Search results

...ystems like circadian clock and similar. Their model accounts for mRNA and protein synthesis and degradation and the binding kinetics of operator proteins. Us ...ional component of some living cells with a periodical output in a form of protein concentrations, not unlike a musical metronome or a clock. Many organisms u

...i je, da jih razvrstimo na podlagi primerjave njihove lokacije in lokacije protein kodirajočih genov. Tako dobimo 4 tipe dolgih nekodirajočih RNA: *smerna RNA (njeno zaporedje delno prekriva protein kodirajoči gen in se lahko nahaja na področju eksonov ali popolnoma znotr

HIV integraza je protein, velik 32 kDa, ki katalizira vgradnjo DNK virusa HIV-1 v gostiteljevo DNK,

...jo interakcije z drugimi molekulami (npr. z DNA ali proteini) ali pa vezan protein zaščitijo pred defosforilacijo in proteolitsko razgradnjo [1,2,3]. ...4-3-3, ki izvira iz rastline Nicotiana plumbaginifolia (tobak). Ta dimerni protein interagira z 52 aminokislinskih ostankov dolgim proteinom CT52, ki v resnic

...jo interakcije z drugimi molekulami (npr. z DNA ali proteini) ali pa vezan protein zaščitijo pred defosforilacijo in proteolitsko razgradnjo [1,2,3]. ...4-3-3, ki izvira iz rastline Nicotiana plumbaginifolia (tobak). Ta dimerni protein interagira z 52 aminokislinskih ostankov dolgim proteinom CT52, ki v resnic

...citotoksičnosti ne moremo pripraviti<ref>Salehi, A. S. M. et al. Cell-free protein synthesis of a cytotoxic cancer therapeutic: Onconase production and a jus ...ein(e) želimo izraziti iz linearne DNA, moramo v reakcijsko zmes dodati še protein gamS. Slednji preprečuje razgradnjo DNA z endonukleazo RecBCD, ki se endog

...n z dvema ekstracelularnima DUF26 domenama in intracelularno serin/treonin protein kinazno domeno. Na osnovi aminokislinske ohranjenosti DUF26 domene med ''Gn

...birajo translacijo in so zato primerni za regulacijo tega procesa. L7Ae je protein, ki ga najdemo v arhejah in se veže na K-obrat RNA. Ugotovili so, da priso Pri bakteriofagih MS2 so ugotovili, da se plaščni protein, ko se ga izrazi dovolj, veže v dimer in z vezavo na mRNA inhibira transla

...birajo translacijo in so zato primerni za regulacijo tega procesa. L7Ae je protein, ki ga najdemo v arhejah in se veže na K-obrat RNA. Ugotovili so, da priso Pri bakteriofagih MS2 so ugotovili, da se plaščni protein, ko se ga izrazi dovolj, veže v dimer in z vezavo na mRNA inhibira transla

...različne vrste kresničk, ki imajo majhne variacije v genskem zapisu za ta protein, oddajajo svetlobo različnih valovnih dolžin (552-582nm, med rumeno in ze

...n z dvemi ekstracelularnimi DUF26 domenami in intracelularno serin/treonin protein kinazno domeno. Na osnovi aminokislinske ohranjenosti DUF26 domene med ''Gn

...omogoči transkripcijo gena GLuc, ki kodira za reporterski bioluminiscenčni protein luciferazo iz ceponožca ''Gaussia princeps''. Ta encim katalizira oksidaci ...li z zapisom za zeleni fluorescirajoči protein (''ang.'' green fluorescent protein, GFP). RPU so neposredno povezane z izražanjem GFP v posamezni celici, kar

...norganski fostat ali vodo. Glikozidni prenos se lahko izvede tudi na del [[Protein|proteina]], ponavadi na [[Tirozin|tirozin]], [[Serin|serin]] ali [[Treonin|

Polipeptidna veriga proteinskega origamija (ang. ''CCPO – coiled-coil protein-origami'') je zgrajena iz medsebojno povezanih dimerov ovitih vijačnic. Vz ...), katerih osrednja funkcija je posredovanje interakcij protein-protein in protein-nukleinska kislina. Podobno funkcijo lahko poleg strukturne pričakujemo tu

...koformacije na njo povežejo proteinski kompleksi PcG (ang. polycomb group protein). Kompleksi PcG so ključni pri epigenetskem utišanju genov. Povzročijo r ...aj to spremembo katalizira encim EZH2, del PRC2. Encim OGT O-GlcNAcetilira protein EZH2, komponento PRC2, ki je eden ključnih proteinov, ki sodelujejo pri in

...o pa s P_fr (''phytochrome far-red''). Na P_fr se veže protein PIF, ki ob prehodu P_fr v P_r oddisociira in odide v je ...vljen ''Spatiotemporal control of cell signalling using a light-switchable protein interaction'', so leta 2009 objavili v reviji ''Nature''.

.... V tem sistemu so proteini, ki vežejo plastiko (''angl.'' plastic-binding protein, PBP), vezani na površino enkapsulinskega nanokompartmenta sestavljenega i ...-konec dodano še zaporedje sfGFP (''angl. '' superfolder green fluorescent protein). Vsi trije konstrukti vsebujejo C-končno heksahistidinsko oznako (6xHis-t

...roteini in spodbudi podvojevanje plazmida. Ob višji koncentraciji v celici protein repA tvori dimere. Kot tak se ne more vezati na vezavno mesto na mestu ori Mutacije v zapisu za protein repA lahko zmanjšajo medsebojno afiniteto monomerov, da bi tvorili dimere,

Kolagen je najbolj zastopan in glavni strukturni protein v telesu, saj predstavlja več kot 90 % suhe mase zunajceličnega matriksa

Selenoprotein P je protein, ki so ga ekstrahirali iz podganje in človeške plazme in je povezan oziro

...e trimerni protein σ1. σ1 je nekakšen izrastek, ki služi kot pritrditveni protein, s katerim se virus pritrja na gostiteljsko celico in se odcepi med vstopom Protein μ1 se zvija v 4 različne domene. Domene I, II in III so primarne alfa vi

...reducirajoči monosaharid ali pa je vezana znotraj oligosaharidne verige na protein.

...kov, povezanih s peptidno vezjo, imenujemo polipeptid oziroma beljakovina (protein), če gre za daljšo verigo.

...SSB proteini, so pri evkariontih prisotni RPA kompleksi (angl. replication protein A). Vezava SSB ali RPA na ssDNA (angl. single-stranded DNA) ni sekvenčno s ...A vsebuje 5 OB zvitij. Kljub temu, da ta vrsta vsebuje tudi zapis za RPA32 protein, tega še niso našli (hipotetično bi lahko ta s RPA41 tvoril dimer). So p

LexA, 27 kDa velik protein, je homodimer vezan na regulatorno mesto, v bližini začetka transkripcije Drugi pomemben protein in induktor SOS odziva - RecA. Ta ima več funkcij in je pomemben tudi pri

...n rumeni fluorescenčni protein '''d2EYFP''' in labilen rdeči fluorescenčni protein '''dsRed'''. ...'''MS2''', ki se veže na RNA-motiv '''MS2_box''', in ribosomalni protein '''L7Ae''' iz arhej, ki prepoznava RNA-motiv '''C/D_box'''. Zapis

...“Cyclin-dependant kinase”). To so evolucijsko zelo dobro ohranjena družina protein kinaz, ki vežejo molekule imenovane ciklini in s tem aktivirajo lastno kin ...neaktiven. Neaktiven kompleks Cdk2,4/ciklin D pomeni, da je retinoblastoma protein (pRb) aktiven in opravlja funkcijo inhibicije E2F. E2F je namreč transkrip

Koronavirusna endonukleaza (EndoU) je nestrukturni protein 15 (nsp15), kodiran v odprtem bralnem okvirju ORF1b virusnega genoma. Prvot ...aminokislinskih ostankov, ki se nahajajo na regiji 6453–6798 AK-ostanka. Protein nastane s proteolitično cepitvijo poliproteina s 3C-like proteazo (3CLpro)

...turi ter izolirane proteine uporabijo za cepljenje. Problem nastane, če se protein ne izraža v dovolj veliki meri, saj količine izoliranega proteina niso up V bakulovirusni ekspresijski vektor so vnesli gen za protein matriksa [virus H5N1 (A/Indonesia/5/2005)] in gena za nevraminidazo in hemg

...ta in tako dobili krajši C-terminalni peptid SpyTag in daljši N-terminalni protein SpyCatcher. Zaradi okrajšav bomo SpyTag imenovali A in SpyCatcher B. ...abijo monomere z tremi SpyTag zaporedji s funkcionalno domeno super uranyl protein (SUP) in monomere, ki vsebujejo tri SpyCatcher fragmente. Uspešno so pripr

...opičenje kompleksa '''alfa-sinuklein-ubikvitin'''. Alfa-sinuklein je topen protein brez stabilne terciarne strukture. Nahaja se v živčnih končičih, kjer s To je sovpadalo tudi z odkritjem, da v maščobah topni protein E ne prehaja skozi krvno-možgansko pregrado. Podobno velja tudi za vitamin

...t matrica pri podvajanju telomerne DNA, druga komponenta pa je katalitični protein s funkcijo reverzne transkriptaze (hTERT). hTR je vedno prisotna v vseh tki ...osti precej primerljiva z retrovirusnimi reverznimi trankriptazami. Gre za protein s približno 1100 aminokislinami, ki vsebuje več ključnih domen. Na N-ter

..., da regulirajo proces cvetenja. Flowering locus C (FLC) je gen, ki kodira protein s funkcijo represije cvetenja in le-ta je bil nadizražen v dvojnih mutanta ...3/Supressor of auxin resistance 3 (MOS3/SAR3), ki kodira jedrni membranski protein. V tem eksperimentu so znanstveniki želeli preučiti nivo izražanja MOS3/

...mom programirane celične smrti pri višjih organizmih. Ugotovili smo, da je protein precej drugačen in ga poimenovali 'ortokaspaza'. Gre za prvi bakteijski en

...e celice v drugo. Drugi RNA-vezavni protein, ki so ga uporabili je plaščni protein bakteriofaga MS2 (MCP). Slednji interagira z motivom lasnične zanke v fagn ...icer število celic, nivo RNA v celici, afiniteta vezave RNA na RNA-vezavni protein, ipd. S preoblikovanjem enačbe dobimo napoved minimalnega števila celic z

Protein S je najpomembnejša tarča zdravil in cepiv proti koronavirusom. Na njem n ...usa s celično membrano je potrebna prisotnost različnih proteaz, ki cepijo protein S in tako omogočijo vstop virusa v celico. Študije so pokazale, da se ob

...(aktivatorja) ter kontrolirajo/generirajo en izstopni signal (reporterski protein). Tako se lahko vrata sestavijo v več plasti, saj je izhodni signal zgornj ...cijskih vezij so vhodni signali aktivatorji, izhodni signal pa reporterski protein [3].

...(aktivatorja) ter kontrolirajo/generirajo en izstopni signal (reporterski protein). Tako se lahko vrata sestavijo v več plasti, saj je izhodni signal zgornj ...cijskih vezij so vhodni signali aktivatorji, izhodni signal pa reporterski protein [3].

....</ref><ref>Yang, J. Comprehensive description of protein structures using protein folding shape code. Proteins. 2008, 71:1497–1518.</ref>. AHP so nato sint ...so nato inducirali z IPTG in izvedli SDS-PAGE ter prenos western. Fuzijski protein A11Sg-AHPM so očistili z afinitetno kromatografijo. Zmes A11Sg in AHP pept

...ekoči ekstrakt, danes pa zaradi lažjega shranjevanja in rokovanja kot suhi protein. Pridobivajo ga večinoma z ekstrakcijo iz jabolk in plodov citrusov.

...edje. Da pa pride do cepitve DNA, se mora v neporedno bližino vezati še en protein z motivi cinkovih prstov in nukleazo FokI, saj je kot že prej omenjeno ta ...n N-acetil-transferaza. eGFP je kratica za izboljšan zeleni florescirajoči protein, s pomočjo katerega lahko spremljamo izražanje genov pod ''OCT4'' promoto

...loops occur on the level of transcription regulation as well as in protein-protein interactions. Tetracycline inducible systems are used for controlling protein expression in prokaryotic and eukaryotic gene networks. The systems used in

...s://elifesciences.org/articles/91777 Repurposing the mammalian RNA-binding protein Musashi-1 as an allosteric translation repressor in bacteria] == Protein Musashi-1 lahko regulira iniciacijo translacije v ''E. coli'' ==

...ti molekularne značilnosti strukturnih genov ( (protein bodice (S), jedrni protein (N), membrana (M) in ovojnica (E))) delta različice COVID-19, da bi identi ...razmerja obetov za gene E(ovojnica), M(membrana), NP(jedrni protein) in S (protein bodice).<br />

...slika pod odstavkom). PAR-1 naj bi kodirala domnevno Ser/Thr kinazo. PAR-1 protein je prisoten v kasnejši periferiji zigote in je razdeljen v polarno obliko Gen unc22 - kodira neesencialni miofilamentni protein, ki je v celicah pisoten v velikih količinah. Zmanjšanje izražanja rezul

...M končno koncentracijo IPTG in celice 8-10 ur gojili na 37 °C pri 220 rpm. Protein so očistili z nikljevo afinitetno kromatografijo, ker pa se Mfp5-2 nahaja ...ojačevalec in promotor, zapis za mPiezo1.1 in mRuby2 (rdeči fluorescenčni protein z izboljšanimi fotofizikalnimi lastnostmi) ter bGH poliA signal [2].

...elekcijska markerja, ki omogočata pozitivno in negativno selekcijo. To sta protein, ki omogoča rezistenco proti antibiotiku in sacB. SacB je levansaharaza. P ...l RNA-stikalo, ki je nadzorovalo izražanje zapisa za zeleni fluorescenčnim protein (sfGFP) povezan s sacB [1].

...močjo Bayesove analize, so nevrotransmiter serotonin, hormon kortizol, nov protein - Gsα in dve mikroRNA - 124 in 132. ...tifikacije - aptasenzorje oziroma FRET aptamerje za serotonin, kortizol in protein Gsα ter magnetne nanosonde, ki se uporabljajo za mikroRNA. Aptasenzor je s

...(periplazemski vezavni protein), med katere spada tudi RBP (riboza vezavni protein). Pri tem pride do konformacijske spremembe, ki omogoči interakcijo s tran Leta 1994 so konstruirali fuzijski protein Trz [4]. Sestavljata ga periplazemska in transmembranska domena receptorja

# Myopia disease mouse models: a missense point mutation (S673G) and a protein-truncating mutation of the ''Zfp644'' mimic human disease phenotype. (K. I. ...approach for synthesis of a functional IgG using a reconstituted cell-free protein synthesis system (S. Murakami ''et al''; Scientific Reports 9, 2019; https:

...epresor nadalje kontrolira promotor pod katerim leži regija za reporterski protein mRFP. Po vezavi liganda na območje riboswitch se sinteza represorskega pro ...in predstavljajo signal za bakterije v okolju. AHL se veže na receptorski protein LuxR, ki preko pozitivne povratne zanke še dodatno aktivira izražanje Lux

...1, PV2 and PV3. The difference between them is a slightly different capsid protein. The capsid proteins are very important for different things, one of them i ...oliovirus we can newly synthesis plus-stranded RNA that represent mRNA for protein synthesis or to encapsidate the virus with the virus proteins. In different

...veže z visoko afiniteto (Kd = 0,2 nM), ter ima na C- oz. N-koncu fuzijski protein. Slednji ojača raven translacije (pozitivna povratna zanka) ali pospeši r ...o je raven translacije zelo nizka. Sledi aptamer MS2, zapis za reporterski protein EGFP (omogoča kvantifikacijo ravni izražanja), T2A (peptid Thosea asigna

...initetno kromatografijo. Tak fuzijski protein bi sestavljala CBD-domena in protein S-plasti, imenovan slr1272. CBD-domena, je domena, ki veže ogljikove hidra ...snovali del z GFP. Z linkerjem (-GSGGGGGG-) je vezan na vsak rekombinanten protein in omogoča enostavno detekcijo izražanja rekombinantnih proteinov [2,3,5,

...anjo membrano so dosegli tako, da so ju prek linkerja vezali na membranski protein ClyA, značilen za bakterijo E.coli. Tudi to so izbrali na podlagi predhodn ...gradnje je, da bi lahko enostavno zamenjali zapis za PAMP-e ali membranski protein, saj imajo različne rastline različno močne odzive na posamezne molekule

...a bralna okvirja (ORF1 in ORF2) in poli-A rep na 3' koncu UTR. ORF1 kodira protein, ki je ključen za stabilizacijo nove kopije L1, ORF2 pa kodira proteine z ...nslacijo sintetizirajo ORF1 in ORF2 proteini. Na poli-A rep L1 RNA se veže protein, ki omogoči tvorbo L1 ribonukleoproteina (RNP). L1 RNP se transportira naz

...moforjih (cyan-modro flurescirajoči protein (CFP) in rumeni flurescirajoči protein (YFP)), ki sta medseboj kovalentno povezana z linkerjem DEVD. V primeru, da ...na kaspaza-3, bo ta cepila mesto DEVD in omogočila linearizacijo proteina. Protein se bo potem konformacijsko spremenil tako, da se tvori osnovna struktura be

...le iz fibroblastov pasme Large White in so izražale zeleni fluorescirajoči protein Venus. Druga skupina je predstavljala inducirane matične celice iz iste ce ...b pregledu trupel so ugotovili, da vsa tkiva izražajo zeleni fluorescenčni protein Venus. Pri Jukatanskih prašičih so prav tako oplodili dve samici in sicer

...dosegla, da so posamezne celice oscilirajoče izražale zeleni fluorescenčni protein, vendar med sabo niso bile usklajene. Eden izmed možnih načinov za sinhro ...celice vsebovati še reporterski plazmid z zapisom za zeleni fluorescenčni protein s krajšo življenjsko dobo pod kontrolo promotorja P_LtetO1, na

...jo v svojem genomu 16 nestrukturnih proteinov. Odkrili so, da nestrukturni protein 14 (nsp14) koronavirusov vsebuje oziroma zapisuje 3'- 5' eksoribonukelanzo Koronavirusni nestrukturni protein 14 (nsp14) je večnamenski protein z aktivnostmi eksoribonukleaze in metiltransferaze.

...i so vsebovali CMV promotor, signalni peptid BM40, funkcionalni membranski protein in poliadenilacijski signal.   ...receptorski konstrukt vnesli 3 elemente za detekcijo: rdeči fluorescenčni protein mRuby 3 za detekcijo receptorja s fluorescenčnim mikroskopom, epitop za A3

....ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC41287/ Apoptosis induced by a human milk protein]

...čanje promotorja. Za preprečitev tega, so gen razcepili preko inserta za π protein. Na mestih deljene T7 RNA polimeraze so primerno umestili rekombinacijska m ...odira za polovico π proteina, potrebujemo oba dela, da dobimo funkcionalen protein π. Tako bi v primeru le ene rekombinacije (ob delovanju integraze) prišli

...čanje promotorja. Za preprečitev tega, so gen razcepili preko inserta za π protein. Na mestih deljene T7 RNA polimeraze so primerno umestili rekombinacijska m ...odira za polovico π proteina, potrebujemo oba dela, da dobimo funkcionalen protein π. Tako bi v primeru le ene rekombinacije (ob delovanju integraze) prišli

...do porabe aminokislin, do stresnega odziva celice ali pa se rekombinantni protein začne kopičiti v obliki netopnih agregatov oziroma inkluzijskih telesc. ...and Juergen Mairhofer: Bacteriophage Inspired Growth-Decoupled Recombinant Protein Production in Escherichia coli. ACS Synthetic Biology 2020 9 (6), 1336-1348

3'-OH-repke ovije RPA (replikacijski protein A, evkariontski protein, ki se veže na ssDNA). Njegova vloga je preprečitev razkroja repka in tvo ...o mutacije genov BRCA povezane s pojavom raka na dojki in rakom jajčnikov. Protein BRCA2 torej v kompleksu pomaga najprej pri zamenjavi RPA z Rad51, nato pa t

...It transduces signals when its extracellular domain is activated by Delta protein expressed on the surface of the signal – sending cell. This signal leads

Glavni faktor zaznave poškodbe pri evkariontih je XPC protein (Xeroderma pigmentosium C), ki v svoji funkciji iskanja poškodbe nastopi � ...zavo XPC zaznati UV-DDB kompleks (ultraviolet radiation-DNA damage-binding protein). UV-DDB je heterodimer, ki ga sestavljata DDB1 ter DDB2, in ima izrazito v

...ako odkrili 'moonlighting' aktivnost tRNA endonukleaze (fenomen, ko ima en protein, za katerega so mislili, da ima le eno vlogo v celici, več različnih funk ...zgrajena. To omogoča vezavo ribosoma in začetek translacije L7Ae. Ko pa je protein ponovno prisoten, se ta veže na 5'UTR regijo in stabilizira strukturo k-ob

...nningham, P. et al. GFP-complementation assay to detect functional CPP and protein delivery into living cells. Sci Rep 5, 18329 (2015). https://doi.org/10.103 ...J, Rothan HA, Zhong Y, et al. A small molecule inhibitor of ER-to-cytosol protein dislocation exhibits anti-dengue and anti-Zika virus activity. Sci Rep. 201

Kot efektorski protein, ki bi sprožil celično smrt, so uporabili nukleazo iz bakterije ''Staphyl * zapis za fuzijski protein N-končnega dela proteze TEV in proteina COP1 iz ''Arabidopsis thaliana'',

...in XPG. XPA poskrbi, da so vsi ostali faktorji NER na mestu. Replikacijski protein A (RPA) koordinira izrezovanje in stabilizira preiniciacijski kompleks. Po Protein XPA je centralni dejavnik mehanizma NER, saj veže veliko število faktorje

...sestavni del membrane (M - membrane),protein ovojnice E (E - envelope) in protein N (N - nucleocapsid). Genom poleg naštetih vsebuje tudi zapise za več dru ...heksadekamerni strukturi in sta ključni za vezavo RNA. Nsp10 je neencimski protein, ki vpliva na pravilnost replikacije tako, da regulira aktivnost nsp14 in 1

...bodo tvorili replikacijske vilice. Sestoji iz sekvence DNA, ki jo prepozna protein DnaA (DnaA škatle). DnaA, vezan na ATP, ob pomoči HU (histone-like protei ...tudi odcepi od ParB-DNA kompleksa, ki se veže na naslednji ATP-vezan ParA protein. Ta interakcija pripomore k usmerjanju oriC regij kromosoma in njegovemu pr

...During bacteria’s response to DNA damage, CI is cleaved by bacterial RecA protein and thus cannot bind its response elements. This allows production of Cro r ...on of the other, just as CI inhibits transcription of ''cro'' gene and Cro protein inhibits transcription of ''cI'' gene. The switching is carried out by addi

...idno sekvestracijo, so spojili protein ParB, ki veže DNA, skupaj z RLP-ji. Protein ParB reagira s specifičnim zaporedjem DNA in rekrutira plazmid. Fuzija pro ...cah. Ustvarili so reporterski protein, ki je vseboval citrin fluorescentni protein, spojen z DHFR, ki vodi do razgradnje fuzijskega partnerja. Za nadzorovanje

...gnize specific DNA sequences. This way, there is no need to engineer a new protein for each new DNA target sequence.<ref name="ref1">Sternberg, S.H., Redding, ...s a dual-guide RNA. Guide RNA consists of crRNA (which interacts with Cas9 protein by “handle”) and trans-activating crRNA (tracrRNA) for target recogniti

...is and insulin action by adipocyte hormones: leptin, acylation stimulating protein, and adiponectin<br>

1. Prvi protein je fuzija med SynTALE DNA vezavno domeno in PhyB domeno iz rastline ''Arabi Modro svetlobo so uporabili za nadzor flokulacije, da se je protein Flo1 začel proizvajati in izražati le po proizvodnji zadostne količine �

...skave dodelili v družino ribonukleaz III. Dokazali so, da je Drosha jedrni protein. Opravili so eksperiment, kjer so z negativno regulacijo s protismiselnimi ...domena ni dovolj za vezavo substrata na encim, drosha potrebuje partnerski protein, ki prepozna pri-miRNA. Imenuje se DGCR8 (DiGeorge syndrome critical region

...ti pomembno vlogo pri širjenju heterokromatina. Tako se npr. korepresorski protein TRIM28 veže na vezavno mesto, ki se nahaja na transpozonu ERV in s tem uti ...r. Njegova transkripcija ščiti človeški gen HBE1 (ki kodira za istoimenski protein (hemoglobinska podenota epsilon)) pred regulacijo z drugimi promotorji.<br>

...ki so ga vzeli iz ''V. fischeri'', ter tako aktivira transkripcijo gena za protein Cro. Promotorja ''PluxI'' in ''PlacIQ'' sta bila med seboj ločena s pribli ...iji. Profag lambda tudi ni energetsko preveč obremenilen za celico, saj je protein cI prisoten zgolj v nekaj sto monomerih na celico [5].

...opazovali regulacijo trankripcije gena YPet, ki se prepiše v fluorescenčni protein. V brezceličnem sistemu, ekstrakt E. coli, je prišlo do in vitro transkri ...protismerno sDNA proti glavnemu kapsidnem proteinu (''angl.'' major capsid protein) [2].

...omemben element BRE, ki se nahaja navzgor od škatle TATA in ki ga prepozna protein TFB. Po vezavi TBP in TFB na promotor je mogoče oblikovanje prediniciacijs Pogosto je v tvorbo predinicijacijskega kompleksa vključen še en protein, ki optimizira kontakte znotraj samega kompleksa in med proteini in DNA. To

...ki so ga vzeli iz ''V. fischeri'', ter tako aktivira transkripcijo gena za protein Cro. Promotorja ''PluxI'' in ''PlacIQ'' sta bila med seboj ločena s pribli ...iji. Profag lambda tudi ni energetsko preveč obremenilen za celico, saj je protein cI prisoten zgolj v nekaj sto monomerih na celico [5].

...teristične valovne dolžine spremenijo svoje lastnosti. Takšen je na primer protein VIVID iz nitaste glive ''Neurospora crasa'', ki deluje kot fotoreceptor za ...ko potekala. GFP je sicer nastajal v C-končni fuziji z degronom DAS, ki bi protein načeloma vodil v razgradnjo, vendar je proteaza TEVp oznako odcepila.

...transkripcijo 2 genov; gena za eksolizin in gena za endolizin. Eksolizin (protein virusa) je specifičen za posamezen bakterijski sev (ali seve) in torej, ko ...(algLs), ki jo izločajo nekateri mikroorganizmi v prebavilih rib. Imunogen protein bi se tako absorbiral v kri in prišlo bi do nastanka imunskega odgovora. S

...potrebuje homolognih sekvenc, saj se na oba konca DBS mesta veže po en Ku protein. Proteina se s proteinskim kompleksom združita. Na koncu procesa je potreb ...endar kompleksnejši kot pri prokariontih. Poškodbe na genomu najprej zazna protein XPC, ki nato s tvori kompleks s proteinom XPA. Ta omogoča vezavo helikaz X

...teina PduD, s čimer se je konstrukt lahko vezal na proteine v notranjosti. Protein PduD je eden izmed proteinov mikrokompartmenta Pdu in sestavlja njegov notr ...kte (BBa_K2213003, BBa_K2213004 in BBa_K2213005) ki so vsebovali fuzijski protein z N-terminalno sekvenco PduD, PPK in 6xHis oznako. Od teh je bil v drugega

...h kot tudi v kompleksnejših metazojih. Genom sesalcev kodira samo en Dicer protein, insekti (vinska mušica) in glive dva Dicerja, nekatere rastline pa kodira ...o afiniteto le do dolge dsRNA zunanjega izvora. V vinski mušici so zaznali protein R2D2, njegova funkcija v Dicer-2/R2D2 kompleksu pa je prenos siRNA do kompl

...ato so uporabili rumeni fluorescenčni protein (YFP) in rdeči fluorescenčni protein (RedStarII), ki sta pokazala vzorce izražanja za nativne in z eritritolom ...dveh reporterskih genih, ki sta kodirala za rumeni in rdeči fluorescenčni protein. Reporterski sistemi so testirali različne BDPje ali hibridne BDPje (HBDP)

...ato so uporabili rumeni fluorescenčni protein (YFP) in rdeči fluorescenčni protein (RedStarII), ki sta pokazala vzorce izražanja za nativne in z eritritolom ...dveh reporterskih genih, ki sta kodirala za rumeni in rdeči fluorescenčni protein. Reporterski sistemi so testirali različne BDPje ali hibridne BDPje (HBDP)

...ga proteina, ki vsebujeta številne HEAT(hantingtonov elongacijski faktor3, protein fosfataza 2A in kinaza TOR1) ponovitve. ...n, ki ima v transkripciji široko vlogo). CTCF verjetno blokira insulatorni protein, ki z ustvarjanjem DNA zank preprečuje povezavo promotorja in oddaljenih o

...dobili N (TyrRSN) in C (TyrRSC) terminalni fragment. Naredili so fuzijski protein s SYNZIP17 in SYNZIP18 peptidom. Za ncAA substrat so uporabili para-iodo-L- ...brez mIF. Rezultati so pokazali, da nastaja sfGFP, če se izražajo fuzijski protein tBID-PylRSC in Mcl-1 ali Bcl-2. Fluorescenco so zaznali samo v primeru, ko

...protein(cucumovirus). Medtem, ko je bil prvi VSR pri živalskih virusih B2 protein, najden v FHV virusu. ...primer Hc-Pro in B2 inhibirata viRNA pot z napadom na dicer, medtem, ko 2b protein napade agronavtski kompleks.

...eljejo'' obe polovici GFP proteina dovolj skupaj, da se lahko povežeta, in protein začne fluorescirati. S tem pokažejo, da RNA ogrodja služijo kot mesta za ...egini, T. Moon, C. Petzold, A. Ullal, K. Prather, J. Keasling. ''Synthetic protein scaffolds provide modular control over metabolic flux.'' Nat Biotechnol. 20

...soacil-CoA tiolaza. Pex7 deluje kot citosolni šaperon, ki prepozna PTS2 in protein s tem zaporedjem prenese na peroksisomalno poro na membrani peroksisoma. Z Uspešno so pripravili fuzijski protein Pex3-bakteriorodopsin in ga integrirali v membrano peroksisoma - to so dok

...funkcionalne RNA molekule, ki pa se za razliko od prejšnjih ne prevedejo v protein. Izraz majhna RNA (s-RNA), se uporablja za majhne bakterijske nc-RNA moleku

...ral izražati konstitutivno. To je bilo izpolnjeno tako, da je bil fuzijski protein Lpp-OmpA-EC20 postavljen pod nadzor konstitutivnega promotorja E.coli BBa_J ...a N-konec proteina dodana oznaka Flag. Da pa se je lahko preverilo, ali se protein nahaja na površini, je bilo na njegov C-konec dodano nanotelo, ki veže GF

...lj komercialno in uporabniško zanimiv pristop kot le enostaven reporterski protein. ...ding protein''), dobro preučevano nanotelo, ki veže zeleni fluorescirajoči protein (GFP). Kot je opisano v načrtu poskusa, so GBP razdelili na C- in N- konč

E1 ali ubikvitin-aktivacijski protein ob porabi ATP-ja katalizira prvi korak ubikvitinacijske reakcije, tako da a ...in 1), ki se veže na C-konec Cul1, in Skp1 (ang. S-phase kinase-associated protein 1), ki se veže na N-konec Cul1. Medtem ko Rbx1 omogoča izmenjavo E2-Ub in

Protein M je glavna strukturna komponenta, ki daje virusu trdnost in stabilizira nj Protein hemagglutinin (HA) prepozna terminalno α-sialično kislino (receptorska mo

Protein antigens are encoded into DNA, during DNA vaccine production. Antigen-speci

...vo na mRNA nadzirajo prepisovanje, pri čemer pogosto sodeluje RNA šaperon, protein Hfq, ki omogoča parjenje baz kompleksa sRNA-mRNA in stabilizira molekule s ...ih genomskih elementih, vključno z genom ''kilR'' iz ''rac'' profaga. KilR protein blokira celično delitev in inducira celično smrt. Aktivacija OxyS vodi do

...plicing-om« in poliadenilacijo. Vendar ostaja nepreveden, saj ne kodira za protein. ...etov alel Xist je uravnavan z maternim X-vezanim aktivatorjem E3 ubikvitin protein ligaza (Ubr2), medtem pa je materin kromosom X zaščiten z represivnim Xis

...i se konstitutivno izraža in SoxS promoter, kamor se veže. SoxR je dimerni protein, ki ga aktivira reverzibilna oksidacija vsebujočega klastra [2Fe-2S] z NO ...joče RNA MicC (ti. scaffold zaporedje), kamor se veže protein Hfq. Slednji protein promovira hibridizacijo RNA (deluje kot RNA šaperon) in rekrutira degredac

...ps://cdn.rcsb.org/images/hd/by/1by3/1by3.0_chimera_tm_350_350.png FhuA] je protein z maso 78.9 kDa, ki se nahaja v zunanji membrani gram-negativnih bakterij k ...ibilno veže na sekundarna mesta v receptorju. Interakcija receptor vezavni protein-receptor sproži konformacijske spremembe v strukturi repa, kar povzroči,

...čna telesca), lipoproteinov in ribonukleinskih kompleksov (miRNA vezana na protein AGO 2). Zunajcelična miRNA je relativno stabilna, saj je pred RNazami zaš

...orescenčni protein na ne-sevalni način. To bi povzročilo, da fluorescenčni protein v fuziji odda svetlobo z drugačno frekvenco in amplitudo. Učinkovitost BR ...roizvodnjo saharoze, s čimer bi povečali učinkovitost fotosinteze. Gena za protein Hfq in siRNA bi vstavili pod kontrolo konstitutivnega promotorja [1, 4].

...ti ne more priti do sestavljanja tega kompleksa. RAP1 služi kot adapterski protein za TRF2, saj z vezavo poveča afiniteto TRF2 do dsDNA in preprečuje nehomo ...V S fazi celičnega cikla se telomerni konci podvojijo, pri čemer sodeluje protein TRF1. Po končani replikaciji šelterinska proteina TRF2 in POT1 skupaj s k

'''Nevroligin'''(NLGN) je protein ([http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/7/73/Neuroligin4.png tercia

...ajverjetneje vseboval vsaj en protein, podoben dicerju, en protein Ago, en protein PIWI in od RNA odvisno RNA polimerazo, ki bi lahko imela tudi druge vloge v 1. Dicerju podoben protein, ki sestoji iz RNAze III in domen helikaze,

...protein SpyTag. Na N-končni fragment razdeljene proteaze TEV pa so pripeli protein SpyCatcher s signalnim zaporedjem TorA, ki je vodilo v periplazmo. Tu je pr

...zno transkriptazo, integrazo in proteazo. HERV vsebuje tudi gen, ki kodira protein env oziroma ostanek njihovega eksogenega retrovirusnega izvora pred vstavit ...nost spremenljevalca nukleinske kisline in RNA vezavno domeno. ORF2 kodira protein z encimsko aktivnostjo, ki je potreben za retrotranspozicijo LINE-1. ORF2p

...ukturni element biofilmov in so zaslužni za togost in adhezivne lastnosti. Protein ki tvori amiloidne fibrile pri ''E. coli'' se imenuje ''curli''. Ta tvori o ...ine. To so polimeri glutationa, ki so sposobni kelirati ione težkih kovin. Protein iscA (Iron-Sulfur Cluster Assembly) ima v celici več vlog, med drugim ima

...http://www.nature.com/articles/srep40130#s1) [[Disulfid izomerazi podoben protein AtPDIL1-2 kot kandidat za fitodetoksifikacijo 2,4,6-triklorofenola]]. Ana C ...ccus lactis NZ9000, ki izločajo biološko aktivni s pankreatitisom povezani protein I (PAP)]]. Domen Klofutar, 29. marec 2017

...li sistem [https://international.neb.com/products/e6800-purexpress-invitro-protein-synthesis-kit#Product%20Information PURExpress] [5], ki je varianta osnovne ...odan operator laktoznega operona, sledi vezavno mesto za ribosom, zapis za protein, končajo pa se s terminatorjem ''phi'' iz faga T7.

...idejo, so uporabili znano strukturo ribosoma <em>E. coli</em>, vezanega na protein SelB in mRNA, ki vsebuje SECIS. Struktura je pokazala, da se med naravno si ...prekurzor reporterskega proteina, ki postane aktiven s samoizrezovanjem. V protein, ki zagotavlja odpornost proti kanamicinu (KanR), so vstavili intein imenov

...sintaza pa iz ''Saccharomyces cerevisiae''. Bakteriorodopsin je membranski protein arhej, ki vsebuje eno molekulo retinala, bližnja asparaginska kislina pa j ...gradient kot vir energije za pretvorbo ADP v ATP. Prav tako je membranski protein, ki uporabi energijo dveh protonov za formacijo ene fosfodiesterske vezi [6

...ntigene<ref>Moon, H., et al., Developing genetically engineered encapsulin protein cage nanoparticles as a targeted delivery nanoplatform. Biomacromolecules, ...namo že vizualno, na podlagi fluorescence. Študenti so pripravili fuzijski protein enkapsulina s peptidom OT-1, ki izhaja iz ovalbumina in za katerega je bilo

...nastanejo zaradi mutacije gena, ki zapisuje za MeCP2 (Metil-CpG binding protein-2). MeCP2 je protein, ki se veže na metilirano CpG območje na promotorskem mestu na DNA. Deluj

...ugacije pride le pri dovolj visoki gostoti celic agrobakterij, saj je TraR protein, ki se aktivira ob dovolj visoki količini acilhomoserin laktonskega avtoin ...lekulo prepozna kinaza virA, ki se avtofosforilira, nato pa fosforilira še protein virG. VirG postane tako aktiven in zato lahko aktivira transkripcijo ostali

...okislin med Hoc genom in IRF-2BP2 (interferon regulatoren faktor 2 vezavni protein 2). Ta fragment kodira aminokislinski motiv PEPEGE, ki se pri evkariontskih ...e protein na sredino heksamerov sestavljenih iz gp23 proteinov. Gen za Hoc protein (gpHoc) kodira štiri Ig-podobne proteinske domene, vezava z glikanom pa je

...virusna vektorja, intein pa nato omogoči rekontrukcijo proteina v celici. Protein Cas9 je razdeljen na mestu med Lys637 in Thr638, na njegov C-terminalni del ...ki je vstavljeno med delom zaporedja gena Ga20ox in genom za reporterski protein. Onemogoča neposreden stik med omenjenima zaporedjema, da se lahko lucifer

...na pomožnih vektorjih, ki so skupaj z vektorjem, ki vsebuje gen za željeni protein in nujne elemente virusne DNA, vstavljeni v celično linijo primerno za tvo ...otein, pri čemer glikoprotein spojimo z ligandom, ki se bo vezal na tarčni protein na površini celic, ki jih želimo transducirati.

...ki največkrat delujejo kot represorji) v kompleksu s KAP1 (KRAB-associated protein 1). Na kompleks se lahko vežejo drugih proteini (npr. SETDB1 (SET domain b ...o za proteine. Te lahko gostiteljski organizem »udomači« in tako pridobim protein z novo funkcijo. TE lahko služijo tudi kot osnova za nastanek novih transk

...dolgega zaporedja ORF, ki ima zakodiran protein IEP (angl. intron-encoded protein). IEP je reverzna transkriptaza, ki vsebuje 7 ohranjenih zaporednih blokov ...uro, ki katalizira izrezovanje. V in vivo pogojih se mora najprej prevesti protein IEP in se vezati na intronsko RNA, da tako pripomore k zvijanju intronske R

...ata v glikolno kislino, ob čemer se NADPH oksidira v NADP⁺ [4]. Protein iNap na koncu deluje kot senzor za NADPH, saj se ob vezavi tega kofaktorja | Protein || Opis || '''INPNC''' || '''BrkA''' || '''AIDA'''

...pravljena protitelesa sposobna vezati tarčo, čeprav je IDO2 znotrajcelični protein, po vezavi pa ga limfociti B preko receptorja FcγRIIb internalizirajo. S t

...pravljena protitelesa sposobna vezati tarčo, čeprav je IDO2 znotrajcelični protein, po vezavi pa ga limfociti B preko receptorja FcγRIIb internalizirajo. S t

...in DMPK (distrofična miotonična protein kinaza; ang: “Dystrophia Myotonica Protein Kinase”) na kromosomu 19. Določene raziskave pa se osredotočajo tudi na

...NA polimeraze II oziroma vezava kompleksa UV-DBB (''UV-damaged DNA binding protein'') oz. kompleksa XPC (''xeroderma pigmentosum group C''). Napačen nukleoti ...n katalizirajo jo fosfoinositid-3-kinazi podobna kinaza (PIKK) ATM ter DNA-protein kinaze. Fosforiliran histon, γ-H2AX, je potreben za formacijo IRIF (''ioni

...se. Eden izmed pomembnih nehistonskih proteinskih kompleksov je heksamerni protein shelterin oziroma telosom. ...lizira encim tankriaza (TNKS1; ang: tankryase). Encim se veže na telomerni protein TRF1, ki negativno vpliva na vzdrževanje telomerne dolžine – je njen ne

...nuclease uses guide RNA molecule to recognize specific cut site instead of protein DNA interactions and is therefore easier to manipulate and more suitable fo ...site on the DNA via short guide RNA and thus does not require any complex protein modifications or laborious and time-consuming construct assembly as in the

...emenili za izločanje terapevtskega proteina, so zamenjali SEAP reporterski protein z IL-10 v ekspresijskem vektorju pLS13 z restrikcijo in ligacijo. Za potrdi ...otna v AAV. ANCA imajo afiniteto za proteinazo 3 (PR3), zaradi česar je ta protein primerna afinitetna domena za sintezni receptor. Vezava protiteles na recep

...r in fluorescirajoči protein yEGFP (angl. yeast enhanced green fluorescent protein) [1,3]. S spreminjanjem koncentracije induktorja so izmerili sigmoidno odvi ...rton, N. A. Gow, S. Falkow, A. J. Brown. »Yeast.enhanced freen fluorescent protein (yEGFP): a reporter of gene expression in Candida albicans.« Microbiology

...teina, zaradi interakcij z napačno sparjeno bazo. MutS je tudi ATP vezavni protein. Na mestu mutacije se v nukleotid vezavno domeno ene podenote veže ATP, iz V naslednjem koraku protein MutL v obliki homodimera interagira z MutS, vezanim na DNA. Kompleks MutS-M

...nce consisting of an N -terminal HiBit; c) a C-terminal yellow fluorescent protein and d) AtuOCS ...oskinen et al. Expression Atlas update––an integrated database of gene and protein expression in humans, animals and plants. Nucleic Acids Research. 2020, 44

...e v translokacijski kompleks, peptidaza pa odcepi signalni peptid. Nato se protein sprosti v supernatant, kjer zavzame nativno konformacijo.

...možnost delovanja kot lizocim. Poleg CotG so testirali še vezavo na sidrni protein CotZ, ki se nahaja v zunanji ovojnici, katera objema plašč spore [1].

...ro, ki veže Hfq in od rho neodvisen terminator. Protein Hfq je RNA-vezavni protein ima ključno vlogo pri post-transkripcijski regulaciji izražanja genov na ...komplement START-kodona ATG in 21 nt dolg zapis za zeleni fluorescirajoči protein (GFP) ter to izrazili v ''E.coli'' BL21(DE3). Ugotovili so, da taka dolga s

...nov lahko razdelimo na 3 regije (NTD, HMG, CTD). HMG ('high mobility group protein') je DNA-vezavna domena in je ključna za pravilno delovanje proteina. ...nje motenj imunskega sistema zaradi mutacij v WAS genu. Ta gen kodira WASP protein, njegova izraženost pa je omejena na hematopoetske celice (krvne celice iz

...ceptor PtNTT2 iz alge Phaeodactylum tricornutum. Pred zapis za transportni protein so vstavili še lacUV5 promotor in močan zapis za RBS. Za cds regijo prote ...eliko kopijah vsebuje zapis za nukleozid trifosfatni transporter PtNTT2 in protein cas9, ki razgrajuje drugi plazmid z izgubljenim isoG-isoCm baznim parom. Dr

...zaporedje usmerjeno proti IRL in v nasprotno smer kot zapis za reporterski protein. Pri tako opisani orientaciji do izražanja reporterskega gena naj ne bi pr

...zaporedje usmerjeno proti IRL in v nasprotno smer kot zapis za reporterski protein. Pri tako opisani orientaciji do izražanja reporterskega gena naj ne bi pr

...em je zapis za TetR represor, ki se konstitutivno izraža, na drugem pa GFP protein pod kontrolo tet promotorja, ki ga represira TetR. Ob dodatku anhidrotetrac ...aTc se začne povečevati količina TetR-GFP do točke, ko je ves aTc vezan na protein in s tem s odstranjen iz sistema. Od tega trenutka dalje je TetR-GFP prost

...epoznavanje attL in attR (v odsotnosti RDF). Reverzno reakcijo pa povzroči protein RDF, saj sistem integraza-RDF zavira aktivnost integraze, zato se postopek ...hko na konec zaporedja RDF pripne oznaka 16 aminokislin dolg replikacijski protein A (RepA). Dodatna oznaka ne sme vplivati na rekombinacijo, zato je bil ustv

..., N., Aden, S., Kisovec, M., Podobnik, M. & Anderluh, G. (2020). Design of Protein Logic Gate System Operating on Lipid Membranes. ''ACS Synthetic Biology'' ' ...tih s holesterolom [4]. Listeriolizin O se sintetizira kot topen monomerni protein, ki po pritrditvi na membrano preko holesterol-vezavne regije oligomerizira

...bp, kodirajoča regija pa zapisuje gene za transpozazo OrfAB in regulatorni protein ORFa. ...podenoti transpozaze, ki prepoznata dve terminalni zaporedji Tn7, TnsC je protein, ki uporablja ATP ter z njeno hidrolizo kontrolira delovanje transpozaze, T

Alternativni reporterji so bioluminiscentni protein. Komplet vsebuje luciferazo iz ''Gaussie princeps'' (zelo svetla) in modifi ...nu ''nac2-26'', modificirane z modulom, ki vsebuje kodirajoče zaporedje za protein NAC2 pod kontrolo promotorja P_METE bi lahko rasle fotoavtotrofno

...sledila modifikacija sponge plazmida, kamor so vstavili gen za reporterski protein oziroma gen za protirakavo učinkovino azurin, ki je pod regulacijo PLtetO1 ...ega z ekspresijskim sevom ''E. coli'', ii) dokazovanje, da je sintetiziran protein res azurin, iii) dokazovanje sekrecije azurina (zaradi dodatka pelB-5D sekr

...skega sistema. Sodeluje pri vzpostavitvi interakcij protein-DNA in protein-protein [2]. TFE𝛽 vsebuje ohranjeni domeni WH in FeS. Domena WH TFE𝛼 tvori ko ...teina Rho (bakterijski terminacijski faktor). Študije so tudi pokazale, da protein Rho lahko sproži terminacijo pri arhejah in vitro. Dokazali so tudi, da ar

hmelj. HorA, horC in hitA. HorA zapisuje za protein, ki deluje kot ABC transporter in odstranjuje hmeljno kislino iz celice. HorC kodira za protein, ki deluje kot transporter zdravil,

...rja plazminogena. Med 12 transgenskimi samicami jih je 6 izražalo transgen protein v koncentraciji med 15,2 in 630 μg/mL. Z encimskim imunskim testom so dol

...e vezave sprostitvenega faktorja zgodi bolj na začetku, se takšen skrajšan protein razgradi. ...nekaterih arhejah in metanogenih organizmih razreda I. pa tudi adapterski protein SepCysE, ki ima visoko afiniteto do SepRS in SepCysS ter tako stabilizira k

...tizira glikoprotein bodice, vendar do okužbe ne more priti. Imunski sistem protein bodice prepozna kot nevarnost in tvori protitelesa, ki nas varujejo pred ok ...udi sposobnost imunskih celic prostovoljcev, da se aktivirajo kot odziv na protein bodice koronavirusa [8]. Cepivo Sputnik V (Gamaleya) vključuje še nasledn

...t motifs, which allow precise control over the sequence specificity of the protein. The main goal of today’s researches is to design zinc fingers that will Several different protein techinques were studied in modifying nuclease domain to minimize off-target

...ropni pa so povezani z G-proteinom (po vezavi molekule nevrotransmiterja G-protein difundira od receptorja in povzroči odpiranje ionskih kanalčkov ali sinte

...starostjo povezane bolezni]] [http://esciencenews.com/articles/2010/03/04/protein.shown.be.natural.inhibitor.aging.fruit.fly.model]<br> ...i]] [http://www.scientificamerican.com/blog/post.cfm?id=scientists-observe-protein-folding-2010-02-28]<br>

.... Imenujeta se MET1 (gen, ki kodira DNA-metiltransferazo) ter SGS3 (kodira protein, katerega funkcija zaenkrat še ni znana). Gena v živalski celici nista pr ...vacijo vsakega dicerja omogoča siRNA karakteristične dolžine. Razen drugih protein v miRNA poti, pri rastlinah poteka enaka miRNA biogeneza kot pri živalih.

...nega proteina ter na nukleoporine. Importini niso vedno direktno vezani na protein, včasih so vmes med proteinom in importinom še adaptorni proteini. Prenos

...aee H, Scherr DM, Schlemmer S, Senger RS. A novel synthetic sRNA promoting protein overexpression in cell-free systems.Biotechnol. Prog. 2023;e3324.]” ...nanje membrane OmpC v ''E. coli'' in izkazuje visoke ravni utišanja genov. Protein Hfq deluje kot RNA šaperon MicC [1].

...i čemer nastanejo protitelesa, ki specifično prepoznajo ter nevtralizirajo protein. Cepljenje omogoča telesu vzpostaviti dovolj veliko zalogo protiteles ter

Pri transkripciji HIV-1 ima ključno vlogo protein Tat. Ekspresija Tat proteina znatno poveča količino virusne RNA v okužen Za transport iz jedra v citoplazmo je ključen protein Rev, ki se veže na zaporedje RRE (Rev-responsive element) na mRNA. Rev in

...erminologisce/svetovanje/zeleni-fluorescencni-protein Zeleni fluorescenčni protein] (in drugi fluorescenčni proteini)<br> '''activity-based protein profiling''' - profiliranje proteinov na osnovi aktivnosti<br>

...n raztegnjen del ssDNA je imenovan invazivni konec. Podobno vlogo ima tudi protein Dcm1. Vloga tega filamenta je, da aktivno išče homologno verigo DNA, nato

...sproten efekt in po vstavljanju v celico inducirajo izražanje gena za nek protein, oziroma povečajo morebitno že prisotno izražanje tudi do desetkrat. Poj ...č transkript, se na slednjega veže aktivirajoča agRNA in tja privlači Ago2 protein. Kompleks agRNA/Ago2, posredno vezan na promotorsko regijo, lahko tako pozi

#[["Training protein" - PETaze]]. Urša Kapš (29.11.2016)

...ng temperature-mediated plasmid replication as a reversible and switchable protein expression system in genetic ''Escherichia coli''. J. Taiwan Inst. Chem. En ...ng temperature-mediated plasmid replication as a reversible and switchable protein expression system in genetic Escherichia coli. J. Taiwan Inst. Chem. Eng. 2

...slinskega zaporedja. Rezultati so pokazali, da je izoliran encim monomeren protein z 27 aminokislinskimi ostanki in ima proteolizno aktivnost. Raztopina je vs

...zeli iz iz 5´-UTR regije gena btuB v E.coli. Gen btuB zapisuje transportni protein BtuB, ki je odgovoren za prenos vitamina v celico. V kolikor AdoCbl ni veza ...kovito veže substrat FMN v aktivno mesto. Gen je zapisan kot monomer, a se protein kasneje poveže v dimer. Če bi zmanjšali prostost monomerov, bi lahko zma

...em>P. citrinum</em>, spadajo geni <em>mlcA-H</em> in <em>mlcR</em> [1, 2]. Protein MlcR deluje kot transkripcijski faktor oziroma aktivator, sestavljen je iz ...vaciji izražanja genov v rastlinah. Najprej so sintetizirali dva zapisa za protein MlcR, vsak pa je pred sabo imel različen lasten operator (en od <em>mlcA</

...er. Za njegov nastanek se porabi dvakrat več monomerov kot za aktivatorski protein, ki nastopa kot dimer. ...torsko zaporedje in sproži transkripcijo. Nasproten učinek ima represorski protein LacI, ki se kot homotetramer v odsotnosti IPTG (izopropil-β-D-1-tiogalakto

...jšne adhezije za podporo rasti aksonov. Skupina se je zato odločila dodati protein iz noge školjk (angl. Mussel foot proteins, MFP), ki v naravi služijo za ...i maksimizira DOPA interkacije s površino. Podobno kot ostali MFP-ji, tudi protein Pvfp-5β povzroča majhen imunski odziv, zato bi bilo potrebno poleg zdravl

Alba je najbolj razširjen arhejski protein za strukturo kromatina. Za razliko od histonov jo lahko protein, ki predstavlja skoraj 1% celotnega. Znanstveniki so pokazali, da veže raj

...TEV-YFP-HOC, kjer je HOC protein kapside bakteriofaga T4. Očiščen fuzijski protein so dodali v celični ekstrakt skupaj z DNA bakteriofaga T4. Sestavljene bak

...fluorescentno označenimi reporterskimi proteini (HSA), ki se vežejo na ABP protein. Tiste celice, ki torej vežejo GFP in HSA in fluorescirajo nad nekim prago

..., [https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/bit.27953 The interplay of protein engineering and glycoengineering to fine-tune antibody glycosylation and it

...lahko MTaza modificira kromosome in jih zaščiti. C-protein je homodimerni protein, ki se na palindromsko zaporedje na DNA veže z motivom vijačnica-zavoj-vi ...DNA-(cytosine N4) methyltransferase, an example of domain permutation and protein fold assignment,” Oxford University Press, 1997.

'''Vzrok:''' Napačen gen za poliadenilat-vezavni protein - [http://en.wikipedia.org/wiki/PABPN1 PABPN1], za katerega predvidevajo, d

...tična aktivnost proteasomov, in se takrat verjetno formira tretji kapsidni protein VP3. Izpostavljen N-končni del VP1 kapsidnega proteina bo služil kot jedr ...ite) in končnega resolucijskega mesta (TRS, terminal resolution site). Rep protein ima sposobnost da veže istočasno TRS regijo AAV DNA in DNA gostitelja pri

...tri ključne komponente: rekombinazo, protein SSB (single stranded binding protein), ki se veže na ssDNA (single stranded DNA), in DNA polimerazo. Rekombinaz Najprej so želeli izraziti fuzijski protein Phi29-linker-nCas9 v ''E. coli''. Zaradi velike molekulske mase niso mogli

...a proteina, ki sta naravno prisotna v E.Coli, in sicer NsrR in NarL. Vezan protein NsrR ovira vezavo RNA polimeraze. Vezava nitrata oziroma dušikovega oksida ...08 so lizirali ter z NaDS-PAGE dokazali izražanje encima. Kljub temu da so protein zaznali pretežno v celičnem peletu so uspeli dokazat njegovo aktivnost, p

...dobna dekarboksilaza, UbiX podobna flavin preniltransferaza in hipotetičen protein.

...zboljšanje razmerja med signalom in šumom. ERG je onkogen, ki se prepiše v protein ERG, ta pa deluje kot transkripcijski regulator. PTEN je tumor supresorski

...in je odstranjen iz nadaljnjih interakcij tako, da je vezan na membranski protein. Šele ko se sprosti, ga DAM metilaza popolnoma metilira in tako omogoči v ...se ta enostaven pogled zakomplicira z odkritjem, da vsaj eden CpG vezavni protein, MeCP2, lahko deluje kot transkripcijski aktivator v redkih primerih CpG me

...udi endolizini, ki jih proizvajajo bakteriofagi v času litičnega cikla. Ti protein cepijo točno določene vezi v peptidoglikanih, ki tvorijo celično steno b

...radi mutacije v kodirajočem zaporedju DNA, česar posledica je hiperaktiven protein v normalnih količinah. Zaradi genske amplifikacije in pri prerazporeditvi

...aka sta ključna virusna proteina E6 in E7. E6 se veže na tumor-supresorski protein p53, kar povzroči njegovo ubikvitinacijo in razgradnjo. V normalnih razmer

...tructural motifs distinguished by coordinated zinc ions that stabilise the protein fold. Each zinc-finger recognises 3 base pairs (bp) of DNA. Contacts betwee ...te variants for catalytic activity. Reporter system with green fluorescent protein (eGFP) was used to detect gene correction activity. The system uses HEK293

...acija z odseka DNA prepisati v zaporedje aminokislin, ki je značilno za ta protein. DNA se nahaja v celičnem jedru in ga nikoli ne zapusti. Sinteza proteinov

...reobčutljivosti na [http://en.wikipedia.org/wiki/Gluten gluten]. Gluten je protein, ki se nahaja v zrnju večine žitaric.<br>

...o gena, ki se je vstavila v 5. kromosomu, v intronu funkcionalnega gena za protein Cep120. Za identifikacijo mesta insercije so uporabili TAIL-PCR – Thermal

...gena fluorescenčnega proteina (EGFP) (angl.: ''enhanced green fluorescent protein'').

...NT162b1 (zapis za domeno RBD proteina spike) in BNT162b2 (zapis za celoten protein spike). V 1. fazi je sodelovalo 195 prostovoljcev 18-85 let, ki so prejeli

...po in poli-A repom (pri-miRNA) tvori lasnično zanko, ki jo prepozna jedrni protein DGCR8. Ta nato usmeri RNazo Drosha, da odcepi s stebla miRNA približno 11 ...promovira EMT. BMP (kostni morfogenetski protein – ang. bone morphogenetic protein) signaliziranje promovira MET in njegovi inhibitorji so tarče miR-302. Rep

...ivoju transkripcije. Druga možnost je, da lncRNA prepozna specifičen DICER protein, ki tvori več smRNA, ki sodelujejo pri utišanju genov. ...iz TE, nastale z delovanjem encima RNAPIV in jih spremni v dsRNA molekule. Protein DICER - LIKE 3 (DCL3) jih nato procesira v 24 nt siRNA, prenese v citoplazm

...otein so uporabili rumeni fluorescenčni protein (ang. ''Yellow Fluorescent Protein'', YFP). Vsi sevi Cyborg Marionette so sčasoma pokazali povečano izražan

Protein proti zmrzovanju Ammopiptanthus nanus (AnAFP) so dodali v E. coli, da bi za ...in mtSSB. SAHS 33020 ali znan tudi kot tardigrade intrinsically disordered protein (TDP), ki ob izsušitvi tvori nekristalinično amorfneo trdno matriko, ki j

...fikacije, ki bi omogočale prehod večih makrolidov skozi ta transmembranski protein. Za eksperimentalno potrditev tega so računalniško (SWISS-MODEL) analiz

...T-veriga), ki bo kasneje prenešena. Ti dve reakciji izvede TraI relaksaza, protein, ki je sestavljen iz transesterazne domene, ta katalizira reakcijo reza in ...aktivira PM promotor, ostale tra proteine pomembne za T4SS in relaksomski protein TraI. Proizveden TraM nato avtoregulira svojo ekspresijo preko PM promotorj

...iščenega hNGF so potrdili s pomočjo prenosa western in LC-MS/MS. Izolirani protein so dodali celicam PC12 in ugotovili, da je prišlo do induciranja nevronske

...sm against the antibiotic tetracycline in gram-negative bacteria. The TetR protein and its mutants are commonly used as control elements to regulate gene expr ...Pλ- , which is a fourth transcriptional unit coding for green fluorescent protein (GFP) controlled by the λ cI repressible promoter. The fluorescent signal

...ti molekularne značilnosti strukturnih genov ( (protein bodice (S), jedrni protein (N), membrana (M) in ovojnica (E))) delta različice COVID-19, da bi identi

...ogoča mobilizacijo plazmida. Najmanjši izmed RCR plazmidov kodirajo le Rep protein in komponentne nujne za kontroliranje števila nastalih kopij. RCR plazmidi ...abilizaciji prvotne DNA, ki se razvija. Ko se replikacija bliža koncu, Rep protein zopet katalizira reakcijo transesterifikacije na mestu prej nastale zareze,

...epresilatorja z reporterskim genom ''mVenus''(zapis za rumen fluorescenčen protein –YFP) pod regulacijo promotorja P(LTetO-1). Srž dela je bila uvedba vozl ...F11''. S sistemom ''NahR-PSal'' so dosegli, da se je konstitutivno izražal protein NahR, ki je zaviral izražanje σECF11. Ob dodatku salicilne kisline (I1) p

...de so izrazili v bakteriji ''Escherichia coli'' kot N- terminalni fuzijski protein s His6 oznako preko pET28a ekspresijskega vektorja. Sledila je izolacija s

SEB je enoverižni protein, velik 28 kDa, sestavljen iz 240 aminokislin, ki tvorijo dve domeni. SEB se

...ostavnejše in zanesljivejše orodje za spreminjanje genomske DNA, saj lahko protein Cas9 veže poljubno vodečo RNA (gRNA), katera je komplementarna tarčnemu

...in sicer do obnovitve oslabljenih CB-SC. Študije kažejo da CB-SC vsebujejo protein, ki je inhibitor apoptoze (cIAP-1), le ta zaščiti celice pred citotoksič

...bA-DsbB in DsbC-DsbD omogočila sintezo disulfidnih vezi v periplazmi. DsbA protein oksidira SH skupine cisteina in tvori disulfidne vezi. DsbB reciklira reduc ...apis za rDAO označen s sekvenco PelB (aminokislinsko zaporedje, ki usmerja protein v periplazmo bakterije), nukleotidni zapis rDAO in vektor pSB1C3 za negativ

...o, da je AML v kar 75% podobna Streptomyces exfoliatus in zato so ravno ta protein uporabili kot model.

...o na trans-aktivirajočo crRNA (tracrRNA). tracrRNA skupaj s crRNA vodi Cas protein do tuje DNA, katero nato zareže. crRNA in tracrRNA je v laboratoriju mogo� ...ce T, iz katerih so s pomočjo CRISPR-Cas9 izbili gen PDCD1, ki zapisuje za protein programirane celične smrti 1 (PD-1). PD-1 spada v družino imunoglobulinov

...r se zmanjša afiniteta MtlR do MtlR škatle, ki se nahaja v promotorskih in protein kodirajočih zaporedjih mtl operona, in zmanjša ekspresija. V prisotnosti

...a se translacija proteina prehitro zaključi in je posledično sintetiziran protein veliko krajši. Alu zaporedja, ki so se retrotranspozirala, imajo v primerj ...-1 vsebuje dva odprta bralna okvirja, in sicer ORF1, ki kodira RNA vezavni protein in ORF2, ki kodira endonukleazo in reverzno transkriptazo. Aktiven kompleks

...n DNA se cepi na fragmente. Prehod skozi citoplazemsko membrano pa omogoča protein ComEC, ki pa znotraj membrane tvori proteinsko poro in omogoča prehod le e

...ozno vezavne domene pripeli še protein CiPA (ang- cellulosomal scaffolding protein A).

...h bakterij boste ločili z elektroforezo ter določili, ali je rekombinantni protein topen ali netopen. Na koncu boste topnim proteinom določili biološko akti

...dosegli z induciranim izražanjem proteina β iz bakteriofaga λ-Red. Gre za protein, ki veže enoverižne fragmente DNA in jih usmerja na zaostajajočo verigo ...cu. Taka dolžina oligonukleotidov je primerna, ker je bilo ugotovljeno, da protein β potrebuje vsaj 30 nt dolgo verigo za tvorbo kompleksa in-vitro, in-vivo

...n DNA se cepi na fragmente. Prehod skozi citoplazemsko membrano pa omogoča protein ComEC, ki pa znotraj membrane tvori proteinsko poro in omogoča prehod le e

...ga povzemam, je reporterski gen predstavljal zapis za zelen fluorescenčni protein z mutacijama S65G in S72A ter degradacijsko oznako ASV (GFPmut3b-ASV) [3], [3] Andersen, J. B. ''et al.'' New unstable variants of green fluorescent protein for studies of transient gene expression in bacteria. ''Appl. Environ. Micr

...obimo na promotorski regiji genov za kodiranje tumor supresorske proteine. Protein 53 (p53) je eden izmed tumor supresorskih proteinov, katerega mutacije so v ...bicistronske RNA, ki kodira RNA povezovalni protein, odprt bralni okvir 1 protein (ORF1p ali p40) in endonukleazno ter reverzno transktiptazo (ORF2p). L1 ele

...v procesu aktivacije in njegovem mehanizmu imata nekodirajoča RNA Tsix in protein Rnf12. Ponovna aktivacija kromosoma X je še dokaj nepoznan proces, a vzbuj ...e je Rnf12 – ubikvitinska ligaza. Gen zanj se nahaja blizu lokusa za Xist. Protein se veže se na Xist ne pa tudi na Tsix promotor. Rnf12 je pod nadzorom plur

...stidinska proteinska kinaza ob aktivaciji fosforilira nek drug regulatorni protein. Kot reporterski protein so se odločili uporabit kromoprotein amilCP z absorbcijskim vrhom pri 588

...a povzemam, je reporterski gen predstavljal zapis za zelen fluorescirajoči protein z mutacijama S65G in S72A ter degradacijsko oznako ASV (GFPmut3b-ASV) [3], [3] Andersen, J. B. ''et al.'' New unstable variants of green fluorescent protein for studies of transient gene expression in bacteria. ''Appl. Environ. Micr

...em za kontrolo rasti, ki je vseboval zapis za SpoTH in rdeči fluorescenčni protein (RFP) – GOI. Poimenovali so ga zaprta zanka (CL, plazmid P_IFFL_x), ker v ...ki je namesto zapisa za SpoTH vseboval zapis za nefunckionalni heterologni protein CJB (cjBlue H197S). S tem so želeli potrditi, da je sistem CL boljši od s

...dtem ko LIG3 interagira s proteinom XRCC1(X-ray repair cross-complementing protein 1). Če je Polβ odsotna, jo lahko nadomesti tudi Polλ, ki je manj učinko ...h stvari. Na mehanizem vpliva dostopnost BER faktorjev. Eden izmed njih je protein HMGB1, ki vpliva na potek različnih popravljalnih mehanizmov. Kadar je pri

...NNDORF (18 November 1997). "Abundance and location of the small heat shock protein HSP25 and αB-crystallin in rat and human heart". Circulation 96 (11): 3466

...2 bp, obe pa sta povzročili premik bralnega okvirja in posledično skrajšan protein CRY2, kar so potrdili tudi z izvedbo prenosa western.

...vi so O'Neil in sodelavci v klonirno mesto vstavili gene za fluorescirajoč protein in bakteriofage vstavili v E. Coli. Novonastali bakteriofagi so bili strukt ...ovirusov), ki se vežejo na receptor OprM na zunanji membrani bakterije. Ta protein tvori skupaj s proteinoma MexA in MexB kanal skozi membrane za izločanje a

...endonukleaze - dCas9, s čimer so dobili zelo dober programiran DNA vezavni protein. Zapis so vstavili v plazmid pdCas9, skupaj z tracrRNA in minimalnim lokuso

...ki ni patogen za ljudi in podgane in pri njiju povzroči visoke ravni IFN. Protein RSV F so vstavili v NDV. RSV F so izbrali iz 2 razlogov: (1) samo protitele

...nekaj mesecev, do tkiv pa potuje tako, da se veže na RBP (retinol binding protein), beljakovino, ki veže retinol. Pomanjkanje vitamina A lahko povzroči upo

...in of restriction enzyme FokI, which is linked with designated zinc finger protein (ZFP), which is responsible for targeting. By the use of different combinat ...associated sequences which allow transport into plant cells were excluded. Protein products of acquired coding regions were characterized by a SELEX assay usi

...hRNA transkripcija v jedru. Pre-shRNA se eksportira iz jedra v citoplazmo. Protein Dicer procesira shRNA, odstrani se zanka in nastane siRNA.Nato se poveže v

...abito DNA, ki se ovije okoli histona. Ta proces onemogoča ekpresijo genov. Protein, ki uravnava deacetilacijo histonov je histon deacetilaza (HDAC). Obsežna ...histonov. Opazili so, da se na metilirano DNA veže 5-metil-citozin vezavni protein (MBP), ki privlači HDAC. Iz tega odkritja so zaključili tudi to, da metil

...mRNA po transkripciji in na ta način omogočili vezavo usmerjevalne RNA na protein Cas9. ...merjenja aktivnosti nativnega encima glukoamilaze (gen ''glaA''). Zapis za protein so najprej izbili iz glivnega genoma, nato pa so ga vanj ponovno integriral

...popolno penetranco genov. Gre za mutacije genov za amiloidni prekurzorski protein (APP), presenilin-1 in presenilin-2. Za diagnozo atrofija velikih možganov

...hko preoblikujejo kromatin tako, da epigenetsko utišane gene izrazijo. Myc protein je regulatorni gen, ki poseduje zapis za transkripcijski faktor. V človeš ...imer je SSEA-4. Odkriti so bili tudi novi antigen, kot je podocalyxinlike protein-1, ki deluje obetavno, še posebej pri nediferenciranih človeških ESC. Pr

...načen s številom 3 pa je imel izbrisan gen za omenjeno proteazo in tudi za protein Far1, ki je bil pomemben pri regulaciji celične delitve kvasovk [1]. ...eva R3 enaka kontrolnemu poskusu. Vzrok najverejtne tiči v dleciji gena za protein Far1, ki uravnava celični cikel kvasovk. V vseh treh sevih pa je bilo opa�

...eg zapisov za encime (CrtB/I/Y) vsebovali še zapis za zeleni fluorescenčni protein (GFP) in zapis za odpornost proti puromicinu. Takšne konstrukte so nato sk

Signalno molekulo v vsakem sistemu sintetizira različen induktorski protein. ...otorja navzgor od gena za transkripcijski aktivator ali navzgor od gena za protein, ki sintetizira signalni AHL. Pri analizah navzkrižne reaktivnosti, kjer s

...rt-kodonom pa zapis za reporterski protein - monomerni rdeči fluorescenčni protein 1 (mRFP1). DNA-konstrukte so vstavili v ekspresijski vektor pFTV1, ki je im .... Voight, „Automated design of synthetic ribosome binding sires to control protein expression“, Nat Biotechnol, let. 27, št. 10, str. 946–950, 2010.

...707. Prvi del sistema obsega konstitutiven Andersonov promotor in zapis za protein BphR2, drugi del je pa sestavljen iz inducibilnega promotorja Pbphr1 in zap ...elektronski prenašalni verigi in pritrjevanju biofilma je ključnega pomena protein MtrB v zunanji membrani, ki skrbi za lokalizacijo citokromov in jih povezuj

...-MCS. RpAAV-MSC so modificirali z vnosom zaporedja EGFP (green fluorescent protein) med BamHI in BgIII restrikcijski mesti.

...ključuje samo vhodno molekulo, promotor, transkripcijski gen, mRNA, ciljni protein in izhodno molekulo za dinamično perspektivo ter zmožnost odgovora. V raz S programom Matlab so pridobili krivuljo za protein, ki ga je sprožila vhodna signalna molekula.

...-44988-8#Sec2 Engineering stringent genetic biocontainment of yeast with a protein stability switch] ...P (angl. ''yeast GFP collection''), pri katerem je v posameznem sevu po en protein označen z GFP (knjižnica vsebuje 4159 sevov), za njim pa se nahaja še se

#[[Synthetic protein scaffolds provide modular control over metabolic flux]]. Dueber ''et al''.,

...poznal modifikacije enega nukleotida, npr.: '''p53''' – tumor suspresorski protein, '''BRCA1''' in '''BRCA2''' – gen raka dojke. Biočipi so izdelani s pomo

...vanje potrebuje Mg2+ ione in koencim SRPP (''angl.'' small rubber particle protein) [5]. Sinteza IPP in DMAPP v E. coli obstaja kot endogena metabolna pot - M ...z UV-zaščitnim steklom. Balon s prototipom je dosegel višino 3 km, kjer je protein spremenil svojo barvo iz modre v vijolično. Sprememba barve se je ohranila