Search results

...-aktivno disulfidno vezjo. Reduktaza prenese elektrone iz NADPH na aktivno mesto tioredoksina in s temsproži redukcijo disulfidnih vezi ali drugih substrat ...sinski sistem (Trx system), ki je sestavljen iz beljakovine tioredoksin in encima tioredoksin reduktaza je prisoten v vseh živih bitjih, evolucijsko je pove

...n histidin, preostalo prosto mesto v oktaedru okoli Fe pa je aktivno mesto encima, kamor se veže peroksid.

...se sintetizira kot cimogen oziroma prekurzor. Spremeni se v aktivno obliko encima z razcepitvijo ene ali več točno določenih peptidnih vezi v njegovi stru ...ga dima, infekciji ali vnosu dražljivih snovi, se fagociti mobilizirajo na mesto vnetja, kjer povzročijo sproščanje nevtrofilnih elastaz. Pri tem se poru

...linesteraza ima zelo visoko katalitično aktivnost, saj vsaka molekula tega encima razgradi 25000 molekul acetilholina v eni sekundi. To predstavlja tako hitr ...e acetilholina, lahko pa tudi kationski substrati in inhibitorji. Estersko mesto je sestavljeno iz katalitične triade treh aminokislin, in sicer serina, hi

...nu je pomembna, ker le ta sodeluje v vsakem od štirih katalitičnih centrov encima glutamin peroksidaze. ...enot, pri čemer vsaka vsebuje en selenocistein v aktivnem mestu. Delovanje encima ni še dobro raziskano, vendar domnevajo, da bi lahko deloval ''in vivo'' t

...ih in še nezrelem plodu pa tudi v stebelnih delih. Največ tega zdravilnega encima vsebuje njegovo mleko in lupina. ...a 2 razločni strukturni domeni z razpoko med njima. Ta razpoka ima aktivno mesto, ki vsebuje katalitsko trojico, ki je sestavljena iz treh aminokislin

...vni aktivator plazminogena je serinska proteaza, ki pretvori plazminogen v aktivno obliko, s čimer igra ključno vlogo pri razgradnji fibrinskega čepa. V m * Domena prstov, ki vključuje vezavno mesto za fibrin (F)

...irektno, ampak da receptor stimulira G protein, ki deluje na encim. Primer encima je adenilat ciklaza, ki katalizira nastanek cAMP. Za to odkritje sta leta 1 ...rukturo in uporabljajo enake mehanizme za ″preklapljanje″ med neaktivno in aktivno obliko.

...dkrili so, da lipaza ne vsebuje domene podobne pokrovu, ki zakrije aktivno mesto in da je strukturno zelo podobna encimom, ki razgrajujejo plastiko. Tako je ...PyMOL sta bili strukturi poravnani, da bi preverili katalitično in vezavno mesto za substrat za razgradnjo PLA.

...e SR cistein).^[6] Hidrogenaze brez FeS imajo nedoločeno aktivno mesto, ki vsebuje Fe(CO)₂ center. ...ega karbida z enoto Fe₆C je železo-molibdenov kofaktor (FeMoco) encima nitrogenaze, ki ga najdemo v biologiji.^[7][8]

...l, kjer RNA po končani sintezi izhaja in torej ne direktno v aktivno mesto encima (od tega je oddaljen 12,1Å) kot to opisujejo nekateri viri, ki navajajo nj ...primanjkljaja fosfata ni tako znatna, da bi bila vezava le-tega v aktivno mesto polimeraze manj sterično ovirana.

...l, kjer RNA po končani sintezi izhaja in torej ne direktno v aktivno mesto encima (od tega je oddaljen 12,1Å) kot to opisujejo nekateri viri, ki navajajo nj ...primanjkljaja fosfata ni tako znatna, da bi bila vezava le-tega v aktivno mesto polimeraze manj sterično ovirana.

...ka na tretjem mestu. Povezani peptidni verigi izstopita iz aktivnega mesta encima. Tako je katalizirana povezava, ki zagotavlja čvrstost celične stene. ...-Ala, ki je naravni substrat DD-peptidaz, posnema njegovo vezavo v aktivno mesto, pri čemer pa ima zaradi že omenjenih strukturnih lastnosti večjo afinit

...jejo podaljševanje polipeptidne verige, drugi pa inhibirajo vezavo tRNA na mesto A v ribosomu. Tudi proti inhibitorjem podenote 50 S bakterije razvijajo od ...vi kompleks 70 S ribosoma in mRNA. Strukturiran je na tak način, da zasede mesto A, ker pa se je vezal še pred začetkom prevajanja mRNA, zaustavi sam zač

...S, pa so odkrili, da popravljanje neujemanja baznih parov poteka s pomočjo encima NucS/EndoMS, spet tretje pa še nimajo odkritega mehanizma za popravljanje ...ehanizmu obračanja baz, pri čemer baze postavi v žepek, ki meji na aktivno mesto, kar omogoča cepitev verige v primeru nepravilnega združevanja baz, ki je

...vanja mehanizma in večjo učinkovitost glede na vir svetlobe. Pri delovanju encima igra v aktivnem mestu katalitsko vlogo kofaktor FAD, in sicer je aktiven v ...teinskega ostanka ne pride do prenosa skupine drugam in s tem regeneracije encima. Iz tege izvira poimenovanje skupine samomorilni encimi. Prej opisani encim

...na palindromska zaporedja, dolga 4-8 baznih parov, ki obenem predstavljajo mesto cepitve. ...Za razliko od restriktaz tipa IIP, katerih DNA-vezavno mesto in katalitsko mesto sta del iste domene, se pri restriktazah tipa IIS omenjeni mesti nahajata k

...de do inverzije anomernega centra. Preko preostalih dveh Asp se katalitsko mesto regenerira. Pri drugem mehanizmu sta ključna aminokislinska ostanka le Asp .... Dober primer sta za pnevmokoke specifična Cpl-1 in Cpl-7. Cpl-7 ima zelo aktivno EAD, vendar ima kljub temu nižjo bakteriolitično zmožnost kot Cpl-1. Raz

=== Racionalno načrtovanje encima === ...ne mehanike skupaj s programi molekularne mehanike (QM/MM), samo strukturo encima pa so zanalizirali s pomočjo programov molekularne dinamike (MD). Vse izra

...al pri ''oriC1'' replikaciji in vivo. Po drugi strani, ko je bilo aktivno mesto zasedeno z ADP, je zmožnost interakcije MRM z MCM opuščena. Ta opažanja ...ah ''Sulfolobus'' pa s 5' koncem interagira PriX in tako služi kot vezavno mesto za začetni nukleotid pri sintezi primerja.

...z metilacijo na mestu 2'-''O'' na riboznem delu nukleotida. Če se metilira mesto 2’-''O'' na riboznem delu prvega nukleotida (tj. naslednji nukleotid od i ...5’-koncu. Tako iz 5’-pppN konca nastane difosfatni 5’-ppN konec. Aktivnost encima so preverili s poskusom na kvasovkah seva YBS20 (''cet1''), ki v svojem gen

...a, torej sta aktivni mesti dve, vsako za cepitev ene od verig DNA. Vezavno mesto za antibiotik se nahaja ob aktivnem mestu, kjer je prisoten vezavni žep. Z ...zna korelacija med grampozitivnostjo bakterije in dovzetnostjo posameznega encima za kinolone.

...imi vrstami se <em>chi</em> sekvence razlikujejo. Ko podenota RecC doseže mesto <em>chi </em>in se veže nanj, pride do konformacijske spremembe celotnega ...ro. Na DNA je še vedno vezan kompleks RecBCD, ki po formaciji 3'-OH konca aktivno pomaga pri nalaganju RecA proteinskih enot na 3'-konec novonastale enojne

...dva encima, ki prispevata k pretvorbi hema v fikocianobilin (PCB). Ta dva encima sta hem oksigenaza (HO1) in fikocianobilin: feredoksin oksidoreduktaza (Pcy ...redhodno pripravljen za biosintezo fitokroma v bakterijah. Plazmid vsebuje mesto začetka replikacije p15a in vsebuje gena ''ho1'' in ''pcyA'', za pretvorbo

...če je bil AdoCbi vezan na aptamer. Modificiral pa so tudi aptamer vezavno mesto za AdoCbi tako, da so zmanjšali afiniteto za njegov prekurzor Cbi. [1] ...intezo antitoksina. Na tak način dosežejo, da je pred indukcijo toksina in encima BluB, koncentracija antitoksina že konstantna.[1]

...proži kovalentna vezava C-končnega LPETGG motiva substrata v aktivno mesto encima. Cisteinski ostanek 184 napade peptidno vez med glicinom in treoninom zapor ...ence z enega na drugi fluorofor, kar je potrdilo, da sta tako pripravljena encima aktivna.

...ne modifikacije 5' ali 3' koncev RNA substratov niso vplivale na delovanje encima; nsp 15 je kljub modificiranim koncem še vedno cepil RNA. ...tivnost EndoU je torej ključna heksamerizacija nsp15. Poleg tega, nsp15 za aktivno konformacijsko obliko potrebuje kofaktorje, ki jih predstavljajo dvovalentn

...izmenjave dednega materiala. Mesto popolnega preloma verige in posledično mesto, kjer bo prišlo do mejozne rekombinacije in izmenjave med homolognima krom ...ni konec. Podobno vlogo ima tudi protein Dcm1. Vloga tega filamenta je, da aktivno išče homologno verigo DNA, nato pride do izpodrinjanja konca iz originaln

...ivost na dehidropeptidaze I. To so odpravili z dodatkom metilne skupine na mesto C-1 in tako dosegli odpornost na delovanje dehidropeptidaze I. ...%20image%20to%20zoom&p=PMC3&id=3195018_zac9991003070002.jpg (Slika)]. Prav mesto C-1 in metilna skupina na njem naj bi prispevali k učinkovitosti in širok

...municirajo z relaksosomom. Tvorijo heksamerne strukture na T-verigi, ki se aktivno prenesejo skozi konjugacijske pore med prenosom. ...NA zaporedje in se vežeta na aktivno mesto encima, protein ArdC pa aktivno mesto blokira. Naseldnji pomemben obrambni mehanizem je CRISPR-Cas, ki zagotavlja

Vse te strukturne spremembe pa je moralo utrpeti tudi aktivno mesto. Kisli aminokislinski ostanki (E, D), ki v aktivnem mestu držijo dva atoma ...gična razlaga. Aktivno mesto RNA-polimeraze je skrito globoko v jedru tega encima, kar omejuje dostop do katalitičnega centra. Inserti v DPBB zankah pa bi G

...prehod od aktivacije do represije kromatina. SUMO verjetno blokira vezavno mesto na lizinu, in s tem preprečuje acetilacijo in ubikvitinacijo histonov. ...nterakcij. Lahko pa specifična metilacija aminoksilin, predstavlja vezavno mesto za različne proteine.

...m RNA polimeraze II. Zrelo obliko hTR gradi 451 nukleotidov, njeno aktivno mesto pa je funkcijsko razdeljeno na dva dela. Zaporedje, ki se nahaja na 3' konc Sm proteini: domnevno vezavno mesto Sm proteinov je na 3’ koncu TLC1 RNA. Smd1p je potreben za akumulacijo TL

...e saquinavir. Ta inhibira HIV-1 in HIV-2 proteaze. Veže se v aktivno mesto encima in inhibira cepitev proteinov.

...nične RNA pri utišanju uspešnejše od tistih, ki posnemajo naravni substrat encima Dicer. ...iRNA. Zato je bolj uporabna sinteza shRNA, ki jo potem Dicer preoblikuje v aktivno obliko siRNA.

...ni regulator izražanja genov. lncRNA molekule večinoma nastanejo s pomočjo encima RNA polimeraza II (RNAPII), alternativno pa z rastlinsko specifičnimi poli ...limeraza 2 (RDR2) prepozna na novo nastale RNA iz TE, nastale z delovanjem encima RNAPIV in jih spremni v dsRNA molekule. Protein DICER - LIKE 3 (DCL3) jih n

...i>trans</i>-biformen in nezukol ter jih poskusili umestiti v aktivno mesto encima. Ugotovili so, da sta vodikova atoma <i>trans</i>-biformena na atomih C<sub

...pokazala kot uspešna pictilisib in buparlisib, ki se vežeta na ATP-vezavno mesto. Na enak način deluje tudi večina AKT inhibitorjev, kamor spada tudi dobr ...kalcijevih ionov Ca2+, ki z vezavo na PKC povzročita prehod iz neaktivne v aktivno obliko. Aktivacija PKC vpliva na spodbujanje oziroma inhibiranje razvoja ra

...ferina (LRE) (Gomi in Kajiyama, 2001). Oksiluciferin lahko blokira aktivno mesto kresnične luciferaze in je tako kompetitivni inhibitor luminiscence. Njego ...topi za dosego tega cilja vključujejo izražanje luciferin regenerirajočega encima za luciferazo kresničk ali luxG flavin reduktazo v lux operonu. Nadaljnje

...kih, najprej se karboksil ubikvitina veže na sulfhidrilno skupino cisteina encima E1. V drugi fazi se postopek ponovi na konjugiran encim E2. V zadnji fazi p === Primož Tič: Primanjkljaj encima piruvat karboksilaze ===

...h mestih. Prvo mesto je pri reakciji izocitrata v alfa-ketoglutarat, drugo mesto pa pri reakciji sukcinata v fumarat. Prekinitve v ciklu vodijo do kopičenj ...emijo je značilna zvišana koncentracija amoniaka v krvi zaradi pomanjkanja encima ornitin transkarbamilaze (OTC). Citrulinemijo delimo na dva tipa, citruline

...Ta peptid je velik približno 80 kD in ima specifično izoblikovano vezavno mesto za Neuregulin-1. Nadaljnji procesi pa potekajo zelo podobno kot pri običaj ...traj celice. To se zgodi takrat ko se ustrezen ligand Gama veže na aktivno mesto tega receptorja. Konformacija podenot se spremeni in to omogoči aktivacijo

...zelo pomembna, saj lahko v celici prehaja med neaktivno dimerno obliko in aktivno tetramerno obliko, kar privede do različnih produktov. Aktivnost PKM2 je r ...ičnega prostega Pi in AMP med vadbo. Pi in AMP sta odgovorna za regulacijo encima glikogen fosforilaze, ki cepi glikogen. Torej, če se njune koncentracije z

...4 podenot (podenote A, B, C in D), ki imajo vsaka svojo funkcijo. Zorenje encima omogočajo sestavljalni faktorji. Najpomembnejši so SDHAF1, SDHAF2, SDHAF3 ==Mia Kobal - Zgradba in delovanje rubisca, najpogostejšega encima==

...lenj. Uporaba analogov 11-cis-retinala, kot sta 9CR in 6mr, ki se vežeta v aktivno ali eno od alosteričnih mest, bi lahko predstavljala učinkovit pristop pr ...sestavljen iz podenot α, β in γ. V α podenoti je prisotno kinazno aktivno mesto ter Thr172, medtem ko so na γ podenoti prisotna vezavna mesta za adenin nu

...e porabo energijskih zalog. Vse bolj očitno pa je, da hipotalamus ni edino mesto signalizacije za leptin. Leptinski receptorji so izraženi tudi v drugih de ...jo primeren celični odziv. Reaktivne kisikove spojine inhibirajo aktivnost encima PHD2, kar omogoča stabilizacijo HIF-α podenot in ustrezno transkripcijsko

...o. Vloga kaspaz pri apoptozi je dobro znana, so adapterski proteini ali pa aktivno sodelujejo pri postopni razgradnji celice, saj sprožijo nastajanje apoptot ...2/FBPaza uravnava glikolizo in glukoneogenezo, bi lahko tarčno reguliranje encima postalo nov način zdravljenja diabetesa.

...speha'' naključna vezava proteina XPC (začetni faktor NER) na nespecifično mesto v DNA ter nato vzdolžna difuzija XPC do poškodovanega (specifičnega) mes ...ikov kot način delovanja bakterij. Članek prispeva nov vpogled v delovanje encima Slt za razgradnjo nezamreženega novo nastalega PG, saj mu pripisuje vlogo

...endar pa se lahko zgodi, da pride do določene mutacije, na primer mutacije encima za razgradnjo metabolita, posledično pa se ta metabolit začne kopičiti v ...kot IRP1 pride do konformacijskih sprememb v proteinu pri katerih nastane mesto za vezavo na IRE (odzivni element za železo), to je reža, ki na novo nast

...tično celico reciklira v astrocitih. Po prejetju signala začnejo astrociti aktivno vnašati glukozo in jo pretvarjati v laktat. Ta se nato po MCT-transporterj ...oča njen transport skozi krvni obtok. Ob dveh prevladujočih izoformah tega encima smo se omejili na glutaminazo ledvic (KGA), ki je v zadnjem desetletju zara

...ivno dieto. Metode, ki bi omogočile vzpostavitev ali nadomestitev funkcije encima fenilalanin hidroksilaze so še v testni fazi. ...A z dvoverižnimi prelomi preko aktivacije ATM posredno vpliva na aktivnost encima glukoza-6-fosfat dehidrogenaze (G6PD) in produkcijo NADPH. Aktivacija ATM s

...nekatere ključne pojme in koncepte v biokemiji kot so ortosterično vezavno mesto, alosterični receptorski modulatorji, vzorčno prepoznavanje, homologna in ...uri poznamo 7 tipov mGC: MG-A, MG-B, MG-C, MG-D, MG-E, MG-F in MG-G. Vlogo encima in receptorja opravljajo topne gvanilil ciklaze v citosolu in membranske na

...močjo encima 5-α-reduktaze v lasno mešičnih celicah pretvarja v svojo bolj aktivno obliko dihidrotestosteron (DHT). Ta se se nato s posebno vezjo veže na and ...ATPazo. Posledično se v astrocitah zviša nivo AMP, kar stimulira delovanje encima glikogen fosforilaze (razgradnja glikogena). Astrocite med nevronsko aktivn

...o. Tako nanodelci ostanejo več časa v krvi in prenesejo zdravila na ciljno mesto (npr. v tumorje). Nanodelci so namreč sposobni prenašati sorazmerno velik ...posredno vpliva na nastanek vnetne reakcije torej prodiranja makrofagov na mesto propadajočih celic. TI makrofagi pa vplivajo na nastanek zelo reaktivnih k

...encimom NAHPH oksidazo-2 in dektinom-1, zato imajo ljudje, ki nimajo tega encima avtoimune bolezni. ...eS7 preko podenote Not4. V primeru počasne peptidil transferaze pa se na E-mesto veže eIF5A, ki pospeši translacijo. Napake pri razgradnji mRNA in prevaja