BIO2 Seminar 2017

Biokemijski seminar

doc. dr. Gregor Gunčar, K2.022

Seznam seminarjev

Ime Priimek	poglavje	Naslov seminarja	Recenzent 1	Recenzent 2	Datum oddaje	Datum recenzije	Datum predstavitve
Ines Medved	12	Receptorji za vonj v epidermisu	Špela Supej	Lea Knez	20/10/16	23/10/16	25/10/16
Luka Gregorič	12	Pozitivne vloge negativnih regulatorjev	Uroš Prešern	Katja Doberšek	20/10/16	23/10/16	25/10/16
Daria Latysheva	12	The role of intrinsically disordered proteins in signallng pathways and regulation	Luka Fratina	Martin Špendl	20/10/16	23/10/16	25/10/16
Polona Skrt	12	Mehanizem zaznavanja okusa maščobe	Andreja Habič	Ajda Galič	03/11/16	06/11/16	08/11/16
Peter Škrinjar	12	Receptorji za okus in njihova povezava z debelostjo	Andrej Race	Nika Zaveršek	03/11/16	06/11/16	08/11/16
Milica Janković	12	Nuklearni receptorji: Karakteristike in regulacija receptorjev ter identifikacija ligandov	Anže Jenko	Nika Goršek	03/11/16	06/11/16	08/11/16
Tina Turel	14-15	Vpliv mikroorganizmov na presnovo glukoze	Ines Medved	Špela Supej	10/11/16	13/11/16	15/11/16
Barbara Slapnik	14-15	Regulacija metabolizma glukoze v celičnih kulturah	Luka Gregorič	Uroš Prešern	10/11/16	13/11/16	15/11/16
Ana Maklin	14-15	Vloga PGP in PHO13 v metabolizmu	Daria Latysheva	Luka Fratina	10/11/16	13/11/16	15/11/16
Ajda Krč	16	Spremembe v delovanju Krebsovega cikla in sposobnost prilagajanja parazitov na razmere v okolju	Polona Skrt	Andreja Habič	17/11/16	20/11/16	22/11/16
Urban Hribar	16	Metabolizem polariziranih makrofagov	Peter Škrinjar	Andrej Race	17/11/16	20/11/16	22/11/16
Urška Zagorc	16	Salmonela in citratni cikel	Milica Janković	Anže Jenko	17/11/16	20/11/16	22/11/16
Patrik Levačić	17	Ceramidi in njihova povezava z debelostjo	Tina Turel	Ines Medved	24/11/16	27/11/16	29/11/16
Jerneja Nimac	17	Ketonska telesca kot signalni metaboliti	Barbara Slapnik	Luka Gregorič	24/11/16	27/11/16	29/11/16
Lija Srnovršnik	17	Hepatična oksidacija maščobnih kislin med stradanjem	Ana Maklin	Daria Latysheva	24/11/16	27/11/16	29/11/16
Nika Mikulič	18	Hiperamoniemija in metode zdravljenja	Ajda Krč	Polona Skrt	01/12/16	04/12/16	06/12/16
Tanja Zupan	18	Presnovne bolezni aminokislin	Urban Hribar	Peter Škrinjar	01/12/16	04/12/16	06/12/16
Anja Tavčar	18	Regulacija imunskega odziva z metabolizmom l-arginina	Urška Zagorc	Milica Janković	01/12/16	04/12/16	06/12/16
Maja Vrabec	19	Poškodbe mitohondrijske DNA in popravljalni mehanizmi	Patrik Levačić	Tina Turel	08/12/16	11/12/16	13/12/16
Špela Deučman	19	Vloga reaktivnih kisikovih zvrsti (ROS) pri celični signalizaciji	Jerneja Nimac	Barbara Slapnik	08/12/16	11/12/16	13/12/16
Anja Černe	19	Vpliv mitohondrijskega stresa na staranje	Lija Srnovršnik	Ana Maklin	08/12/16	11/12/16	13/12/16
Lea Knez	20	Trehaloza-6-fosfat kot signalna molekula v rastlinah	Nika Mikulič	Ajda Krč	15/12/16	18/12/16	20/12/16
Katja Doberšek	20	Vpliv zunajceličnih dejavnikov na sintezo celuloze v rastlinskih celicah	Tanja Zupan	Urban Hribar	15/12/16	18/12/16	20/12/16
Martin Špendl	20	Lektini in prepoznavanje sladkornih podenot	Anja Tavčar	Urška Zagorc	15/12/16	18/12/16	20/12/16
Ajda Galič	21		Katja Dolenc	Patrik Levačić	29/12/16	01/01/17	03/01/17
Nika Zaveršek	21	Povezava velike depresivne motnje z razmerjem med omega-6 in omega-3 maščobnimi kislinami	Špela Deučman	Jerneja Nimac	29/12/16	01/01/17	03/01/17
Nika Goršek	21	Lipidi v gostiteljski celici ob okužbi z virusom hepatitisa C	Anja Černe	Lija Srnovršnik	29/12/16	01/01/17	03/01/17
Špela Supej	22	Biosinteza rastlinskih alkaloidov	Lea Knez	Katja Dolenc	05/01/17	08/01/17	10/01/17
Uroš Prešern	22	Ribonukleotid reduktaza: encim, ki po vseh letih od odkritja še vedno preseneča	Katja Doberšek	Tanja Zupan	05/01/17	08/01/17	10/01/17
Luka Fratina	22	Industrijska proizvodnja aminokislin	Martin Špendl	Anja Tavčar	05/01/17	08/01/17	10/01/17
Andreja Habič	23	Rjavo maščobno tkivo kot sekrecijski organ	Ajda Galič	Maja Vrabec	12/01/17	15/01/17	17/01/17
Andrej Race	23	Ghrelin	Nika Zaveršek	Špela Deučman	12/01/17	15/01/17	17/01/17
Anže Jenko	23	Sprožitev metamorfoze pri vinskih mušicah	Nika Goršek	Anja Černe	12/01/17	15/01/17	17/01/17
Katja Dolenc	23	Oksitocin in njegova vloga pri prosocialnih učinkih MDMA (ecstasija)	Maja Vrabec	Nika Mikulič	20/01/17	22/01/17	24/01/17

• številka v okencu za temo pomeni poglavje v Lehningerju, v katerega naj izbrana tema spada

Gradivo za predavanja

Gradivo za predavanja in seminarje najdete na http://bio.ijs.si/~zajec/bio2/ username: bio2 password: samozame

Naloga

Vaša naloga za seminar je:
Samostojno pripraviti seminar o seminarski temi, ki vam je bila dodeljena. Za osnovo morate vzeti pregledni članek iz revije, ki ima faktor vpliva nad 5 (npr. TIBS. Poiskati morate še vsaj tri znanstvene članke, ki se nanašajo na opisano temo in jih uporabiti kot podlago za seminarsko nalogo! Članki so dostopni tukaj.

Za pripravo seminarja velja naslednje:

• Povzetek seminarja opišete na wikiju v 200 besedah (+- dvajset besed) - najkasneje do dne ko morate oddati seminar recenzentom.
• Povezavo do povzetka vnesete v tabelo seminarjev tekočega letnika.
• Seminar pripravite v obliki seminarske naloge na ~5-12 straneh A4 (pisava 12, enojni razmak, 2,5 cm robovi). Zelo pomembno je, da je obseg od 2700 do 3000 besed , a ne več kot 3500 besed. Seminarska naloga mora vsebovati najmanj tri slike. Eno sliko morate narisati sami in to pod sliko posebej označiti. Slika mora imeti legendo in v besedilu mora biti na ustreznem mestu sklic na sliko.
• Seminar oddajte do datuma oddaje, ki je naveden v tabeli v elektronski obliki z uporabo tega obrazca.
• Vsi seminarji so v elektronski obliki dostopni tukaj.
• Recenzenti do dneva določenega v tabeli določijo popravke (v elektronski obliki) in podajo oceno pisnega dela. Popravljen seminar oddajte z uporabo tega obrazca.
• Ustna predstavitev sledi na dan, ki je vpisan v tabeli. Za predstavitev je na voljo 20 minut. Recenzenti morajo biti na predstavitvi prisotni.
• Predstavitvi sledi razprava. Recenzenti podajo oceno predstavitve in postavijo najmanj dve vprašanji.Vsi ostali morajo postaviti še dve dodatni vprašanji v toku celega seminarskega obdobja. Vprašanja, ki ste jih postavili vpišite na tukaj.
• Na dan predstavitve morate docentu še pred predstavitvijo oddati končno (popravljeno) in natisnjeno verzijo seminarja v enem izvodu, elektronsko verzijo seminarja in predstavitev pa oddati na strežnik na dan predstavitve do polnoči.
• Seminarska naloga in povzetek morajo biti v slovenskem jeziku, razen za študente, katerih materni jezik ni slovenščina. Ti lahko oddajo seminar v angleškem jeziku.

Imena datotek

Prosim vas, da vse datoteke, ki mi jih pošiljate poimenujete po naslednjem receptu:

• 312_BIO_Priimek_Ime.doc(x) za seminar, npr. 312_BIO_Guncar_Gregor.docx
• 312_BIO_Priimek_ime_final.doc(x) za končno verzijo seminarja
• 312_BIO_Priimek_Ime_rec_Priimek2.doc(x) za recenzijo, kjer je Priimek2 priimek recenzenta, npr. 312_BIO_Guncar_Gregor_rec_Scott.docx (če se pišete Scott in odajate recenzijo za seminar, ki ga je napisal Gunčar)
• 312_BIO_Priimek_Ime.ppt(x) za prezentacijo, npr 312_BIO_Guncar_Gregor.pptx
• 312_BIO_Priimek_ime_poprava.doc(x) za popravljeno končno verzijo seminarja, če so popravki manjši

Ocenjevanje seminarjev

Recenzenti ocenijo seminar tako, da izpolnijo recenzentsko poročilo na spletu. Recenzentsko poročilo morate oddati najkasneje do 21:00, en dan pred predstavitvijo seminarja.

Mnenje o predstavitvi

Vsak posameznik odda svoje mnenje o predstavitvi takoj po predstavitvi z online glasovanjem.

Urejanje spletnih strani na wikiju

Wiki so razvili zato, da lahko spletne vsebine ureja vsakdo. Ukazi so preprosti, dokler si ne zamislite česa prav posebnega. Vseeno pa je Word v primerjavi z wikijem pravo čudežno orodje... Če imate težave z oblikovanjem besedila, si preberite poglavje o urejanju wiki-strani na Wikipediji (tule v angleščini in tu v slovenščini). Pomaga tudi, če pogledate, kako je zapisana kakšna stran, ki se vam zdi v redu: kliknite na zavihek 'Uredite stran' in si poglejte, kako so vpisane povezave, kako nov odstavek in podobno. Na koncu seveda pod oknom za urejanje kliknite na 'Prekliči'.

Citiranje virov

Citiranje je možno po več shemah, važno je, da se držite ene same. V seminarskih nalogah in diplomskih nalogah FKKT uprabljajte shemo citiranja, ki je pobarvana zeleno. Temeljno načelo je, da je treba vir navesti na tak način, da ga je mogoče nedvoumno poiskati. Za citate v naravoslovju je najpogostejše citiranje po pravilniku ISO 690. Pravila, ki upoštevajo omenjeni standard, so pripravili pri ZTKS. Sicer pa ima vsaka revija lahko svoj način citiranja, ki ga je treba pri pisanju članka upoštevati.
Citiranje knjig:
Priimek, I. Naslov. Kraj: Založba, letnica.
Priimek, I. Naslov: podnaslov. Izdaja. Kraj: Založba, letnica. Zbirka, številka. ISBN.

Boyer, R. Temelji biokemije. Ljubljana: Študentska založba, 2005.
Glick BR in Pasternak JJ. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. 3. izdaja. Washington: ASM Press, 2003. ISBN 1-55581-269-4.
Če so avtorji trije, je beseda in med drugim in tretjim avtorjem. Če so avtorji več kot trije, napišemo samo prvega in dopišemo et al. (in drugi, po latinsko). Vse, kar je latinsko, pišemo poševno (npr. tudi imena rastlin in živali, pojme in vivo, in vitro ipd.).

Citiranje člankov:
Priimek, I. Naslov. Naslov revije, letnica, letnik, številka, strani.
Lartigue, C., Glass, J. I., Alperovich, N., Pieper, R., Parmar, P. P., Hutchison III, C. A., Smith, H. O. in Venter, J. C. Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 2007, 317, str. 632-638.

Alternativni način citiranja (predvsem v družboslovju) je po pravilih APA, kjer članke citirajo takole:
Priimek, I. (letnica, številka). Naslov. Naslov revije, strani.
Lartigue C. et al. (2007, 317) Genome transplantation in bacteria: changing one species to another. Science, 632-638.

Revija Science uporablja skrajšani zapis:
C. Lartigue et al. Science 317, 632 (2007)

V diplomah na FKKT je treba navesti vire tako, da izpišete tudi naslov citiranega dela in strani od-do (ne samo začetne). Navesti morate tudi vse avtorje dela, razen v primeru, ko jih je 10 ali več. Takrat navedite le prvih devet, za ostale pa uporabite okrajšavo in sod. (in sodelavci). Pred zadnjim avtorjem naj bo vedno besedica "in".

Citiranje spletnih virov:
Priimek, I. Naslov dokumenta. Izdaja. Kraj: Založnik, letnica. Datum zadnjega popravljanja. [Datum citiranja.] spletni naslov
strangeguitars. On the brink of artificial life. 6. 10. 2007. [citirano 13. 11. 2007] http://www.metafilter.com/65331/On-the-brink-of-artificial-life
Navedemo čim več podatkov; pogosto vseh iz pravila ne boste našli.