Search results

* Domena B in D sta zanki zunaj celice. Sestavljeni sta večinsko iz tirozina in gli * Domena C se nahaja med domeno B in D.

1.N-končna aktin-vezavna domena<br /> 2. Velika trojna spiralna spektrinu podobna domena sestavljena iz 24 ponavaljajočih se enot<br />

...v, je sestavljena povečini iz alfa vijačnic ter močno stisnjene osrednje [[domena|domene]] proteina, kjer je vezavno mesto za kalcijeve ione. Ima tudi centra Druga [[domena]] je za razliko od prve zelo odvisna od tipa aneksina ter najverjetneje nat

...ein, sestavljen iz 393 [[aminokislina|aminokislin]] (ak), ki tvorijo pet [[domena|domen]]. * '''IV.''' Oligomerizacijska domena, 307-355, vsebuje regijo, potrebno za dimerizacijo.

* Domena prstov, ki vključuje vezavno mesto za fibrin (F) * Domena epidermalnega rastnega faktorja z vezavnim mestom za membranski receptor je

Osrednja domena vedno vsebuje oligosaharidno komponento in se pritrdi neposredno na lipid A ...h fosforiliziran glukozaminki disaharid z različnimi maščobnimi kislinami. Domena Lipida A je odgovorna za toksičnost gram-negativne bakterije. Ko bakterijs

...a v membrani gostiteljske celice. Njegov zadnji del, imenovan C-terminalna domena (obsega okoli 100 aminokislinskih ostankov), pa je del proteina, ki je usme

- HECT domena, služi kot intermediat za prenos ubikvitina

...katalitično aktiven tirozin-fosfatazni del in neaktiven del. Izvencelična domena rada tvori dimere in s tem regulira aktivnost fosfataze.

..., ki je v bližini skrajnega C-konca, je od tropomiozina neodvisna pokrovna domena in veže aktin.

...nsko regijo kot manj razviti vretenčarji (npr.dvoživke). Daljša kot je PXX domena, manjše nanosfere se bodo spajale (oblikovale se bodo bolj kompaktno). Man

...istidine-rich glycoprotein). Za antiangiogeni učinek je odgovorna osrednja domena le-tega, ki je bogata s histidinom in prolinom. Že prejšnje raziskave so

EF-dlan oziroma EF-hand je strukturna domena proteina, ki vsebuje motiv vijačnica-zanka-vijačnica, sestavljen ponavadi

...a encimski katalitični center. Poleg RNaznih domen je na C- koncu še dsRBD domena. ...1263-Thr1271), sledijo mu tri antiparalene β ploskve (Leu1283- Gly1314) in domena se konča z še enim α heliksom (Ile 1317-Lys-1331). Vse skupaj tvori αβ

...boksilnega konca najdemo tudi kinazne domene. Četrtra vrsta domene je PEVK domena, ki še dodatno prispeva k elastičnosti. Preko aminskega konca se dve titi

...zasidranje« transkripcijskih faktorjev na pravilno mesto DNK; aktivacijska domena nato neodvisno stimulira transkripcijo s povezovanjem ostalih proteinov.

Domena GG vsebuje pet motivov, ki se vežejo neposredno GDP / GTP

...ima pa tudi posebne motive, kot sta hem-vezavna domena in dioksid vezavna domena.

...e je podoben obliki črke Y, sestavljene iz 3 domen. Podenoto A sestavlja C domena, podenoto B pa sestavlja ta T in R domeni. [http://upload.wikimedia.org/wik

...–101) in domena II (ostanki 102–184) imata antiparalelno strukturo β-cevi. Domena III (ostanki 201–303) vsebuje pet α-vijakov, razporejenih v večinoma an

*''Variabilna in konstantna domena:''

...ega proteina [Wiberg et al .2001]. Interakcija je z N-terminalne kroglasta domena kolagena VI kakor tudi interakcije z drugimi proteini. Kolagen VI se tudi v

• sredična domena s katalitično vlogo

...vrsto celic: prašičje monocite/ makrofage, kjer se veže na receptor CD163, domena SRCR5 (''ang.'' scavenger receptor cysteine-rich domain 5) pa predstavlja m ...nezrelih eritroblastov ter deluje kot hemoglobin-haptoglobinski receptor (domena SRCR3). Prosti hemaglobin je toksičen za celice, zato je pomembno, da ga m

• Patogena domena (P): zaradi le par spremenjenih aminokislinskih ostankov v tej domeni lahko • Variabilna domena (V): ta domena se najbolj razlikuje tudi pri viroidih, ki so si sorodni

...raj omenjene domene povezujejo presledkovni segmenti, ki so, tako kot tudi domena N3, strukturno neurejeni polipeptidi. ...silPS) ne glede na prisotnost PS divjega tipa. Ugotovitev, da je CTD tista domena, ki prepozna PS, ni v skladu s strukturnimi podatki obeh domen, saj NTD vse

...ostavljeno je tudi, da se kompleksi vežejo na DNA preko HMGbox (proteinska domena, vključena pri vezavi DNA). ...a. K slednjim uvrščamo različne družine encimov, vsem pa je skupna ATPazna domena. Preurejevalni strojčki sodelujejo pri podvojevanju DNA, transkripciji, po

.... osrednja domena iz dveh PRD (PTS regulacijska domena) in 3. C-terminalna domena. Njegovo delovanje je regulirano preko fosforilacije oz. defosforilacije PR

...erenciacija, regulacija celičnega cikla, produciranje spomina. RNA vezavna domena vsebuje 8 α-heličnih ponovitev, vsak izmed njih prepozna en nukleotid RNA ...razpolovni čas. Obratno kot DD deluje z ligandom inducirana degradacijska domena, ki kot že ime pove v prisotnosti male molekule pospeši razgradnjo fuzijs

...erenciacija, regulacija celičnega cikla, produciranje spomina. RNA vezavna domena vsebuje 8 α-heličnih ponovitev, vsak izmed njih prepozna en nukleotid RNA ...razpolovni čas. Obratno kot DD deluje z ligandom inducirana degradacijska domena, ki kot že ime pove v prisotnosti male molekule pospeši razgradnjo fuzijs

...težno (67 %) zvita v obliki α-vijačnice, pribl. 10 % je ß-strukture. Vsaka domena ima vsaj 2 dolga in en krajši zavoj. Molekulska masa znaša 66 kDa. Spada

...preko dodatne DNA vezavne domene. Rezultati so pokazali, da je DNA vezavna domena primernejša. Najnižji koncentraciji pri katerih je prišlo do popolne vez === DNA vezavna domena ===

...a - RT domena s funkcijo reverzne transkriptaze, na koncu pa se nahaja CTE domena. ...kDa. Ima štiri strukturne in funkcionalne domene: N-konec, TRBD domena, RT domena (funkcija reverzne transkriptaze) in C-konec. Regije TERT so pomembne za ak

...omskih zaporedij 3' terminalne regije nsp15 so ugotovili, da ima CoV EndoU domena zelo podobno zaporedje kot poli(U)- specifična endoribonukleaza iz organiz Do takrat je bila EndoU domena značilna le za viruse iz rodu ''Nidovirales'', v kasnejših raziskavah pa

...jem ter služi tudi kot prepoznavni element za PSTK in SepSecS. Akceptorska domena se nahaja v konfiguraciji 9/4, torej 9 bp v akceptorskem steblu in 4 bp v T ...c pri arhejah). Ker je za razliko od bakterijskega elongacijskega faktorja domena elongacijskega faktorja EFSec oz. aSelB prekratka, da bi se lahko neposredn

...otein-DNA in protein-protein [2]. TFE𝛽 vsebuje ohranjeni domeni WH in FeS. Domena WH TFE𝛼 tvori kontakt z navzgornjo nematrično verigo DNA in pomaga tvor ...a leži v interakcijah s terminacijskimi faktorji, na kar nakazuje NusG-KOW domena pri bakterijah.

...jo s katero se specifično veže na shRNA; primer take regije je RNA-vezavna domena (RBD) iz proteina Fox-1 [8]. * Ali se domena RBD iz proteina Fox-1 veže specifično na shRNA?

..., ki se pojavijo pri obeh tipih. V modularnih je N-končna encimsko aktivna domena (EAD) s kratko, fleksibilno verigo povezana s C-končno, ki je specifična ...a amidohidrolazna/peptidazna domena (PlyCCHAP) in N-acetilglukozaminidazna domena (PlyCGyH). Jedro PlyCGyH sestavlja struktura iz šestih α-heliksov, podobn

...veže z naslednjo stabilno domeno, t.j. DNA vezavna domena. Tretja stabilna domena verige je transaktivacijska, ki je pozicionirana na koncu vsake roke. P53 s

...domena NorR vsebuje vezavno mesto za NO. Če je NO vezan na NorR, N-končna domena ne preprečuje več vezave RNA polimeraze in prepisovanje genov je možno.

...domena NorR vsebuje vezavno mesto za NO. Če je NO vezan na NorR, N-končna domena ne preprečuje več vezave RNA polimeraze in prepisovanje genov je možno [

→ tRNA domena → mRNA domena

...da vsako podenoto sestavljata katalitična domena PD...D/ExK in DNA-vezavna domena, ki se nadalje deli na efektorsko in prepoznavno poddomeno ter spominja na ...er se ena domena odcepi od DNA, z drugo pa je encim še vedno vezan. Prosta domena se nato lahko ponovno veže na DNA, tudi na bolj oddaljeno mesto, pri čeme

...sko domeno. Če proteina med sabo interagirata, sta aktivacijska in vezavna domena dovolj blizu, da aktivirata transkripcijo genov: najpogosteje LacZ, kjer tr

...ko se ligand veže na receptor se fosforilira (serin ali treonin) citosolna domena. Fosforilirana oblika citoslne domene pa omogoči aktivacijo SMAD regulator

...tankov dolg protein, katerega glavna domena je bila identificirana kot PAZ domena. Prisotnost PAZ domene so odkrili tudi v proteinu AGO2 ter pokazali, da gr

...e in izvira iz ''Clostridium thermocellum''. Zamislili so si, da bi se CBD-domena vezala na celulozo, ki bi bila na filtru. Zato bi se organizmi, ki izražaj

...4 domen, med katerimi je za vezavo antraks toksina na receptorje pomembna domena PA4, zato predvidevajo, da je PA4 ključni antigen pri ojačitvi imunskega

...ekula se veže na domeno na zunanji strani celične membrane. Znotrajcelična domena receptorja aktivira G protein, ki veže fosfatno skupino in iz GDP sintetiz

...sta N- in C- končni domeni, ki se ne prilegata DNA. Nespecifična nukleazna domena TALEN-ov, ki se nahaja na C-koncu proteinov, izvira iz endonukleaze ''Fok'' ...domeni določata zaporedje na DNA, ki ga TALEN prepozna in cepi. Nukleazna domena omogoča cepitev ene verige DNA, zato je potrebno pri uvajanju zlomov dvojn

Katalitična domena objema večinoma motiv IV, ki ima tudi ohranjeno skupno zaporedje. Večinom TRD domena prepozna, stabilizira in veže DNA, vendar njeno aminokislinsko zaporedje n

.../Hsp40 Hsp40] - vsebujejo zaporedja 70 aminokislinskih ostankov, znano kot domena J in igrajo pomembno vlogo pri uravnavanju ATP-azne aktivnosti Hsp70.

...je sestavljena iz 4-verižne β-plošče in iz 4 kratkih vijačnic. Globularna domena je vezana tako na sodčkasto domeno kot tudi na hidrofilne zanke usmerjene

...zavna domena (NTD; angl. N-terminal domain) in C-terminalna dimerizacijska domena (CTD; angl. C-terminal domain), ki sta povezani s Ser/Arg bogatim členom (

Celuloza vezavna domena je pogosto v uporabi na področju biotehnologije. Domeno združijo s tarčn

...epresor. Sestavljen je iz dveh domen (dimerizacijska domena in DNA-vezavna domena), vmes pa je prisotna povezovalna regija, ki bi se jo dalo spremeniti tako,

...vija v 4 različne domene. Domene I, II in III so primarne alfa vijačnice, domena IV pa oblikuje jelly-roll β-sodček, ki je pogosto prisoten v proteinih vi ...μ1N skrit znotraj hidrofobne votline, ki jo tvorijo domene I, II in III. Domena IV vsebuje anion-vezavno mesto, ki se poveže s fosfolipidnimi glavami v e

...rajo s povezovalno DNA in s tem povezujejo sosednje nukleosome, globularna domena histona pa ga veže na nukleosom. ...egijo imenovano kislinski obliž (acidic patch) na sosednjem nukleosomu, je domena histona H4. Ta se veže z 16-24 ostanki v kislinski obliž. Kislinski obli�

...nukleazna domena na C-koncu jo cepi, nato pa od Mg2+ odvisna HD-nukleazna domena do konca uniči ssDNA. Izpodrinjena veriga je tako uničena, ostane le še

...uporabljena v tem poskusu sta povezana preko 2A peptidne sekvence. Cepi ga domena, ki izhaja iz FokI endonukleaze. Ko je dvojna vijačnica popravljena pride

...dimerni obliki, je aktiven in nespecifično cepi molekulo DNA. DNA vezavna domena pa je sestavljena iz cinkovih prstov, to so približno 30 aminokislinskih o

...u je zakodirana tudi DNA-vezavna domena in včasih tudi endonukleazna (En) domena. ...o vijačnico DNA, intronski lariat se reverzno vstavi na zgornjo verigo, En domena proteina IEP pa cepi spodnjo verigo in predstavlja primer, ki se reverzno p

...ujemajoče bazne pare. Do dejanske tvorbe RNA sestavov pride, tako da se DD domena poveže z DD domeno druge RNA molekule (lahko je enaka, ni pa nujno) in s t ...ene poli-T odsek, kar prepreči aktivacijo PD domene, za katero je nujna DD domena. Monomer (d1 oz. d2') ni sposoben tvoriti osnovnega motiva in posledično R

...N- in C- terminalni domeni, ki se ne prilegata DNA. Nespecifična nukleazna domena TALEN-ov, ki se nahaja na C-koncu proteinov, izvira iz endonukleaze FokI te

Centralna domena proteina XPA (eksoni 3-5) se veže na poškodovani del DNA in RPA protein ( C-končna domena (ekson 6) se veže na TFIIH, mutacija na tem eksonu vodi do blažje oblike

...nikol in mesto začetka replikacije ColE1. Najprej je bila histidin kinazna domena ''envZ'' ligirana v ogrodje pPROTet in s tem so tvorili plazmid pPRO-HK. Fr ...isne aktivnosti in obstaja konstitutivna aktivnost, kadar je izražena samo domena histidin kinaze EnvZ, ali kadar ni inducirana presnovna pot PCB [1].

''Aktivna in DNA-vezavna domena SsCBF1''

...a veže na DNA, vendar Ku poveča hitrost vezave približno stokrat. C-končna domena DNA-PK glede na N-končno tvori klešče, skozi katere gre molekula DNA. In ...a fosforilacijo. Obadajata jo za PIKK značilni domeni: v N-terminalno smer domena FAT (»''FRAP-ATM-TRAPP''«), v C-terminalno smer pa FATC (»''FAT-C-termin

...NA. Domena HNH cepi tarčno verigo (to je veriga, ki vsebuje protovmesnik), domena RuvC pa cepi ne-tarčno verigo [1].

...IF. Izkazalo se je, da edina izkazuje dovolj močno vezavo na PhyB N-končna domena PIF6, pri čemer pa mora PhyB nujno vsebovati C-končno domeno PAS, saj le- ...se veže na Cdc42, bodisi iz proteina Pak, ki se veže na Rac1. GBD vezavna domena se je vezala na aktivirano GTPazo (z vezanim GTP), na ta način pa sta oba

...m sistemom gostitelja (zunajcelična domena), poleg tega pa transmembranska domena proteina kaže aktivnost ionskega kanala.

...vlogo pri replikaciji DNA.V nasprotju s tem je RNAza III, ki je nukleazna domena Dicer-ja, in je večinoma bakterijskega izvora. V bakterijah je RNAza III v

...domene. Slednja prepoznava napačno zvite oblike proteinov v ER. Citosolna domena je tista, ki prenese dani signal jedru, kjer se nato aktivira specifičen s ...anj delujejo razne proteaze, zato da se v nadaljnje lahko izrazi citosolna domena ATF6 in je dalje transportirana v jedro celice. V jedru spodbuja izražanje

...razlika je v S (spike) genu, ki je razdeljen v 2 delih, S1 in S2. C-končni domena S1 je odgovoren za vezavo z ACE2 in vhod v celici. Drug gen, ki se bivstven

...od organizma do organizma, vseeno pa lahko opišemo neko splošno strukturo. Domena centromere je zgrajena na specifičnem nukleosomu, ki ga najdemo le na tem

Ena N-končna domena LexA dimera se poveže z levo stranjo operatorja, druga pa z desno. Lastnos

Efektorska domena Rap_pLS20 deluje na tak način, da se veže neposredno na tetrame ...b>pLS20</sub> veže v votlino C-končne domene, kar povzroči, da se N-končna domena premakne navzven. Ta položaj bolj ustreza tvorbi tetramer, pri čemer se d

'''Del zaporedja proteina bodice (centralna domena vijačnice):'''

...tna enota acil transacilaze (ang.: starter unit acyl transacylase, SAT) in domena predloge produkta (ang.: product template domain, PT) v ne-reducirajočih p

...a RexB lahko razloži to odvisnost od zunajceličnega pH. Prva periplazemska domena vsebuje dva histidinska ostanka (ostanka 27 in 38), katerih ionizacija naj

...pigenetski spomin, vključevanje več regulatorjev kromatina (CR). Na primer domena KRAB (ang. Krüppel associated box), ki se pogosto uporablja v genetskih ve

...o med obema domenama, ampak ju fizično povezuje manjša »ruler domena«. PAZ domena in katalitična stran Rnazne III domene sta tako ločeni. Razdalja med obem

...močno omrežje vodikovih vezi, ki so odgovorne za moč vlaken. N in C-končna domena pa omogočata proteinske interakcije preko disulfidnih vezi ter solnih most

...lgvanin DNA alkiltransferaza I, ki je monomer, katerega C- in N-terminalna domena imata svoje aktivno mesto s cisteinom. Na N-terminalni domeni se alkil pren

...elni orientaciji. Naredili so še drug set iz DHD154a in DHD154b kjer vsaka domena sestoji iz dveh alfa vijačnic, torej ob dimerizaciji tvorita tetramer.

...eina AcsA in AcsB tvorita dimer, prvi je katalitična, drugi pa regulatorna domena. AcsC in AcsD pa sodelujeta pri transportu glukanskih verig iz celice na zu

...l prokariontsko DNA-vezavno mesto za LexA, ki je prokariontska DNA-vezavna domena. Izražanje GFP je bilo na ta način strogo regulirano s prisotnostjo proge

...teto za proteinazo 3 (PR3), zaradi česar je ta protein primerna afinitetna domena za sintezni receptor. Vezava protiteles na receptor bi morala povzročiti d

...iko afiniteto ter selektivnost na uranilne katione. Glede na to, da je SUP domena del fuzijskega proteina 3A-SUP, je bilo potrebno testirati vpliv dodatnih m

...gi ni enaka, saj je na začetku procesa RecD hitrejša in vodilna helikaza. Domena podenote RecB, ki je v kompleks povezana z 30 aminokislin dolgim fleksibil

...nzorju za takrolimus sta predstavljala spojena kalcineurin A in B ter FKBP domena. Pri biosenzorju za α-amilazo so na cpNanoLuc pripeli dve VHH domeni (nano

...avlja prvih 287 aminokislin, ki tvorijo katalitični motiv DEEDh. N7-MTazna domena je sestavljena iz β struktur in motivom cinkovega prsta, ki pa ni potreben

...e Gag poliproteinov ob plazmalemi povzroči, da se membrana rahlo ukrivi. L domena, kodirana na Gag ima odločilno vlogo da spodbudi ESCRT sistem za proizvaja

...men: lektinske domene z vezavnim mestom za manozo in pilin domene. Vezavna domena za manozo je mesto patogenosti, saj se preko nje bakterija veže na D-manoz

...h večjih razredov pa poznamo tudi številne družine IS, za katere nukleazna domena transpozaze še ni bila identificirana.

...meraza (reverzna transkiptaza): P, ki jo sestavlja več domen; N-terminalna domena, ki je ''primer'' na minus verigi DNA, domeno reverzne transkriptaze in rib

'''d) Ko-inhibitorna signalna domena pridobljena iz BTLA omogoča »NE« logično vezje'''

...omene proteina gp12 v STFs na sekundarni receptor, ki je osrednja heptozna domena v LPS. Konformacijska sprememba v bazalni plošči povzroči kontrakcijo re

...eina vstavimo fotosenzorično domeno. To pogosto privede do napak, saj nova domena moti ali spremeni vezavo na tarčo. Tudi za selekcijo proteinov z izbirno v

...portina α pride do konformacijske spremembe, pri čemer se izpostavi tarčna domena TD1. Ta se nahaja na linkerju in igra pomembno vlogo pri integraciji Ty1 v