEKTI  


(Vpišite naslov seminarja v slovenščini in ga povežite z novo stranjo, kjer bo povzetek. Na tej novi strani naj bo pod naslovom povezava do wiki strani študentske ekipe, katere projekt opisujete.) <br>
(Vpišite naslov seminarja v slovenščini in ga povežite z novo stranjo, kjer bo povzetek. Na tej novi strani naj bo pod naslovom povezava do wiki strani študentske ekipe, katere projekt opisujete.) <br>
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Phactory:_proizvodnja_bakteriofagov_za_precizno_zdravljenje Phactory: proizvodnja bakteriofagov za precizno zdravljenje] (Rok Miklavčič)
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Canditect:_hitra_detekcija_vaginalne_infekcije_s_Candido_albicans_z_uporabo_sistema_CRISPR/dCas9 Canditect – hitra detekcija vaginalne infekcije s Candido albicans z uporabo sistema CRISPR/dCas9] (Jerneja Ovčar)


[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/CAPOEIRA_-_razvoj_personaliziranega_cepiva_proti_raku_in_sistema_za_spremljanje_odziva_na_zdravljenje CAPOEIRA – razvoj personaliziranega cepiva proti raku in sistema za spremljanje odziva na zdravljenje] (Anamarija Habič)


[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Biotic_Blue_-_encimska_razgradnja_zdravilnih_u%C4%8Dinkovin_v_odpadnih_vodah#BIOTIC_BLUE BIOTIC BLUE - encimska razgradnja zdravilnih učinkovin v odpadnih vodah] (Tina Požun)


[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Of_CO2urse_-_sistem_za_zmanj%C5%A1evanje_izpustov_ogljikovega_dioksida_v_industriji Of CO<sub>2</sub>urse - sistem za zmanjševanje izpustov ogljikovega dioksida v industriji] (Kity Požek)
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/Cockroach_terminator Cockroach terminator]] (Roberta Mulac)
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/MiBiome_-_probioti%C4%8Dna_bakterija_za_zdravljenje_kroni%C4%8Dne_vnetne_%C4%8Drevesne_bolezni MiBiome - probiotična bakterija za zdravljenje kronične vnetne črevesne bolezni] (Ernest Šprager)
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/BioWatcher_pametna_ura_za_sledenje_ravni_biomarkerjev_za_bolezni BioWatcher: Pametna ura za sledenje ravni biomarkerjev za bolezni] (Nina Mavec)
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/CAT-Seq:_Visokoprepustna_metoda_za_analizo_katalitske_aktivnosti_biomolekul CAT-Seq: Visokoprepustna metoda za analizo katalitske aktivnosti biomolekul] (Bine Tršavec)
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/VIBRIGENS:_pospe%C5%A1evanje_procesov_sintezne_biologije_z_Vibrio_natriegens VIBRIGENS: pospeševanje procesov sintezne biologije z ''Vibrio natriegens''] (Tadej Satler)
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/APIS-_nov_pristop_za_zdravljenje_oku%C5%BEbe_z_Nosema_caranae_pri_%C4%8Debelah#PROJEKT_APIS APIS- nov pristop za zdravljenje okužbe z Nosema caranae pri čebelah] (Jerneja Kocutar)
[http://wiki.fkkt.uni-lj.si/index.php/StyGreen_-_proizvodnja_stirena_iz_obnovljivih_virov:  StyGreen - proizvodnja stirena iz obnovljivih virov] (Milena Stojkovska)


Povzetki v slovenščini naj imajo 1200-1500 besed (viri v to vsoto ne štejejo). Predstavitev seminarja naj bo dolga 15 minut (13-17). Sledila bo razprava, ki praviloma ne bo daljša od 5 minut.  
Povzetki v slovenščini naj imajo 1200-1500 besed (viri v to vsoto ne štejejo). Predstavitev seminarja naj bo dolga 15 minut (13-17). Sledila bo razprava, ki praviloma ne bo daljša od 5 minut.  
Line 41: Line 94:
3 <br>
3 <br>
4 <br>
4 <br>


4.12.<br>
4.12.<br>
Urška Kašnik<br>
Gašper Žun<br>
2  Fran Krstanovic<br>
2  Fran Krstanovic<br>
3  <br>
3  <br>
Gašper Žun<br>
4  <br>


6.12.<br>
6.12.<br>
1  Urška Jelenovec<br>
1  Urška Jelenovec<br>
Ernest Šprager<br>
Rok Miklavčič <br>
Rok Miklavčič <br>
3  <br>
4  <br>
4  <br>


Line 68: Line 120:


3.1.<br>
3.1.<br>
1  <br>
Nina Mavec<br>
Nina Mavec<br>
Primož Tič<br>
Primož Tič<br>
Ernest Šprager<br>
Milena Stojkovska<br>
4  <br>


8.1.<br>
8.1.<br>
Line 80: Line 132:


10.1.<br>
10.1.<br>
Špela Koren<br>
Urška Kašnik<br>
2  Natalija Pucihar<br>
2  Natalija Pucihar<br>
3  Karmen Žbogar<br>
3  Karmen Žbogar<br>
Line 87: Line 139:
15.1.<br>
15.1.<br>
1  Jerneja Kocutar<br>
1  Jerneja Kocutar<br>
Blaž Lebar<br>
Špela Koren<br>
3  Tadej Satler<br>
3  Tadej Satler<br>
4  Miha Koprivnikar Krajnc<br>
4  Miha Koprivnikar Krajnc<br>
17.1.<br>
1  Milena Stojkovska<br>
2  Blaž Lebar<br>

Latest revision as of 19:54, 15 January 2019

V študijskem letu 2018/19 študentje predstavljajo naslednje teme:

RAZISKOVALNI ČLANKI

(Vpišite naslov seminarja v slovenščini in ga povežite z novo stranjo, kjer bo povzetek. Na tej novi strani naj bo pod naslovom povezava do izhodiščnega članka na spletu.)

MoClo: modularni klonirni sistem za standardizirano sestavljanje večgenskih konstruktov (Valentina Levak)

RNA-stikala tipa Toehold: de novo oblikovani regulatorji izražanja genov (Špela Malenšek)

Raznoliko in modelno zasnovana priprava sintetičnih genskih vezij s predvidenimi lastnostmi (Matej Kolarič)

Dispersing biofilms with engineered enzymatic bacteriophage (Fran Krstanović)

Nekaj pogledov na sistemsko biologijo kvasovke (Gašper Žun)

Organizacija znotrajceličnih reakcij z razumsko načrtovanimi RNA sestavi (Urška Jelenovec)

Biološko vezje na osnovi RNA-interference za identifikacijo specifičnih rakavih celic (Gašper Marinšek)

Kontrola hitrosti translacije preko pomožnega mesta 5’-UTR: energijski kompromis med dostopnostjo, selektivnim razvijanjem RNA-struktur in drsenjem 30S ribosomske podenote po RNA-strukturah (Neža Koritnik)

Preoblikovanje genskega skupka za fiksacijo dušika bakterije Klebsiella oxytoca (Gašper Virant)

Negativna samoregulacija linearizira odziv na odmerek in zavira heterogenost genskega izražanja (Primož Tič)

Design and analysis of synthetic carbon fixation pathways (Marija Atanasova)

Pol-sintetičen organizem z razširjeno gensko abecedo (Peter Pečan)

Programirano utišanje in aktivacija izražanja bakterijskega gena z uporabo konstruiranega CRISPR-Cas sistema (Tjaša Sorčan)

Sintezna optogenetska transkripcijska naprava za izboljšanje homeostaze krvnega sladkorja pri miših (Natalija Pucihar)

Inženiring bakterij Escherichia coli odzivnih na svetlobo (Karmen Žbogar)

Kombinatorični inženiring intergenskih regij v operonih uravnava izražanje več genov (Urška Kašnik)

Stohastična ojačitev in signalizacija v substratnih ciklih s šumom induciranih bistabilnosti z oscilacijami (Uroš Zavrtanik)

Zaznavalni niz genetskih "biopikslov", sklopljenih preko radikalov (Miha Koprivnikar Krajnc)

Modularna optimizacija večgenskih poti za proizvodnjo maščobnih kislin v E. coli (Špela Koren)

Razodetje povezovalnega kompleksa med endoplazemskim retikulumom in mitohondrijem s presejalnim testom sintezne biologije (Blaž Lebar)

NAGRAJENI ŠTUDENTSKI PROJEKTI

(Vpišite naslov seminarja v slovenščini in ga povežite z novo stranjo, kjer bo povzetek. Na tej novi strani naj bo pod naslovom povezava do wiki strani študentske ekipe, katere projekt opisujete.)
Phactory: proizvodnja bakteriofagov za precizno zdravljenje (Rok Miklavčič)

Canditect – hitra detekcija vaginalne infekcije s Candido albicans z uporabo sistema CRISPR/dCas9 (Jerneja Ovčar)

CAPOEIRA – razvoj personaliziranega cepiva proti raku in sistema za spremljanje odziva na zdravljenje (Anamarija Habič)

BIOTIC BLUE - encimska razgradnja zdravilnih učinkovin v odpadnih vodah (Tina Požun)

Of CO2urse - sistem za zmanjševanje izpustov ogljikovega dioksida v industriji (Kity Požek)

Cockroach terminator] (Roberta Mulac)

MiBiome - probiotična bakterija za zdravljenje kronične vnetne črevesne bolezni (Ernest Šprager)

BioWatcher: Pametna ura za sledenje ravni biomarkerjev za bolezni (Nina Mavec)

CAT-Seq: Visokoprepustna metoda za analizo katalitske aktivnosti biomolekul (Bine Tršavec)

VIBRIGENS: pospeševanje procesov sintezne biologije z Vibrio natriegens (Tadej Satler)

APIS- nov pristop za zdravljenje okužbe z Nosema caranae pri čebelah (Jerneja Kocutar)

StyGreen - proizvodnja stirena iz obnovljivih virov (Milena Stojkovska)

Povzetki v slovenščini naj imajo 1200-1500 besed (viri v to vsoto ne štejejo). Predstavitev seminarja naj bo dolga 15 minut (13-17). Sledila bo razprava, ki praviloma ne bo daljša od 5 minut.



Razpored po datumih predstavitev (pri vsakem terminu je navedeno število možnih seminarjev; vpišite ime in priimek pri dnevu, ko želite predstaviti seminar ter dopišite naslov seminarja, ki naj bo povezan s povzetkom):

22.11.
1
2 Valentina Levak

27.11.
1
2
3
4

29.11.
1 Matej Kolarič
2 Špela Malenšek
3
4

4.12.
1 Gašper Žun
2 Fran Krstanovic
3
4

6.12.
1 Urška Jelenovec
2 Rok Miklavčič
3
4

11.12.
1 Jerneja Ovčar
2 Neža Koritnik
3 Gašper Virant
4 Gašper Marinšek

18.12.
1 Tina Požun
2 Anamarija Habič
3 Roberta Mulac
4 Kity Požek

3.1.
1 Nina Mavec
2 Primož Tič
3 Ernest Šprager
4

8.1.
1 Marija Atanasova
2 Bine Tršavec
3 Peter Pečan
4 Tjaša Sorčan

10.1.
1 Urška Kašnik
2 Natalija Pucihar
3 Karmen Žbogar
4 Uroš Zavrtanik

15.1.
1 Jerneja Kocutar
2 Špela Koren
3 Tadej Satler
4 Miha Koprivnikar Krajnc


17.1.
1 Milena Stojkovska
2 Blaž Lebar